|
Name : SAG1796 (SAG1796) Accession : NP_688786.1 Strain : Streptococcus agalactiae 2603V/R Genome accession: NC_004116 Putative virulence/resistance : Unknown Product : amino acid ABC transporter permease Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 1789082 - 1790809 bp Length : 1728 bp Strand : - Note : identified by match to PFAM protein family HMM PF00528 DNA sequence : TTGGAAAATTTATTACAACATAAGTTACCGGTCGCACCATTTGTAGAGTCAACGACCAATTGGATTACGAAAACTTTTTC TGGTTTATTTGACTTTATCCAGACAATCGGTAATGCATTGATGGATTGGATGACAAAAACATTACTATTCATTAATCCTT TACTTTTTATTGTACTAATTACAATTGCTGTATTTTTCTTAGCTAAGAAAAAATGGCAATTACCGACATTTACTTTCATT GGTTTGCTATTTATCTATAACCAAGGGCTGTGGGAACAGTTGATTAATACTTTTAACTTGGTTTTAGTAGCAAGTTTAAT TTCTATTATTATTGGTGTACCACTAGGTATTTGGATGGCAAAAAGTGATAAAGTTAAACAAGTTGTTAATCCAATTCTTG ACTTTATGCAAACTATGCCGGCATTCGTTTACCTTATTCCTGCAGTAGCCTTCTTTGGTATCGGTATGGTACCAGGTGTC TTTGCCTCTGTTGTATTTGCTCTGCCTCCAACAGTGCGCTTTACTAACTTGGCTATTCGTGAAATCCCACTTGAATTAAT AGAAGCATCTGATTCATTTGGTTCAACAGTTAAGCAAAAATTATTCAAAGTTGAACTACCACTTGCTAAGAACACTATTA TGGCAGGAATCAATCAAACTATGATGTTGGCTCTTTCTATGGTGGTTACAGGATCTATGATCGGTGCACCTGGACTTGGT CGTGAGGTGTTATCGGCGCTTCAACATGCTGATATTGGTACAGGATTTGTTAGTGGTCTATCGCTAGTTATTTTAGCAAT CGTGTTAGACCGTGTTAGTCAATTCTTTAATTCCAAACCGGGTGAGAAGCAAGCTAAAACATCAAAAGTTAAAAAATGGG TAGGTTTAGGGGCCCTGGCTCTCTTCATTCTAGCAGCTCTTGGTCGCATTGTTGTCAATATGACTTCAGGAAATGAAGCC AAAGGTCAAAAAGTGAAGATAGCTTATGTCCAATGGGATTCAGAAGTTGCTTCAACCAACGTTATTGCTGAAGTTTTAAA ATCTAAAGGATATGATGTTGAATTGACACCACTTGACAATGCGGTCATGTGGCAAACAGTCGCCAATGGGAATGCTGATT TTACAACAAGTGCTTGGTTACCAAAGACCCACGGGCAATATTTTAATAAATACAAAAATAGTTTAGATGACTTAGGTCCT CACGTTGAGAACGTCAAAATAGGTTTAGTTGTTCCTAAATACATGAACGTAAATAGTATTGAAGAATTATCAAATCAAGC AGATAAACAAATTACAGGTATCGAACCAGGTGCAGGTATTATGAAGTCTGCTAAACAATCCCTTAAAGATTATCCAAACC TTTCAAGTTGGAAGTTGTTATCAGCATCAACAGGAGCTATGACAACAACCTTAGGGAAGGCTATCAAAAACAAAGATCAA GTAGTCATTACAGGTTGGTCACCTCACTGGATGTTTGCTAAGTATGATTTAAAATACCTTAAAGATCCTAAGAAATCATT TGGTGGTGAAGAACATATCAATACAATAGCACGCAAGAATTTGAAAAAAGATATGCCAAAAGTATATAAAATTATCGATA AGTTCAAGTGGACTAAAGAAGATATGGAATCTATCATGTTAGATATGGATAAAGGTATGGAGCCTGCTAAAGCAGCTCAA AAATGGATTAAAAACCACAAAAAAGAAGTTTCAGAGTGGACTAAATAG Protein sequence : MENLLQHKLPVAPFVESTTNWITKTFSGLFDFIQTIGNALMDWMTKTLLFINPLLFIVLITIAVFFLAKKKWQLPTFTFI GLLFIYNQGLWEQLINTFNLVLVASLISIIIGVPLGIWMAKSDKVKQVVNPILDFMQTMPAFVYLIPAVAFFGIGMVPGV FASVVFALPPTVRFTNLAIREIPLELIEASDSFGSTVKQKLFKVELPLAKNTIMAGINQTMMLALSMVVTGSMIGAPGLG REVLSALQHADIGTGFVSGLSLVILAIVLDRVSQFFNSKPGEKQAKTSKVKKWVGLGALALFILAALGRIVVNMTSGNEA KGQKVKIAYVQWDSEVASTNVIAEVLKSKGYDVELTPLDNAVMWQTVANGNADFTTSAWLPKTHGQYFNKYKNSLDDLGP HVENVKIGLVVPKYMNVNSIEELSNQADKQITGIEPGAGIMKSAKQSLKDYPNLSSWKLLSASTGAMTTTLGKAIKNKDQ VVITGWSPHWMFAKYDLKYLKDPKKSFGGEEHINTIARKNLKKDMPKVYKIIDKFKWTKEDMESIMLDMDKGMEPAKAAQ KWIKNHKKEVSEWTK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 77 |
