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Name : puuP (SO_4081) Accession : NP_719611.1 Strain : Shewanella oneidensis MR-1 Genome accession: NC_004347 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putrescine uptake protein PuuP Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG0531 EC number : - Position : 4236504 - 4237835 bp Length : 1332 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGCCAACAAAAACCGGGCTTAAAGCAAAGCCTTAATCTGTGGCAGGTGGTTGTGATGGGGCTTGCGTACCTCACGCC TATGGCCGTGTTTGACACCTTCGGAATTGTCTCTGAGATCACCTCTGGCCATGTGGCCACTTCTTACTTGCTCGCATTAG CGGGGATTCTCTTTACCGCTTTTAGCTATGGTCATTTAGTGCGTAAATATCCCTATGCGGGGTCGGCTTATACCTATGCT CAAAAAAACTTTAGTCCAAATGTCGGTTTTATGGTGGGCTGGTCATCGCTACTCGATTATATGTTTATGCCGATGATCAA CATGCTACTGGCCAAAATCTACCTCACCGCTATGTTCCCTAATGTGGAACCTTGGATTTTTATCTTTGGTTTAGTCACAG TTATGACGGTACTCAACCTTAGAGGCATTGATTTAGTTGCGAATTTTAATGGGGTTATCGTATTTGCCCAGATAGCGATT ATCTTAGTGTTTATTGGCTTAATGGCCCATAGCCTGTCCCTTGGGGAAGGTGAAGGGGTGATTGCCAGCGTGCGTCCATT CTATTCGGAGCAGGTAACCTTAGCGCCGCTCTTTACCGGTGCAACCATTCTGTGTTTCTCCTTCTTAGGTTTTGATGGCT TAAGTTCGCTAAGTGAAGAAACTAAGGATGCAAAACGAGTCATCCCACGTGCTATTTTGTTGACGGCGTTGATTGGCGGG GTGATTTTTGTCAGCGTGTCCTATTTCTTGCAACTCTATTTCCCTGATATTTCTCGCTTCGAGCAGTTGGATGCCGTTTT GCCTGAGATTGCGCTCTATGTGGGCGGTAATTTATTCCAGTCTATTGTACTAGTGGCGACAACAATTGCGGTGTTAGCTT CGGGCATGGCAGCTCATGCGGGGGTGGCGCGCATCCTCTATGTGATGGGGCGCGACAATATGTTGCCCAATAAAGGCTTT GGTTATGTTCACCCTAAATGGCGTACCCCGGCATTTAACGTGGTTCTGGTGGGGTTACTGGCGCTTTCGGCGGTGTCCTT TGATTTAGAAATGGCTTTAGCCTTAGTGAACTTCGGTGCTTTAGTTGCCTTTACCTTTGTTAACCTGTCGGTGATTGTGC AGTTTTATATTAAAGAAAAACGTAATCAATCCCTTAAGGAGCATTTGCAGTATTTCGTTTTGCCCTTGTGTGGCGCGGCA ACCATTGGCGTGCTGTGGATTAACCTTGAGCCTCAGTCATTAGAACTCGGTTTAATTTGGGGAGCTGTGGGGATGCTGTA TCTGGCGCTGCGCAGCCTACGCTTGCGCAAGGCGGTAGAATTGCAGAGTTAA Protein sequence : MSQQKPGLKQSLNLWQVVVMGLAYLTPMAVFDTFGIVSEITSGHVATSYLLALAGILFTAFSYGHLVRKYPYAGSAYTYA QKNFSPNVGFMVGWSSLLDYMFMPMINMLLAKIYLTAMFPNVEPWIFIFGLVTVMTVLNLRGIDLVANFNGVIVFAQIAI ILVFIGLMAHSLSLGEGEGVIASVRPFYSEQVTLAPLFTGATILCFSFLGFDGLSSLSEETKDAKRVIPRAILLTALIGG VIFVSVSYFLQLYFPDISRFEQLDAVLPEIALYVGGNLFQSIVLVATTIAVLASGMAAHAGVARILYVMGRDNMLPNKGF GYVHPKWRTPAFNVVLVGLLALSAVSFDLEMALALVNFGALVAFTFVNLSVIVQFYIKEKRNQSLKEHLQYFVLPLCGAA TIGVLWINLEPQSLELGLIWGAVGMLYLALRSLRLRKAVELQS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AAK01507.1 | putative amino acid/amine transport protein | Not tested | PAGI-1 | Protein | 2e-70 | 44 |
