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Name : nrdE-1 (SAG0420) Accession : NP_687454.1 Strain : Streptococcus agalactiae 2603V/R Genome accession: NC_004116 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 434233 - 436398 bp Length : 2166 bp Strand : + Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : ATGACACAATCAGATGCATATCTCTCGTTGAACGCGAAGACACGCTTTAGAGATCGCACAGGTAATTATCATTTTACTTC GGATAAAGAGGCTGTTGAACAATATATGATAGAACATGTTGAACCTAATACGATGGTGTTCACATCACTAATTGAAAAGC TAGATTATTTGGTTTCTAATAACTACTATGAATCGGACCTTCTAAAACAATATAACCTTGAGTTTATTTGCCAAATTTTT GAGCATGCATACGCTAAGAAATTTGCTTTTCTAAATTTTATGGGGGCTTTAAAATTTTATAATGCTTATGCTCTTAAAAC AGAAGACAATCGTTATTATTTGGAACACTATGAAGATCGTGTTGTAATGAATGCTCTGTTTTTAGCTGCTGGTGATGAAA AAGCTGCCTATGACCTAGTAGATGACATGCTAGCAAATCGCTTTCAACCAGCAACACCTACCTTTTTAAATGCAGGGAAA AAACGTCGTGGTGAATATATCTCTTGCTATTTGTTGCGCATTGAAGACAATATGGAATCTATTTCTCGTGCTATTAGTAC AAGCCTTCAGTTATCAAAACGAGGTGGTGGGGTAGCACTTTGCTTAACCAACTTACGGGAATTTGGTGCTCCAATAAAAG GTATTAAAAATCAAGCTACTGGTATTGTACCTGTCATGAAATTACTAGAAGATTCGTTTTCTTACGCCAATCAATTAGGA CAAAGACAAGGAGCTGGTGCAGTTTACTTACACGCTCACCATCCTGAAGTATTAACGTTTTTAGATACTAAACGTGAGAA TGCCGATGAGAAAATTCGAATTAAATCTCTTTCCCTAGGACTTGTTATTCCTGATATTACTTTTGAATTGGCTAAGGCAA ATAAAGATATGGCCTTGTTTTCACCGTATGACATTGAGCGAGTATATGGTAAACCAATGTCTGATATCTCTATCACAGAA GAATATGAAACTTTATTAGCCAATGCGGATATTCGTAAAACCTTTATTAGTGCACGAAAACTATTTCAAACGATAGCAGA GCTTCATTTTGAATCTGGTTATCCTTATATCTTATTTGAAGATACTGTAAATGCTAAAAACCCTCACAAAAAAGAGGGAC GAATTGTTATGTCTAATTTATGTTCTGAGATTGCACAAGTTAATACAGCTAGTCAATTTTCAGAAGACCTGACTTTCACT AAGGTTGGACATGATGTTTGTTGTAATTTAGGTTCTATTAATATTGCGCGTGCTATGGATCAAGCGGCGGATTTTGAAAA ATTAATTGCTAATAGCATTAGAGCCCTTGATCGTGTATCTCGAACTTCTGATTTAGATAGTGCTCCATCTATTAAAAAAG GTAATGCAGCTAATCATGCTGTTGGTTTAGGTGCTATGAATTTGCATGGATTTTTGGCGACTAACCATATTTATTACGAT TCTCAAGAGGCTATTGATTTTACAGATTGCTTCTTTTACGCTATGGCTTATTATGCCTTTAAAGCTTCTAACCATTTAGC AAAAGAAAAAGGAACCTTTGAGGGCTTCTCGGAATCAAGTTATGCTGATGGCAGTTATTTCTATCAATATACCGAACAAA ACTTTGAGCCAAAAACACAGCGTGTTAAAAATCTACTAGCTGAGTATGGTCTGACTCTACCAAGCCAAGAGGATTGGAGA AAGCTTGTGCAAAGTATTAAAGAGATAGGATTAGCTAATGCGCATTTATTAGCTGTTGCTCCGACAGGGTCAATCAGTTA TCTTTCTTCTTGTACTCCGAGCCTTCAACCGGTTGTATCACCTGTCGAAGTACGCAAGGAAGGAGCACTGGGGAGGGTTT ATGTACCTGCTTATAAGATTGATGCAGATAATTATGTCTACTACAAAAAAGGAGCTTATGAAGTGGGATCTGAGGCGATT ATCAATATTGCAGCTGCCGCTCAAAAACACATTGATCAAGCTATTTCGTTAACGCTTTTCATGACAGATCAAGCAACTAC GCGAGATTTAAATAAAGCCTATATTCAAGCATTTAAACAAAAATGTGCCTCTATTTATTATGTACGAGTGAGACAGGACA TCCTAGAAGGTAGCGAGAGTTATGATGATATGCTGGATGATTTCACTTCATCGGACTTAGAAGACTGTCAATCCTGCATG ATTTAA Protein sequence : MTQSDAYLSLNAKTRFRDRTGNYHFTSDKEAVEQYMIEHVEPNTMVFTSLIEKLDYLVSNNYYESDLLKQYNLEFICQIF EHAYAKKFAFLNFMGALKFYNAYALKTEDNRYYLEHYEDRVVMNALFLAAGDEKAAYDLVDDMLANRFQPATPTFLNAGK KRRGEYISCYLLRIEDNMESISRAISTSLQLSKRGGGVALCLTNLREFGAPIKGIKNQATGIVPVMKLLEDSFSYANQLG QRQGAGAVYLHAHHPEVLTFLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELAKANKDMALFSPYDIERVYGKPMSDISITE EYETLLANADIRKTFISARKLFQTIAELHFESGYPYILFEDTVNAKNPHKKEGRIVMSNLCSEIAQVNTASQFSEDLTFT KVGHDVCCNLGSINIARAMDQAADFEKLIANSIRALDRVSRTSDLDSAPSIKKGNAANHAVGLGAMNLHGFLATNHIYYD SQEAIDFTDCFFYAMAYYAFKASNHLAKEKGTFEGFSESSYADGSYFYQYTEQNFEPKTQRVKNLLAEYGLTLPSQEDWR KLVQSIKEIGLANAHLLAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSPVEVRKEGALGRVYVPAYKIDADNYVYYKKGAYEVGSEAI INIAAAAQKHIDQAISLTLFMTDQATTRDLNKAYIQAFKQKCASIYYVRVRQDILEGSESYDDMLDDFTSSDLEDCQSCM I |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 57 |
