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Name : amt (CPS_3995) Accession : YP_270653.1 Strain : Colwellia psychrerythraea 34H Genome accession: NC_003910 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0004 EC number : - Position : 4194924 - 4196261 bp Length : 1338 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00909; match to protein family HMM TIGR00836 DNA sequence : ATGTCAGTTATTGAATTATTTACTATGGAAACAACTATGAGCAAAGCATTAATCTTGTGTTTAACCTTACTTAGCTTTTT TATCTCAGGCACTGCTTGGGCGGAAGAAGGGCAACTAAATGGCGCAAACACCAGTTGGATTTTAACATCTACCGCATTGG TATTATTGATGACCTTACCGGGCGTTGCTCTTTTTTACGGTGGCTTGGTTCGTAAAAAGAATGTGTTATCAATATTAATG CAATGTTTTGCTATCGGCTCAATCTCATCAATTTTATGGCTATTAGTAGGCTATAGCTTAGCTTTTGGTGAGGGTAATGC TTTTATCGGTGATTTTAGTAAAGTGATGATGCATGGTATTCCTAAAGATGCTTTGTCAGGAGATATCCCTGAAAGTTTAT TTATGCTGTTTCAAATGACTTTTGCCATTATTACGCCAGTGCTTATTATTGGTGGTTTTGCAGAGCGTATGAAGTTCTCT GCGGTATTACTCTTTAGTGGTATTTGGTTACTTGCTGTTTATGCACCTATTACTCATTGGGTATGGGGCGGCGGTTGGTT AGCACAAATGGGCATTTATGATTTTGCCGGTGGTATTGTTGTACATATTACGGCGGGTACTGCGGCATTAGTTGCCGCTC TTGTTATCGGTCCACGTCGAGGTTTTCCTAAAACACCTATGTTGCCACATAACTTAACCATGACTGTTACTGGTGCTGGT ATGTTATGGGTTGGTTGGTTTGGCTTTAATGGTGGTAGTGCACTAGCCGCTAACGGTGATGCTTCTATGGCTATGCTTGT TACACATATTTCTGCCGCAGCAGGTACATTAACTTGGGCAGCTATTGAGTGGAAAAAATTTGGTAAAGCCAGTGTTTTAG GTGCTGTTACCGGTATGGTCGCAGGTTTAGGTACCATTACGCCTGCCTCTGGTTTTGTCGGCCCTGGTGGCGCGTTAATT ATTGGTATTAGTGCAGGCTTTGTTTGTTTTTATTCAACGGTTTATATTAAACAAAAATTAAAAATTGATGATTCGTTAGA TGTATTTCCTGTACATGGTGTTGGTGGTATTTTAGGTACGTTATTAGTCGGTGTTTTCTCAGCGACCAGTCTTGGTGTAT TTAGTGGTTTTGGTTTTGCTGAAGGCATTGCTACGATGGCGGAACAAATTGGTGTTCAGCTTATCGGCATATTCTCTACA CTGATTTATACCGCAGTCGTTACTTATATTATCCTTAAATTGGTCGGTTTGATGACGGATGGTTTACGTGTTGGTGAAGA GCAAGAGTCTAACGGTTTAGATCAGGCTGAACATGAAGAAGTCGGTTACCACTTGTAG Protein sequence : MSVIELFTMETTMSKALILCLTLLSFFISGTAWAEEGQLNGANTSWILTSTALVLLMTLPGVALFYGGLVRKKNVLSILM QCFAIGSISSILWLLVGYSLAFGEGNAFIGDFSKVMMHGIPKDALSGDIPESLFMLFQMTFAIITPVLIIGGFAERMKFS AVLLFSGIWLLAVYAPITHWVWGGGWLAQMGIYDFAGGIVVHITAGTAALVAALVIGPRRGFPKTPMLPHNLTMTVTGAG MLWVGWFGFNGGSALAANGDASMAMLVTHISAAAGTLTWAAIEWKKFGKASVLGAVTGMVAGLGTITPASGFVGPGGALI IGISAGFVCFYSTVYIKQKLKIDDSLDVFPVHGVGGILGTLLVGVFSATSLGVFSGFGFAEGIATMAEQIGVQLIGIFST LIYTAVVTYIILKLVGLMTDGLRVGEEQESNGLDQAEHEEVGYHL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 3e-88 | 55 |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 3e-88 | 55 |
