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Name : ctaD (BCE_3990) Accession : NP_980285.1 Strain : Bacillus cereus ATCC 10987 Genome accession: NC_003909 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase, subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 3735884 - 3737719 bp Length : 1836 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00115 DNA sequence : ATGGGTGCTGTCATATGGGATTATTTAACGACAGTAGACCATAAAAAGATTGCCATTCTCTATTTAATTGCAGGTGGATT GTTTTTTATAATAGGCGGAATAGAAGCTCTATTTATTCGCCTTCAATTAGCGATTCCTAACAACGCTTTTCTTGTTGGGG ATGCTTATAATCAAGTATTAACTATGCACGGTACAACAATGATTTTCCTCGCAGCTATGCCACTCGTGTTTGCATTTATG AACGCCGCTGTACCACTTCAAATTGGTGCACGTGATGTAGCGTTCCCGTTTTTAAATTCACTCGGATTTTGGTTATTTTT CTTTGGTGGAGTATTTTTAAATTTAAGTTGGTTTTTAGGTGGAGCACCTGATGCAGGATGGACATCTTATGCATCTTTAG CTTTAGCCTCTAAAGGCCATGGTGTTGATTTTTATGTGCTTGGCTTGCAAATCTCCGGTATAGGTACATTAATTGGAGGT ATTAACTTCCTTGTAACCATTATTAATATGCGTGCGCCAGGGATGACGTATATGCGTATGCCGATGTTTACATGGACGAC ATTTGTAACATCTTCATTAATATTATTTGCTTTTCCGCCGTTAACTGTAGGATTAGGACTTTTAATGTTAGACCGCTTAT TTGGAACAAGTTTCTTTAATCCAGCACTGGGCGGGAATACAATTATATGGGAGCACTTATTCTGGATTTTCGGTCATCCA GAAGTATACATTCTTATACTCCCAGCTTTCGGAATATTCTCAGAAATCTTCGCGACGTTTTCGAAAAAACGATTATTTGG TTATTCGTCGATGGTGTTTGCGACAGTATTAATTGGATTTTTAGGGTTTATGGTATGGGCGCATCATATGTTTACTGTTG GGCTTGGTCCAGTTGCAAATGCTATTTTCTCAGTTGCAACAATGGCGATTGCGGTTCCGACCGGTATTAAAATATTCAAC TGGCTCTTTACAATGTGGGGCGGAAGTATTCGTTTTACGACACCGATGATGTGGGCAGTAGCCTTCATTCCATCATTCGT AATGGGAGGAGTTACAGGTGTTATGCTAGCATCTGCACCAGCTGATTATCAATTTCATGATAACTATTTCGTAGTAGCTC ACTTTCATTATGTAATTGTCGGTGGTGTTGTATTTGGTTTACTTGCAGGAGCCCATTATTATTGGCCACTGATGTTTAAT AAAGTATTGAATGAAACGTTAGGAAAGATAACATTTTGGTTATTCTTTATCGGTTTCCATTTAACGTTCTTCATTCAGCA TTTCCTTGGCTTAATTGGTATGCCACGTCGTTACTACACATATCTTGAAGGTCAAGGGTTGGAAATGGGTAATATGATTA GTTCTATTGGAGCGGTATTTATGGCTCTTGGAACGATTGTTCTTCTATTCAATGTAATTAAAACAACAGTATCAAAAGAA AAGGCTGGTCGTGATCCGTGGGATGGACGTACATTAGAATGGACAATGCCAGCACCTACACCAGAATATAACTTTAAACA ATTACCATTTGTTCGCGGGTTAGATCCGTTTTGGATTGAAAAACGTGAAGGGAATAAAGAGATGACAGCGGCGGAACCAG TGGGTGATATTCATATGCCAAATCCATCATTTTCACCATTTATCATTTCTTTAGGATTGTTTATAGCGGCATTCGGTGCA ATGTATATGCAGGGTGGAAAAGATAAGTTTTGGTTATTAGTAGCAATTATCGGTTTAATTATTACGTTTGGTACAATGTT CCTACGTTCAGTAATTGATGATCATGGATATCATATTCATAAAGAAGATTTAGAAGATAAGGGGGGCAAGGCGTAA Protein sequence : MGAVIWDYLTTVDHKKIAILYLIAGGLFFIIGGIEALFIRLQLAIPNNAFLVGDAYNQVLTMHGTTMIFLAAMPLVFAFM NAAVPLQIGARDVAFPFLNSLGFWLFFFGGVFLNLSWFLGGAPDAGWTSYASLALASKGHGVDFYVLGLQISGIGTLIGG INFLVTIINMRAPGMTYMRMPMFTWTTFVTSSLILFAFPPLTVGLGLLMLDRLFGTSFFNPALGGNTIIWEHLFWIFGHP EVYILILPAFGIFSEIFATFSKKRLFGYSSMVFATVLIGFLGFMVWAHHMFTVGLGPVANAIFSVATMAIAVPTGIKIFN WLFTMWGGSIRFTTPMMWAVAFIPSFVMGGVTGVMLASAPADYQFHDNYFVVAHFHYVIVGGVVFGLLAGAHYYWPLMFN KVLNETLGKITFWLFFIGFHLTFFIQHFLGLIGMPRRYYTYLEGQGLEMGNMISSIGAVFMALGTIVLLFNVIKTTVSKE KAGRDPWDGRTLEWTMPAPTPEYNFKQLPFVRGLDPFWIEKREGNKEMTAAEPVGDIHMPNPSFSPFIISLGLFIAAFGA MYMQGGKDKFWLLVAIIGLIITFGTMFLRSVIDDHGYHIHKEDLEDKGGKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-84 | 50 |
