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Name : SO_0827 (SO_0827) Accession : NP_716458.1 Strain : Shewanella oneidensis MR-1 Genome accession: NC_004347 Putative virulence/resistance : Unknown Product : lactate transport protein LctP family Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 844169 - 845806 bp Length : 1638 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGACTTGGACCCAAACATATACGCCACTCGGTAGCTTGTGGCTCACCGCAATCGTGGCTTTACTGCCTATTGTGTTTTT CTTTCTCGCTTTGACGGTGTTAAAACTGAAAGGTCATATTGCCGGAGCATTAACCTTATTAATTGCCTTAGCAGTAGCGA TCATCACTTACAAAATGCCTGTAAGTATAGCATTAGCTTCAGCTATCTATGGTTTTAGCTATGGTCTCTGGCCTATTGCT TGGATTATTATCACTGCAGTGTTTTTGTATAAAATTACTGTTAAAACAGGCCAATTCGAGATTATTCGTTCTTCAGTAAT CTCTGTCACCGAAGATCAACGGTTGCAAATGCTATTGGTCGGTTTCTCATTTGGTGCCTTCCTTGAGGGGGCTGCAGGTT TTGGCGCTCCAGTTGCTATTACAGCTGCGTTACTCGTGGGACTTGGGTTTAATCCATTGTATGCAGCAGGACTGTGCTTA ATCGCAAATACGGCGCCAGTAGCCTTCGGAGCCATGGGTATCCCTATTATCGTAGCGGGTCAAGTGTCATCACTAGATCC ATTCCATATTGGACAACTCGCAGGCCGTCAGTTACCGATATTATCGATTATTGTTCCCTTCTGGCTTATCGCAATGATGG ATGGTATCAGGGGAATACGTCAAACCTGGCCAGCAACGTTAGTTGCAGGTGTTTCATTTGCGGTTACCCAATTTTTGACC TCAAACTTTATCGGACCAGAATTACCCGATATTACTTCGGCGTTAGTCAGTTTAATTTGTTTAACGTTATTTTTAAAAGT TTGGCAGCCAAAAGAAATTTTCACCTTCTCAGGGATGAAACAAAGAGCTGTTACGCCTAAATCTACTTTCTCAAATGGCC AAATATTTAAAGCCTGGTCTCCATTTATTATTCTCACGGCGATTGTGACGTTATGGAGTATCAAAGATGTGCAGCTGGCA TTAAGTTTTGCCACTATCAGTATTGAAGTTCCTTACCTACATAACTTAGTTATCAAAACTGCGCCTATTGTCGCTAAGGA AACCCCTTATGCAGCAATATATAAACTTAATTTATTAGGCGCTGTTGGAACAGCAATTTTAATCGCAGCAATGATCTCAA TTGTGGTCCTTAAAATGTCAATAAGTAATGCACTGACATCCTTTAAAGACACTTTAATTGAATTAAGATTCCCGATATTG TCAATTGGATTAGTATTAGCATTTGCCTTTGTTGCAAACTATTCAGGTCTATCTTCAACCTTAGCACTCGTGCTCGCAGG CACTGGCGTAGCATTCCCCTTCTTCTCGCCATTCTTAGGTTGGTTAGGTGTATTTTTAACAGGCTCAGACACCTCATCAA ATGCCTTATTTGGTGCACTACAAGCCAATACCGCCAACCAAATCGGTGTAACACCCGAGTTATTAGTCGCAGCAAACACT ACAGGTGGTGTAACTGGCAAAATGATTTCACCTCAATCAATTGCCGTTGCCTGCGCAGCTACGGGATTGGCAGGTAAAGA ATCAGACCTTTTCCGCTTTACCCTAAAGCACAGTTTATTTTTCTGTACTTTTATTGGTGTACTGACAGTATTGCAAGCAT ACATAGTCCCTTGGACACTGGTATTTTTCACAAAATAA Protein sequence : MTWTQTYTPLGSLWLTAIVALLPIVFFFLALTVLKLKGHIAGALTLLIALAVAIITYKMPVSIALASAIYGFSYGLWPIA WIIITAVFLYKITVKTGQFEIIRSSVISVTEDQRLQMLLVGFSFGAFLEGAAGFGAPVAITAALLVGLGFNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAMGIPIIVAGQVSSLDPFHIGQLAGRQLPILSIIVPFWLIAMMDGIRGIRQTWPATLVAGVSFAVTQFLT SNFIGPELPDITSALVSLICLTLFLKVWQPKEIFTFSGMKQRAVTPKSTFSNGQIFKAWSPFIILTAIVTLWSIKDVQLA LSFATISIEVPYLHNLVIKTAPIVAKETPYAAIYKLNLLGAVGTAILIAAMISIVVLKMSISNALTSFKDTLIELRFPIL SIGLVLAFAFVANYSGLSSTLALVLAGTGVAFPFFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFGALQANTANQIGVTPELLVAANT TGGVTGKMISPQSIAVACAATGLAGKESDLFRFTLKHSLFFCTFIGVLTVLQAYIVPWTLVFFTK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-155 | 67 |
