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Name : lctP (CJE0072) Accession : YP_178096.1 Strain : Campylobacter jejuni RM1221 Genome accession: NC_003912 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 86025 - 87722 bp Length : 1698 bp Strand : - Note : identified by similarity to SP:P33231; match to protein family HMM PF02652; match to protein family HMM TIGR00795 DNA sequence : TTGGAACAAATTTTAACATGGCAACAAATTTATGACCCTTTTTCAAACATTTGGCTAAGTGCTTTAGTGGCATTTTTACC TATACTATGTTTTTTAGTTTGTTTGGTTGTTTTAAAACTTAAAGGCTATCAAGCAGGTTTTTTAACTGTTATACTTGCTA CTTTGGTAGCTTTATTTGCCTATAAAATGCCTTGGAATTTAGTGGGTGCAAGTTTTATTCAAGGCTTTACAAATGGTATG TGGCCTATAGCTTGGATTATCATCGCGGCAATCTTTCTTTACAAACTTTCTATCAAGTCAGGTTCTTTTGAAATCATTAA AAAAAGCGTGATGAGCATTACTCCAGATCATAGAATTCAAGTGATTTTAATAGGTTTTTGTTTTGGTTCATTTTTAGAGG GTGCTATAGGTTTTGGTGGCCCTGTGGCTATAACCGCTGCACTTTTAGTAGGACTTGGCTTGCGTCCTTTACAAGCTGCA GGGCTTTGTCTTATCGCAAATACCGCTCCTGTTGCTTTTGGTGCGGTGGGAATTCCTATTATTGCTATGGCAAATCTTGT CGGCATAGAACAGCATTCAGTTTCTGCCATGGTAGGTAGAATGCTAGTTCCTTTAAGCCTTACTATACCTTTTTTCATAG TTTTTTTAATGGATGGATTTAAAGGTATTAAAGAAACTTTTCCAGCTATTTTAGTTGCGGCGCTAAGTTTTACAACTACT CAATTTTTAAGCTCAAATCACCTAGGAGCGGAATTACCTGATATTATTTCAGCTGTGGTTTCTTTAGCAGTTACGACTGT ATTTTTGAAATTTTGGAAACCAAAAAATATTTTTAGATTTGACAATGAAAGCAATTTCACTCAAGATAACACCTTAAGTT TTAATCAAATTTTAAAAGCTTGGTCACCTTTTATTTTACTCATTGTTTGTATTATCATTTGGACACAACCTTGGTTTAAA GCTCTCTTTGATAAGGACGGAATTTTAAGCTATACAAGTATTACTTTACAATTTAGCAATATCACAACTGGAATTTTAAG CCCTTCTATCACAGGCATAGGAGAAGCTAAGCCTTTATCTTTGGCCTTGGGTGTAGATTTAATCAATGGAAAAACCGTAG CTCAAGCAGGAACAGCGATTTTACTTGCCGCTTTTCTAACTATAGCTATTTTAAAAATCAAAGCCGAAGATGCTGCAGAA TGCTTTTGGGTTACCTTAAAAGAAATGGCTATACCTTGTATCACCATAGGTTTGGTTGTGGCCTTTGCTTTTATCTCTAA AAATAGTGGTATGAGCACTACTTTAGGACTTGCTTTTGCACACACAGGTGATGCTTTTTCTTTCTTTTCACCAATCATTG GCTGGATAGGGGTATTTTTAACAGGCTCTGATACAAGTGCTAATTTACTTTTTGGAACCTTGCAACAAGTAAGCGCTCAA AAACTAGGTATTAGCGAAGCTTTATTTTTAGCAGCTAATTCAGTAGGTGGGGTTGTTGGAAAGATGATCAGTCCACAAAG CATTGCTATAGCTTGTGCAGCGGTTGGACTTGTGGGAAAAGAATCTGATCTTTTCAAATTCACATTAAAATATTCTGTAG CTTTTATTATTTTAATAGGAATTTGGACTTGCATTATAGCTTTTTTCTTACAAGGAATCATCCCTGAAGTTATTAGTGAA ATAATTAAAAAAAATTAA Protein sequence : MEQILTWQQIYDPFSNIWLSALVAFLPILCFLVCLVVLKLKGYQAGFLTVILATLVALFAYKMPWNLVGASFIQGFTNGM WPIAWIIIAAIFLYKLSIKSGSFEIIKKSVMSITPDHRIQVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAALLVGLGLRPLQAA GLCLIANTAPVAFGAVGIPIIAMANLVGIEQHSVSAMVGRMLVPLSLTIPFFIVFLMDGFKGIKETFPAILVAALSFTTT QFLSSNHLGAELPDIISAVVSLAVTTVFLKFWKPKNIFRFDNESNFTQDNTLSFNQILKAWSPFILLIVCIIIWTQPWFK ALFDKDGILSYTSITLQFSNITTGILSPSITGIGEAKPLSLALGVDLINGKTVAQAGTAILLAAFLTIAILKIKAEDAAE CFWVTLKEMAIPCITIGLVVAFAFISKNSGMSTTLGLAFAHTGDAFSFFSPIIGWIGVFLTGSDTSANLLFGTLQQVSAQ KLGISEALFLAANSVGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESDLFKFTLKYSVAFIILIGIWTCIIAFFLQGIIPEVISE IIKKN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-100 | 50 |
