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Name : CPS_0578 (CPS_0578) Accession : YP_267328.1 Strain : Colwellia psychrerythraea 34H Genome accession: NC_003910 Putative virulence/resistance : Unknown Product : polysaccharide biosynthesis/export protein Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG1596 EC number : - Position : 579384 - 580511 bp Length : 1128 bp Strand : + Note : identified by similarity to SP:Q46629; match to protein family HMM PF02563 DNA sequence : ATGTTAATATCCTCTAAAAAAGTAATTGTCTCACTAGCCTTATTGTTATTGAGCGGCTGTAATATTATCCCTGGCAGTCA TATGGAAGGCGTTGATGTAGAACCTGAGACATCTACACTTGAACAAGACCTCTCAAATATAAATATCTCTGTTATAGACT CTTCATTAATATCTCGATTAAAAGACAGCCAACAAACTTATTCTCAAGCTAAAAAATATACACCAGTAGTTACAGATACG TATGATTACGTGCTGGGTGTTGGTGATGTTTTATCTATTGGTGTTTGGGACCATCCAGAATTAACTATTCCTGCCGCAGT ACAACGTACCGCAGAATTTGATGGTTTTAGAATTCAAGCCGATGGCACTATCACCTATGCGTATGCTGCCAATGTACCTG CAGCGGGTAAAACAATCAGAGAATTACACAATGTTTTAGTAGCAAAGCTCAGTGAGGTTATTGAAAAACCACAATTAGAC CTTAAAGTGGTTGGCTTTAAGAGTCAGCGAACGTATGTTACTGGCGAGGTGAAAAGACCTGGTGTTTTCGCTATCAGTGA AATACCTTTAACGTTAATCGATGCACTCAACCTCGCGGGTGGTTTAAGTGAAAGAGCTGATTGGCGCACGGTTAGTTTTA CTCGAGATAATCAAGTACAAACCATCAAGTTAGATGATTTTTATACCAAGGGTGATATTTCTCAAAACCGCTTATTAAAA CATGGTGATATTATTCATGTTAATCGTACTGATAATCAAAAAGTATTTGTATTGGGTGATGTAAGCAAAGCTGGCAGTAT TGAAATTAACCGTTATGGCTTAAGCCTTGCGGAAGCGTTAAGCGACGTAGGCGGTTTAAATGAAAGAACCGCCAATGCTA ACGGGGTATTTGTGTTGCGTAAACGCCCAGATAATGAAGAAGGCATTATTGCCGATGTGTATCAATTGTATGCACAAAAT GTAGTGGCACTGGTGTTAGCTGATCAATTTAAATTGCAACCGCGTGATATCGTTTATGTGACCACTGCACCTATTGCACG TTGGAATCGTTTGATTAGCCAATTAGTACCAACAGTGCAAGCACTGGAAAGTATTTCAACGATTAAAACTCAAGGAAACT TTTTCTAA Protein sequence : MLISSKKVIVSLALLLLSGCNIIPGSHMEGVDVEPETSTLEQDLSNINISVIDSSLISRLKDSQQTYSQAKKYTPVVTDT YDYVLGVGDVLSIGVWDHPELTIPAAVQRTAEFDGFRIQADGTITYAYAANVPAAGKTIRELHNVLVAKLSEVIEKPQLD LKVVGFKSQRTYVTGEVKRPGVFAISEIPLTLIDALNLAGGLSERADWRTVSFTRDNQVQTIKLDDFYTKGDISQNRLLK HGDIIHVNRTDNQKVFVLGDVSKAGSIEINRYGLSLAEALSDVGGLNERTANANGVFVLRKRPDNEEGIIADVYQLYAQN VVALVLADQFKLQPRDIVYVTTAPIARWNRLISQLVPTVQALESISTIKTQGNFF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf39 | AAO18064.1 | Orf39 | Not tested | TTSS locus | Protein | 4e-72 | 41 |
