|
Name : CJE0306 (CJE0306) Accession : YP_178326.1 Strain : Campylobacter jejuni RM1221 Genome accession: NC_003912 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sulfatase Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG2194 EC number : - Position : 269288 - 270826 bp Length : 1539 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00884; match to protein family HMM PF02418 DNA sequence : ATGCTTAGATTAACTTGGTTTCAGTTTACTTTTTTTAATTCTTTGATGATTGCAATATTAAATTTTAATTTATTTTATTT TGTGTATGAAAAAAATACACAAAACTGGTTTATAACTTTTGTTTTTATTGTGGCCTATTTTGCCCTTGTTCACGTGATTT GCTCTTTGCTTTTTATAAAGTTTTTTACTAAATTTTTTTCTATATTATTTATAATATCATCTTTTTTAAGTGTTTACTTT ATTAGTTTTTATGGGGTGCTTATAGATTCTGATATGATACAAAATGTTGTTCAAACAGATATCAAAGAAGTAAAAGATTT GTTAAATTTAAAATTGATCTTATTTGTTGTTTTGGCTTTATTGTTGGTTTTTTATGTTGTTAAAGTAAAAATTGATTATT ATGGTAGTTTTAAATCCCATCTAAAAATTAAAATTATCAATATAATATCAGGTTTGATTGTTGTTTGTGCGATTTTAATC CCTTTAAGTAAAACTTTCTTGCCTTTTTTTAGAAACTATAATGAAATAAGAATGTATAATACTCCTTTTTATCAAATTTA TTCCGTATATCGCTATTATGTTCGTTTTGTAAAAACTAAGCCAGAATTTAAAACTATAGCTAATGATGCTTATAGAGAAA ACAATCACACTAAAAAACTTTTAGTTTTGGTGGTGGGTGAAACCGCTAGAGCGGCAAATTACTCTTTGGGTGGATATACT AAAAATGATACCAATTTTTATACCAAAAAAGATAATGTAGTCTTTTTTGATAATTTTTCATCATGTGGAACAGCAACAGC GGTAAGTTTGCCTTGTATGTTTTCTATTTCTAAGCGTGAAAATTATTCAAGTTCAGAATTTCAAGAAAATGCGATGGATG TACTTTATAAAACAGGTGTAGATGCTGCATGGTTTGATAATAATTCTGGTGGTTGTAAAGGGGTTTGCGATAGATTAGCT TATAAGCAAAAGCTTTCTAGTGATTTGGATGAAAATTTACTCGCCCCTTTTAAAGAAAAATTAAATCATTTAAGTGATCA AAATATAATAGTTCTTCATTTGCAAGGTTCTCATGGGCCAACTTATTATAAACGCTATCCAAGTGAATTTAAAAAATTTA CTCCAACTTGTGATACTAATGAGCTTTCAAAATGTGATAGCGAGGCTTTAATCAACACTTATGACAATACTTTACTTTAT ACAGATTATCTTTTAAGTGAGATTATAAAACTATTAAAAGAGCAAAAAAGCTATGAAAGTTCTTTGTTTTATCTTTCAGA TCATGGTGAAAGTTTGGGTGAAAATGATATTTATCTTCATGGTATGCCTTATGCTATAGCGCCAAGTTATCAAACTCATA TTCCTGCTATTTTTTGGAGCAATGATAAAAATTTAATGAATTTAGCTAAAGAGTATAAAGGTTTAAAACTTTCTCAAGAT AATCTTTTTAGTACTCTTTTAGGATATTTTGATGTAAAAACAAGTGTTTATGAACCAGAATATGATTTATTAAATCCTAA ACTTAAGGCAAATCCATGA Protein sequence : MLRLTWFQFTFFNSLMIAILNFNLFYFVYEKNTQNWFITFVFIVAYFALVHVICSLLFIKFFTKFFSILFIISSFLSVYF ISFYGVLIDSDMIQNVVQTDIKEVKDLLNLKLILFVVLALLLVFYVVKVKIDYYGSFKSHLKIKIINIISGLIVVCAILI PLSKTFLPFFRNYNEIRMYNTPFYQIYSVYRYYVRFVKTKPEFKTIANDAYRENNHTKKLLVLVVGETARAANYSLGGYT KNDTNFYTKKDNVVFFDNFSSCGTATAVSLPCMFSISKRENYSSSEFQENAMDVLYKTGVDAAWFDNNSGGCKGVCDRLA YKQKLSSDLDENLLAPFKEKLNHLSDQNIIVLHLQGSHGPTYYKRYPSEFKKFTPTCDTNELSKCDSEALINTYDNTLLY TDYLLSEIIKLLKEQKSYESSLFYLSDHGESLGENDIYLHGMPYAIAPSYQTHIPAIFWSNDKNLMNLAKEYKGLKLSQD NLFSTLLGYFDVKTSVYEPEYDLLNPKLKANP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| Z1140 | NP_286675.1 | hypothetical protein | Not tested | TAI | Protein | 2e-56 | 42 |
| Z1579 | NP_287083.1 | hypothetical protein | Not tested | TAI | Protein | 2e-56 | 42 |
