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Name : mutS (BUsg414) Accession : NP_660748.1 Strain : Buchnera aphidicola Sg Genome accession: NC_004061 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0249 EC number : - Position : 467567 - 469984 bp Length : 2418 bp Strand : - Note : This protein performs the mismatch recognition step during the DNA repair process DNA sequence : ATGACTGAAACTAATTTTTCTACTAAAAATAGTAATCATACTCCAATGATCAAACAGTATTTATCTTTAAAATCACAATA TCCTAATATGCTTCTTTTTTATCAAATGGGTGATTTTTATGAATTATTTTACGAAGATGCCAAACGCGTTTCTAGATTAT TAAAAATTACTTTAACCAAAAAAGGCAATTCAAATAACAATATTATTCCTATGGCTGGAGTGCCATGTCATACTGCAGAG TATTATCTCTCTAAACTTGTAAAAATGGGAGAATCTATTGCAGTATGTGATCAAATAAAAGATGTTTATTCTGAAAAAAA ATTGCTAACTCGTCAAGTAGTTCGAGTTATTACTCCTGGTACTATTACAGATGAAGCATTTCTTGAAGAAAACAAAGATA ATTTTATTGCAGCGGTTTGGAAAGAAAATAATAAATTTGCATATGCTATTTTAGATATTTCTTTGGGATTTTTTGGTGTT TCTGAACATTTCGATAGAAATTCTTTATTATCAGAAATTGAACGTACAAATCCTACAGAATTATTATATCCTGAAAATTT CGAAGATATGTTATTGATATCTCATAAGAAATGCATACAAAAACGTCCATTATTAGATTTTGATATAAAAATTTCATATA AGTTACTAACTTTACAGTTTAAAACCTCTAATTTGAATGGATTTGGTATTAAGAAAAATCATTTTGTTATTCGCCCTGCT GGTTGTTTAATTAATTATATCAAATTGATGCATATATCATTTTTACCTCATATTCGTAAAATACAATTTAATTATATAGA AAATAATATTTTTATGAATTCGAGTACACGTAAAAGCCTTGAAATCATTGAAAGTATTTCTGGTGAAAGTAAAAATACTC TATCTTCAGTATTAAATAAAACAGTCACATCTATGGGTGGAAGATTATTAAATCGCTGGTTAAATACTCCTTCAAAAGAT TTAAGTTTAATTAAAAATCGTCATGGAATGGTAAAACTTTTACGACCTTTTTATAAAGAAATACAATGTATTCTTCGTCA AGTGAGTGATCTCGAAAGAATATGTTCACGTTTAGCTTTACGTACTGCCTTACCCCGTGATTTTGTCCGAATGCGTTCGA CATTAAATATTTTACCTGATTTATGTTTAATATTAAAAAAAATAAAATCGACTAGCATTAATAATGTTCTCATGTCTATT GGAAAATTTGAAAAAATATTATTTTTGCTGAAAAAATCGATAAATTTAACAGTTCCTTCTTCTATTCGAGATGGAGGTGT AATAGCATGTAATTATAATAAAAAACTTGATGAATTACGCTCTTTAAAAAAAAATTCTCAAAAATATTTACAAGACTTTG AAGTAAAAGAAAAAAGTAGATTAAATATTGATTCATTTAAAATCGGATACAACAATATCGTCGGTTATTATATTCAAGTT AACAAACGTCATTCTCATTTAATTCCGCATTCTTATCTTAAGATACAAACTTTAAAAAATGTAGAACGATATAGTGTTCC TCTATTAAAAAATTATGAAAAACAAGTTATTAGTGCTAAATTTCAAGCTATTTTTTTAGAAAAAACGCTATATATGGAAT TATTTGATATAATCGAACCGTTTTTAGAAGACTTAAAAAATAGTGCATTTGCATTGTCGGAATTAGATGTTTTAGTCAAT TTATCTGAACGTTCTATATCTTTAAATTATGTTTGTCCTAAAATGACTAAAAAATATGGTATTACCTTGGTAGAAAGTCG TCATCCAGTTGTTGAATGTTTTTTAGAAAATCCCTTTATTAGTAATTCTGTTGATTTATCAAAAAAAAATAGAATGCTTA TTATTACAGGCCCTAATATGGGTGGTAAAAGTACTTATATGCGTCAAGTTGCACTTATTATTATTATGGCTTGTATAGGT AGTTTTGTACCTGCAAAGTATGCTTCTATTGGTTTGATTGATAAAATTTTTACACGTATTGGTTCTGCAGATGATGTTAG TAATGGTTATTCAACTTTCATGATGGAAATGACAGAAATATCTAATATTCTTCATAATGCAACTTGCAATAGTTTAATTT TAATAGATGAATTAGGACGAGGAACATCAAATAAAGATGGATTAGCATTAGCTTGGTCATGTTCTAAATATTTAATGACT AAAAATAAATCTATGATTTTATTATCGACTCATTTTATTGAATTAACAAAATTAGAAAATTTTTTTAAAAATATAAAAAA TTTTTATTTTTCTGCTTTTGAACATGATTCAAATATAGCTTTTTTATATAAAATTAAAAAAGGAATTTCAAAAAAAAGTT ACGGTATAGCAGTAGCTTCTTTATCTGGGATTCCAGATATTGTAATACAAGATGCAAAAAAGAAATTAATTGAATTAGAA AGTGATAATGTTTTTTAA Protein sequence : MTETNFSTKNSNHTPMIKQYLSLKSQYPNMLLFYQMGDFYELFYEDAKRVSRLLKITLTKKGNSNNNIIPMAGVPCHTAE YYLSKLVKMGESIAVCDQIKDVYSEKKLLTRQVVRVITPGTITDEAFLEENKDNFIAAVWKENNKFAYAILDISLGFFGV SEHFDRNSLLSEIERTNPTELLYPENFEDMLLISHKKCIQKRPLLDFDIKISYKLLTLQFKTSNLNGFGIKKNHFVIRPA GCLINYIKLMHISFLPHIRKIQFNYIENNIFMNSSTRKSLEIIESISGESKNTLSSVLNKTVTSMGGRLLNRWLNTPSKD LSLIKNRHGMVKLLRPFYKEIQCILRQVSDLERICSRLALRTALPRDFVRMRSTLNILPDLCLILKKIKSTSINNVLMSI GKFEKILFLLKKSINLTVPSSIRDGGVIACNYNKKLDELRSLKKNSQKYLQDFEVKEKSRLNIDSFKIGYNNIVGYYIQV NKRHSHLIPHSYLKIQTLKNVERYSVPLLKNYEKQVISAKFQAIFLEKTLYMELFDIIEPFLEDLKNSAFALSELDVLVN LSERSISLNYVCPKMTKKYGITLVESRHPVVECFLENPFISNSVDLSKKNRMLIITGPNMGGKSTYMRQVALIIIMACIG SFVPAKYASIGLIDKIFTRIGSADDVSNGYSTFMMEMTEISNILHNATCNSLILIDELGRGTSNKDGLALAWSCSKYLMT KNKSMILLSTHFIELTKLENFFKNIKNFYFSAFEHDSNIAFLYKIKKGISKKSYGIAVASLSGIPDIVIQDAKKKLIELE SDNVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 0.0 | 49 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | NP_660748.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 0.0 | 51 |
