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Name : lysS (WGLp441) Accession : NP_871444.1 Strain : Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis Genome accession: NC_004344 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : - Position : 512171 - 513652 bp Length : 1482 bp Strand : + Note : Protein synthesis DNA sequence : ATGAAAAACAAAAAAGAAATTTACTATCGTAAAAAAAAATTAGAAGAAATGAGGAAAAATGAAAATATATTTCCTAATAA TTTTCGTCAAAATACTACTATAAAAAATATAAAAAAAAATTATAAAAAAAATGATAAAGAATATTTTAAAAACAATAAAA TAATAATTAGTATTGCTGGAAGAATAATATCTATCAGAGTAATGGGAAAATCTTCTTTCTTAGAAATTAGAAACATAGAA TCTAAAATACAAATATATATTTCAGAAAATAATATATCAAAAAATAAATATAAAAAAATAATAAAACAATTAGATATAGG AGATATAATTGGAGTTTTAGGTGTTTTATTTAAAACAAACACTGAAGAACTATCTGTAAAATGCAAAAAACTATATGTAT TAACTAAATCCGTTAAACCTTTCCCAAATAAATTCCAAGGATTATTAAATCAAGAAATATGTTATAGAAAAAGATATTTG GATTTAATTACAAATAAAAAATCAAGAAATACATTTAAAACTAGATCAATTATTATAAATAATATAAGAAAATTTATGAT AAAAGAAAATTTTGTAGAAGTAGAAACTCCTATGATGCATAATATACCAGGAGGAGGTTTATCTAAACCATTTATTACTC ATCACAGCTCTTTAAATATTGATTTATATTTAAGAATTGCTCCTGAGTTGTATTTAAAACAGTTGATTGTTGGAGGATTC GAAAAAATATTTGAAATTAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGATTATCGTCTAATCATAATCCAGAATTTACTATGATGGA GTTTTATGTTGCATATATTGATTATGAAGATTTAATGAAAATAGTAGAAAATTTATTAAATTATATTGTTGATAAAATTT TTAATAAAAACAAAATAAATTATAATAATTTTATGATAAATTTTGAAAAACCTTTTAAAAAAATTAGCATGCAGGACTCT ATTTGCGAATATTGTAAAAATGTAACACAATCAGATATTTCTGACATTAAAATTATCACTGATATAGCTAAATCTTTTAA TATTACGGTCGAAAAAAATTGGGGAGTGGGAAAATTGCAAGAAAAAATTTTTTCAGAAAAAGTAGAAAAAAATTTAATTC AACCAACTTTTGTTATAGATTATCCAACAGAGATTTCACCACTGGCTCGTGCAAAAAAAAATAATAAACTTATAACGGAT AGATTTGAATTATTTGTATGTGGTAATGAAATTGGAAATGGATTTTCAGAATTGAATGATCCAAAAGAACAAAAAAATAG ATTTTTAGAACAGTTAAAAAATAAAACCTTAGAAGAACAAAACATTTTCTATGACAAAGATTATATAACATCTTTAGAGT ATGGATTACCTCCTACAGCTGGATGTGGTATTGGAATTGACAGATTAGTTATGATATTAACTAATAATTACAGCATTAAA GACGTAATACTTTTCCCAACATTACGTAATGCTAATAAATAA Protein sequence : MKNKKEIYYRKKKLEEMRKNENIFPNNFRQNTTIKNIKKNYKKNDKEYFKNNKIIISIAGRIISIRVMGKSSFLEIRNIE SKIQIYISENNISKNKYKKIIKQLDIGDIIGVLGVLFKTNTEELSVKCKKLYVLTKSVKPFPNKFQGLLNQEICYRKRYL DLITNKKSRNTFKTRSIIINNIRKFMIKENFVEVETPMMHNIPGGGLSKPFITHHSSLNIDLYLRIAPELYLKQLIVGGF EKIFEINRNFRNEGLSSNHNPEFTMMEFYVAYIDYEDLMKIVENLLNYIVDKIFNKNKINYNNFMINFEKPFKKISMQDS ICEYCKNVTQSDISDIKIITDIAKSFNITVEKNWGVGKLQEKIFSEKVEKNLIQPTFVIDYPTEISPLARAKKNNKLITD RFELFVCGNEIGNGFSELNDPKEQKNRFLEQLKNKTLEEQNIFYDKDYITSLEYGLPPTAGCGIGIDRLVMILTNNYSIK DVILFPTLRNANK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 4e-110 | 54 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | NP_871444.1 | hypothetical protein | VFG1668 | Protein | 2e-110 | 54 |
