Gene Information

Name : SAG2001 (SAG2001)
Accession : NP_688988.1
Strain : Streptococcus agalactiae 2603V/R
Genome accession: NC_004116
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : conjugal transfer protein, interruption-C
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG0433
EC number : -
Position : 1980913 - 1983183 bp
Length : 2271 bp
Strand : -
Note : This gene is interrupted by an IS1381 element.

DNA sequence :
ATGTCGGATTTTGAAGCGGATCTAGCAGATGATGTTAAAGAATTAGGGTTAGAAACACTCGATTTTACAGTTGATACGTT
AACACATGAAATGGAGATACCGTATCAGTTTGATTGGTTAATTGGAGTTGATCTTGGTAAAGGGCAATACAATGCTAATA
TAAAAGAATTTATTTATAATCAGTTTGAATCTATCGCATCAAACTTCGCTTCTTTAGCTGGTTATGAGGTAGAAGTAGAT
GAAGATTGGTATAAAGAACATTCAGAAGAAGAATTACTTGTCTATAGTTTATTGTCTACCCTGAAAGCCAAAAGATTAAC
GGATGTTGATTTATTTTATTATCAACGGATGCAATTTTTAAGATATGTTCCCCATACTAAAAGTGAGGTTATAGCTAATC
GGAATATGTTAAATGTGACAGATACGTTGATTAAATCACTAGAAGGTGGTTTTTTAAAATTGGAGAGTGCTTATGGGAGT
TCATTTGTATCCGTTCTTCCAGTAGGTCGGTTCTCTACCATATTTAATGGCTTTCATCTTGGTGAACTAGTTCAAAGAAT
GAGTTTTCCGGTTGAATTAAGATTTAAAGCGGAATTTATAGATAAGACAAAATTGGGTGGCACTATGGGTCGCTCAAATA
CACGCTATGATCAAATCATGAAAGAAGCTTATAACACAAATACGGTTCAACAAGATGATATCTTGATGGGAGCATATTCG
CTTAAGGATCTTATGAAAAAAGTTGGAAATAAGGAAGAAATCATAGAGTATGGTTGTTATTTGGTAGTTGCTGGTTCTAG
TTTAAATCAACTAAAACAACGTAGATATGCCATTTTAAGTTACTTTGATGATATGAAAGTCAATGTTTATGAAGCCAGTC
ATGATACACCATATTTATTTCAAGCGTTACTTTATGGTCAAGATTTACAAAAAACAACTCGTAAGTGGAATCATTTAGTA
ACTGCTCGAGGTTTTTCGGAGTTGATGCTTTTTACAAATACCCAATCAGGTAACAGGATTGGTTGGTATATTGGACGAGT
AGATAATCGTTTAACTGCTTGGGATTCTATTGACGAAGCTATTATGGGATCTAAAAATCTTGTCTTATTTAATGCGACAG
TCGCGAATAAAGAAGATGTTGCTGGTAAGGTTACTAAAAATCCTCACGTGATTATAACTGGGGCGACAGGTCAAGGGAAA
TCATACTTAGCACAGATGATCTTTTTACATACTGCTCAACAAAATGTTCGTGTCCTTTATGTTGACCCTAAACGAGAACT
ACGGCAACACTATTTAAAAGTTGTTTCTGATCCAGAGTATGCACGTAAGTTTCCTCTACGTAAGAAGCAAATTGAGGAAA
CGAATTTTGTCACTCTTGATAGTTCTGTCAAAGAAAATCATGGTGTATTAGATCCTATTGTTATTCTTGATAAGGAAGGT
GCTTCCTCAACGGCTAAAAATATGTTGCTTTATTTGTTAAAAAACGCTACAGAGATTAAATTAGATCAAACAACAGCTTT
AACAGAAGCAATTAGTCAAGTCATTGCAAAACGTGAAGCTGGTGAAGTCGTTGGTTTTAATCAGGTTATTGAAGTTCTTA
TTGATTCTGAAAGTGATGAAGTTCAGTCAGTTGGTCGTTATTTTAAAGCTATTATTCAGAATTCTATTTTAGAGTTGGCA
TTTTCAGATGGTGATGTTGCTGGTCTTTCTTACGAAGAACGTGTGACAGTTTTAGAAGTTGCGGATTTATCATTGCCTAA
GGACGGTTCAGATCATATATCTGATCATGAAAGTAATTCGATTGCTTTAATGTTTGCTTTAGGTGCGTTTTGTAAGCATT
TTGGTGAGCGTAGTGATGATGAAACAGTTGAAATTTTTGATGAAGCATGGGTACTTATGCAATCCTCAGAAGGTAAGGCT
GTTATCAAGTCTATGCGTCGTGTTGGTCGCTCTAAGTATAATGTGTTGATGCTAGTATCTCAATCGGTTCATGATGCAGA
AAACGATGATGATACGACCGGCTTTGGGACAATTTTTTCATTTTATGAAAAATCGGAACGTGAAGATATTTTAAGTCATG
TTGGTTTAGAAGTAACACCTAAGAATCTAGAATGGATTGATAATATGATTTCAGGTCAATGTCTTTATTATGATGTTTAC
GGTAACTTGAATATGATTTCGATACATAACATTCATCCAGATATTGATCCATTGTTAAAACCTATGAAGAAAACAGTATC
AAGTCACCTTGAAAATAAATATGCTTCGTAG

Protein sequence :
MSDFEADLADDVKELGLETLDFTVDTLTHEMEIPYQFDWLIGVDLGKGQYNANIKEFIYNQFESIASNFASLAGYEVEVD
EDWYKEHSEEELLVYSLLSTLKAKRLTDVDLFYYQRMQFLRYVPHTKSEVIANRNMLNVTDTLIKSLEGGFLKLESAYGS
SFVSVLPVGRFSTIFNGFHLGELVQRMSFPVELRFKAEFIDKTKLGGTMGRSNTRYDQIMKEAYNTNTVQQDDILMGAYS
LKDLMKKVGNKEEIIEYGCYLVVAGSSLNQLKQRRYAILSYFDDMKVNVYEASHDTPYLFQALLYGQDLQKTTRKWNHLV
TARGFSELMLFTNTQSGNRIGWYIGRVDNRLTAWDSIDEAIMGSKNLVLFNATVANKEDVAGKVTKNPHVIITGATGQGK
SYLAQMIFLHTAQQNVRVLYVDPKRELRQHYLKVVSDPEYARKFPLRKKQIEETNFVTLDSSVKENHGVLDPIVILDKEG
ASSTAKNMLLYLLKNATEIKLDQTTALTEAISQVIAKREAGEVVGFNQVIEVLIDSESDEVQSVGRYFKAIIQNSILELA
FSDGDVAGLSYEERVTVLEVADLSLPKDGSDHISDHESNSIALMFALGAFCKHFGERSDDETVEIFDEAWVLMQSSEGKA
VIKSMRRVGRSKYNVLMLVSQSVHDAENDDDTTGFGTIFSFYEKSEREDILSHVGLEVTPKNLEWIDNMISGQCLYYDVY
GNLNMISIHNIHPDIDPLLKPMKKTVSSHLENKYAS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
M28_Spy1311 YP_280776.1 DNA segregation ATPase related protein Not tested RD2 Protein 0.0 84
Spaf_1842 YP_006310608.1 DNA segregation ATPase Not tested FWisland_2 Protein 0.0 68