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Name : MW2352 (MW2352) Accession : NP_647169.1 Strain : Staphylococcus aureus MW2 Genome accession: NC_003923 Putative virulence/resistance : Resistance Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG1132 EC number : - Position : 2502396 - 2504159 bp Length : 1764 bp Strand : - Note : hypothetical protein, similar to lipoprotein inner membrane ABC-transporter DNA sequence : ATGAACAATCAGACAAATTGGATAAAGATACTCAGCGGATTTGCTTCTGATAGTAAATGGAAAATTATGTTATCAATTTT GTTGTCTATCATCAGTGTCTTTTCTGGATTAGTTCCATATTGGGCAGTCTTTAAAATTATTTTAATGATGATTAACAATG CATATACGATTAATTCGATTATGGTTTATATCTTTATTGCTTTAATCGCTTATATTTCACAAGTGTGTTGTTTTGGAGCG TCAACGATGCTATCACATATTACGGCATATGAAATTTTATCTGAAATTCGTAAAAAATTAGCTCAAAAATTAATGCGTCT CCCTTTAGGCGTAGTGGAATCTAAGAAAATAGGTGAATTAAAAAATATATTTGTCGATAAGGTTGAAACAATAGAATTAC CTTTAGCACATATGATTCCTGAAGTTATAGGAAACTTACTTTTGTCAGCTGCTATCTTTTTATACATAATGCTCATTGAT TGGCGTATGGCTAGTGCCTTATTAGTAACGATACCAATTTCAATTTTCGCTTTTAAAAAAGTTATGTCTGGATTTAATGA GACATATGCTGAACAAATGAAATCGAATAATTATATGAATAGCGCGATTGTAGAGTTTATCGAAGGCATTGAAGTGATTA AAACATTTAATCAATCTCAAAGTTCATATAAAAAATATAAAGATGCAGTAGATAATTATAAGATTCACACTTTGAATTGG TTTAAAAATACATGGGGGTATATGAATTTAGGAGCTAGTGTATTACCTTCAACATTTTTAGGGATTTTACCGGTCGGCAT GTATTTGATATCTATCAACCAATTAAACTATGCGGAATTTTTCCTATGCATCGTATTATCTTTAGGTGTAGTAGCACCGA TTAAGAATTTTACTAATTATGTAAATCATTTAAAGTCTATACAATACGCATTAACTGAAGTGAATCAAATATTAAGTCTA GAAGAGTTAGTATTGTCAACAAAATTTAAGAAGCCTCAACATTATGAAATTGCTTTTAATAATGTTGGATTTTCATATAA CAAAGATAAGGACGATCTGGTCTTTAAGCATTTATCATTTACAGTACCAGAAAATAATTTCACAGCTATCGTCGGGGCAT CTGGTAGCGGTAAGTCAACCATTGCCAAGCTTATATCACGATACTGGGATGTGACTTCAGGTGAAATTACGATTGGCGGT ATAAATATAAAAGATATTGAATCGAAACAACTTAACGATTTAGTTGGTTTTGTTGGACAAGATAACTTTTTATTAAATCT TACTTTTAAAGAAAATATTAAACTTGGCAATCCAGAAGCTACGGATGAGGCAGTTGAAAAAGCTGCCAAGTTAGCACAAT GTCATGAATTTATTGAAAAGTTGCCAGATGGATATGATACGAATGTTGGTACAGTGGGAGATAAATTGTCTGGTGGTGAA AAACAACGAGTCACTATTGCAAGAATGATATTAAAAGATGCGCCTATCATTGTATTAGATGAAGCGACTGCTTACGTTGA TCCAGACAACGAACAAAAAATTCAAGAAGCATTAAATGTGTTGACGCAGGATAAAACATTGATTGTTATTGCACATCGGT TATCTACGATTCAACATGCAGATCAAATTATTGTTTTAGGTAAACAACAAATTTTAGAAAAAGGGTCACATCACTTATTG ATAAAATTAAACGGTAATTATAAGAAAATGTGGGATACGCACATGCATACAAAAGATTGGGGAATCAATACTGGACATAA TTAA Protein sequence : MNNQTNWIKILSGFASDSKWKIMLSILLSIISVFSGLVPYWAVFKIILMMINNAYTINSIMVYIFIALIAYISQVCCFGA STMLSHITAYEILSEIRKKLAQKLMRLPLGVVESKKIGELKNIFVDKVETIELPLAHMIPEVIGNLLLSAAIFLYIMLID WRMASALLVTIPISIFAFKKVMSGFNETYAEQMKSNNYMNSAIVEFIEGIEVIKTFNQSQSSYKKYKDAVDNYKIHTLNW FKNTWGYMNLGASVLPSTFLGILPVGMYLISINQLNYAEFFLCIVLSLGVVAPIKNFTNYVNHLKSIQYALTEVNQILSL EELVLSTKFKKPQHYEIAFNNVGFSYNKDKDDLVFKHLSFTVPENNFTAIVGASGSGKSTIAKLISRYWDVTSGEITIGG INIKDIESKQLNDLVGFVGQDNFLLNLTFKENIKLGNPEATDEAVEKAAKLAQCHEFIEKLPDGYDTNVGTVGDKLSGGE KQRVTIARMILKDAPIIVLDEATAYVDPDNEQKIQEALNVLTQDKTLIVIAHRLSTIQHADQIIVLGKQQILEKGSHHLL IKLNGNYKKMWDTHMHTKDWGINTGHN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| smi_1698 | YP_003446800.1 | multidrug ABC transporter ATPase/permease | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 1e-80 | 41 |
