Gene Information

Name : CPS_2803 (CPS_2803)
Accession : YP_269515.1
Strain : Colwellia psychrerythraea 34H
Genome accession: NC_003910
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG1033
EC number : -
Position : 2929728 - 2932046 bp
Length : 2319 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAATTTCTCTGGCTAACCGTATTGAAGTAGGCCTATTTCGTCATAAACTCCTGGTGTTAATGTTATTCATTATCAC
CAGTGCTTTTTTTCTCTTCCAAGCGACTCAAATTAGACTCGATGCTTCGTTTACTAAAAATATACCGCTAAACCACAGTT
ACATGAAAACCTATTTGAAACATAGGACAAACTTTGGTGGTGCTAATAATATTCTAATCTCTGTCTGTGATAGTAATGGC
GATATATTCAACGCTGATTTCTTTAACGCCTTAAAAGGTGTACACGACAAGTTGTTTTTCATTCCTGGTGTTGATCGGAT
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AATGGGCATGTTATCAAGCCTTGGCTTTGGTCTTGATCCTATGTCGATATTGATTCCCTTTTTAGTTTTTGCCATTGGTG
TGAGCCATGGCGTACAAATGATAAATTCGGTCGTTAAAAAAGTTGCAACTGGTTTAACGCCTGCTTCAGCAGCTCAAGCA
AGTTTTCGAGCATTGTTGATTCCTGGTGGTGTAGCATTACTCTCCGATACGGTTGGTTTTTTAACGCTACTCTCTATTGA
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CAGTATTACTTTCATTTACCAAAATAAAAGTGAGTGCGAAAGTTGGTCAATTAAGTGAACAAAGTGCTGTGTGGTCATTT
ATGGCTAGTTTCGCCAGTAAAGGTCCTGCAAGAATAATACTGTTCTTTACGGCTATTTTATTCGTTGTTGGCTTTTATCA
AGGCCAAGGTTTGAAAATTGGTGAATTACATGCGGGTGCTCCGGCGTTACATGAATCTTCACGTTACAACCAAGATACTT
TCTTAATTACTGATAGGTATGCAATTAGTGTTGATTATATGTCGGTAATTATTGAGACAAGCGCTGATGCATGTACTTAT
TACGATACCATGTCAACGATAGACCGCTTTCAATGGCAGATGGAAAATGTTGCGGGTGTGCAATCGGCGGTCAGCTTATC
TTCTATCTCTAAAATTGTTAATGCCGGTTATAACGAAGGTAATCCAAAATGGCGAGTTATTCCACGTAATCAGCAAACGT
TAGTACAGTCAATTGCCCGAGTTCCATCGTCTAGCGGTCTTCTTAATAGTGATTGTAGTGTTATGCCAGTGATTTTATTC
TTAGAAGATCATAAAGCAGATACGATTAACACTGTCATTGAAGCAGTTAAAGTTACCGCTAAAGAGTTGGGTAGTGAACA
CGTTCAATTCAAATTAGCCTCTGGGCCAGTCGGTGTTATGGCCGCAACGAATGAAGCGGTTGCAGAAGCTCAGTTACCTA
TGATGCTTTATGTTTACGGTGCTGTCATTGCATTGTGCCTAATTAGCTTTAGAAGCGTCAGAGCAACTTTAGTCGTTGTT
TTACCTTTATATGTAGTTTCTACGCTAGCTCAGTGGTTAATGACGGCACTTGATATCGGATTAACCGTCTCTACCTTACC
TGTTATTGCATTGGGCGTTGGTATTGGTGTCGATTATGGTATCTATATACTATCTACCATGAGTACTAAGCTAAAAGAGG
GCATGAATGTCCATGATGCATACCTTGAAGCATTAAAAGAGCGTGGTAGCGCTGTACTTATTACCGGCTTAACTTTGGCC
ATTGGTGTGTCGACTTGGTTTTTCTCAGATTTGAAATTTCAAGTAGATATGGGAATATTACTAACCTTTATGTTTTTGGT
TAATATGTTGGCCGCTATTATTATTTTACCTGCACTCTCAGCCTTTTTATGGCCAGAGAAAAGGAATGATAAAAAATAA

Protein sequence :
MKISLANRIEVGLFRHKLLVLMLFIITSAFFLFQATQIRLDASFTKNIPLNHSYMKTYLKHRTNFGGANNILISVCDSNG
DIFNADFFNALKGVHDKLFFIPGVDRIQVKSLFSPSTRFVEVVEDGFAGGPVIPADFQPSEKGLGVVKGNIEKAGIVGSI
VADDYSCAMVKAALLEFNPDTGEKLDTLEIAEKLEQEVRQEFERDNISVHIIGFAKMVGDVAEGAKGVVLFFALAIAITA
VMVYIFCHSIRLTVLPILCSLVAVVWQMGMLSSLGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHGVQMINSVVKKVATGLTPASAAQA
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MASFASKGPARIILFFTAILFVVGFYQGQGLKIGELHAGAPALHESSRYNQDTFLITDRYAISVDYMSVIIETSADACTY
YDTMSTIDRFQWQMENVAGVQSAVSLSSISKIVNAGYNEGNPKWRVIPRNQQTLVQSIARVPSSSGLLNSDCSVMPVILF
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IGVSTWFFSDLKFQVDMGILLTFMFLVNMLAAIIILPALSAFLWPEKRNDKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAK01517.1 transport protein Not tested PAGI-1 Protein 2e-125 42