Name : SAG2001 (SAG2001) Accession : NP_688988.1 Strain : Streptococcus agalactiae 2603V/R Genome accession: NC_004116 Putative virulence/resistance : Unknown Product : conjugal transfer protein, interruption-C Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG0433 EC number : - Position : 1980913 - 1983183 bp Length : 2271 bp Strand : - Note : This gene is interrupted by an IS1381 element. DNA sequence : ATGTCGGATTTTGAAGCGGATCTAGCAGATGATGTTAAAGAATTAGGGTTAGAAACACTCGATTTTACAGTTGATACGTT AACACATGAAATGGAGATACCGTATCAGTTTGATTGGTTAATTGGAGTTGATCTTGGTAAAGGGCAATACAATGCTAATA TAAAAGAATTTATTTATAATCAGTTTGAATCTATCGCATCAAACTTCGCTTCTTTAGCTGGTTATGAGGTAGAAGTAGAT GAAGATTGGTATAAAGAACATTCAGAAGAAGAATTACTTGTCTATAGTTTATTGTCTACCCTGAAAGCCAAAAGATTAAC GGATGTTGATTTATTTTATTATCAACGGATGCAATTTTTAAGATATGTTCCCCATACTAAAAGTGAGGTTATAGCTAATC GGAATATGTTAAATGTGACAGATACGTTGATTAAATCACTAGAAGGTGGTTTTTTAAAATTGGAGAGTGCTTATGGGAGT TCATTTGTATCCGTTCTTCCAGTAGGTCGGTTCTCTACCATATTTAATGGCTTTCATCTTGGTGAACTAGTTCAAAGAAT GAGTTTTCCGGTTGAATTAAGATTTAAAGCGGAATTTATAGATAAGACAAAATTGGGTGGCACTATGGGTCGCTCAAATA CACGCTATGATCAAATCATGAAAGAAGCTTATAACACAAATACGGTTCAACAAGATGATATCTTGATGGGAGCATATTCG CTTAAGGATCTTATGAAAAAAGTTGGAAATAAGGAAGAAATCATAGAGTATGGTTGTTATTTGGTAGTTGCTGGTTCTAG TTTAAATCAACTAAAACAACGTAGATATGCCATTTTAAGTTACTTTGATGATATGAAAGTCAATGTTTATGAAGCCAGTC ATGATACACCATATTTATTTCAAGCGTTACTTTATGGTCAAGATTTACAAAAAACAACTCGTAAGTGGAATCATTTAGTA ACTGCTCGAGGTTTTTCGGAGTTGATGCTTTTTACAAATACCCAATCAGGTAACAGGATTGGTTGGTATATTGGACGAGT AGATAATCGTTTAACTGCTTGGGATTCTATTGACGAAGCTATTATGGGATCTAAAAATCTTGTCTTATTTAATGCGACAG TCGCGAATAAAGAAGATGTTGCTGGTAAGGTTACTAAAAATCCTCACGTGATTATAACTGGGGCGACAGGTCAAGGGAAA TCATACTTAGCACAGATGATCTTTTTACATACTGCTCAACAAAATGTTCGTGTCCTTTATGTTGACCCTAAACGAGAACT ACGGCAACACTATTTAAAAGTTGTTTCTGATCCAGAGTATGCACGTAAGTTTCCTCTACGTAAGAAGCAAATTGAGGAAA CGAATTTTGTCACTCTTGATAGTTCTGTCAAAGAAAATCATGGTGTATTAGATCCTATTGTTATTCTTGATAAGGAAGGT GCTTCCTCAACGGCTAAAAATATGTTGCTTTATTTGTTAAAAAACGCTACAGAGATTAAATTAGATCAAACAACAGCTTT AACAGAAGCAATTAGTCAAGTCATTGCAAAACGTGAAGCTGGTGAAGTCGTTGGTTTTAATCAGGTTATTGAAGTTCTTA TTGATTCTGAAAGTGATGAAGTTCAGTCAGTTGGTCGTTATTTTAAAGCTATTATTCAGAATTCTATTTTAGAGTTGGCA TTTTCAGATGGTGATGTTGCTGGTCTTTCTTACGAAGAACGTGTGACAGTTTTAGAAGTTGCGGATTTATCATTGCCTAA GGACGGTTCAGATCATATATCTGATCATGAAAGTAATTCGATTGCTTTAATGTTTGCTTTAGGTGCGTTTTGTAAGCATT TTGGTGAGCGTAGTGATGATGAAACAGTTGAAATTTTTGATGAAGCATGGGTACTTATGCAATCCTCAGAAGGTAAGGCT GTTATCAAGTCTATGCGTCGTGTTGGTCGCTCTAAGTATAATGTGTTGATGCTAGTATCTCAATCGGTTCATGATGCAGA AAACGATGATGATACGACCGGCTTTGGGACAATTTTTTCATTTTATGAAAAATCGGAACGTGAAGATATTTTAAGTCATG TTGGTTTAGAAGTAACACCTAAGAATCTAGAATGGATTGATAATATGATTTCAGGTCAATGTCTTTATTATGATGTTTAC GGTAACTTGAATATGATTTCGATACATAACATTCATCCAGATATTGATCCATTGTTAAAACCTATGAAGAAAACAGTATC AAGTCACCTTGAAAATAAATATGCTTCGTAG Protein sequence : MSDFEADLADDVKELGLETLDFTVDTLTHEMEIPYQFDWLIGVDLGKGQYNANIKEFIYNQFESIASNFASLAGYEVEVD EDWYKEHSEEELLVYSLLSTLKAKRLTDVDLFYYQRMQFLRYVPHTKSEVIANRNMLNVTDTLIKSLEGGFLKLESAYGS SFVSVLPVGRFSTIFNGFHLGELVQRMSFPVELRFKAEFIDKTKLGGTMGRSNTRYDQIMKEAYNTNTVQQDDILMGAYS LKDLMKKVGNKEEIIEYGCYLVVAGSSLNQLKQRRYAILSYFDDMKVNVYEASHDTPYLFQALLYGQDLQKTTRKWNHLV TARGFSELMLFTNTQSGNRIGWYIGRVDNRLTAWDSIDEAIMGSKNLVLFNATVANKEDVAGKVTKNPHVIITGATGQGK SYLAQMIFLHTAQQNVRVLYVDPKRELRQHYLKVVSDPEYARKFPLRKKQIEETNFVTLDSSVKENHGVLDPIVILDKEG ASSTAKNMLLYLLKNATEIKLDQTTALTEAISQVIAKREAGEVVGFNQVIEVLIDSESDEVQSVGRYFKAIIQNSILELA FSDGDVAGLSYEERVTVLEVADLSLPKDGSDHISDHESNSIALMFALGAFCKHFGERSDDETVEIFDEAWVLMQSSEGKA VIKSMRRVGRSKYNVLMLVSQSVHDAENDDDTTGFGTIFSFYEKSEREDILSHVGLEVTPKNLEWIDNMISGQCLYYDVY GNLNMISIHNIHPDIDPLLKPMKKTVSSHLENKYAS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
M28_Spy1311 | YP_280776.1 | DNA segregation ATPase related protein | Not tested | RD2 | Protein | 0.0 | 84 |
Spaf_1842 | YP_006310608.1 | DNA segregation ATPase | Not tested | FWisland_2 | Protein | 0.0 | 68 |