|
Name : qoxB (lin0014) Accession : NP_469361.1 Strain : Listeria innocua Clip11262 Genome accession: NC_003212 Putative virulence/resistance : Unknown Product : AA3-600 quinol oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 17343 - 19322 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAATGGAATGAGTTTATCGTAACTGGTGACCCGATGATTTTAGGTGCGCAGATTTCTATCGTACTTGTAAGTATTGG TGTTGTCGCGTTACTAACTTATACAAAAAAATGGAAGTGGCTCATGAAAGAGTGGATTTCTTCCGTTGATCATAAAAAAA TAGGTATTATGTACTTGCTTGCTGCTGTCTTAATGTTTTTCCGTGGTGGCGTGGATGCGCTAATGATGCGTACCCAGCTC GCTTTACCGGACATGAAATTTTTAGACGCACAGCATTACAATGAAGTATTTTCTACGCACGGAACAATTATGATTTTATT CATGGCGATGCCGTTTATCATTGGGTTGATGAACATTGCCGTACCACTTCAAATTGGTGCGCGTGATGTAGCATTTCCAT TTTTAAACAACTTAAGTTTTTGGACGTTCTTTATGGGAGCGATGCTATTTAACTTATCATTCGTAATTGGTGGTTCACCA GATGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTTGCGACAGATTTTAGCGCTGGATATGGAATTAATTTCTATCTTCTAGGTGT TCAAATCGCTGGTATTGGTACGCTGATGACGGGGATTAACTTTTTCGTTACGATTTTAAGAATGCGTACAAAAGGTATGA CTTTAATGAAAATGCCAATGTTTACTTGGTCTTCATTAATTACAAGTTTGATCATTATTTTCGCTTTCCCAGTTTTAACA GTGGCACTTGCTTTGATGTCATTTGATCGACTGTTTGGGACAGCATTCTTCACACTCACGAATGGCGGGCTCCCAATGAT GTGGGCCAACTTGTTCTGGGTTTGGGGGCATCCGGAAGTATATATTGTTATTTTGCCAGCTTTCGGTATTTTCTCAGAGA TTATTTCTACTTTCTCCAGGAAAAAATTATTCGGTTATCCGGCGATGGTTGCCGCGATGGCAGTTATTTCTTTACTAAGT TTCCTAGTTTGGGTCCATCACTTCTTTACAATGGGATCAGGGGCGCTTGTTAACTCCTTCTTCTCCATTACAACGATGAT GATTGCGATACCGACCGGGATTAAGATATTCAACTGGCTCTTTACAATGTACAAAGGGCGAATAACCTTTACAACGCCAA TGCTTTGGTCGCTTGCCTTTATCCCTAACTTTGTTGTCGGTGGGGTAACTGGGGTTATGCTTGCGATGGCTGCGGCCGAT TATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTATCCCATTTCCACTACGTATTAATTGCTGGGACAGTATTCTCCTGCTTTGC TGGGCTTACATACTGGTATCCAAAAATGGTCGGTTACAGACTAAATGAAAAAATTGGTAAATGGTTCTTCTGGATTTTCG TTGTTGGATTTAACGTTTGTTTCTTCCCGCAATATTTCCTAGGACTAGATGGTATGCCGCGTCGTATTTACACTTACGTA CAAGGTGATGGCTGGACAACGCTTAACTTTATTTCCACAGTGGGCGGATTCTTGATGGGTGTAGCATTCTTAGTTCTTTG CTACAACATCTACTACAGCTATAAAAACTCTAAACGTGAAGTTACTGGTGACCCGTGGGATGCTCGTACGCTTGAATGGG CTACAAGTTCTGCAGTTCCTCCAAAATATAACTTTGCTGTTTTACCAGAATGGAATGACTTGGATGATTTCTGGAATAGA AAACAAAAAGGCGATCCATATGTAAATGATAAAAATTATAAACCAATCCATATGCCAAGTAATACCATGGTTGGGTTTGT AATGTCTGTCTTCTTCTTCATTGCAGGTTTCGGACTAGTCTTCTACTGGTACTGGATGGGAATTATTGGCCTAGTTGGTA TTTTAGGATGTATGATTTATCGTTCATTCCAAAATAACGATGGTTACCACGTTGAAGTGGACGAAATTAAAGCAACAGAA GAACATAATGCGCGCGAACTTGCGACTGGTGTGAAGGAGGGTAACCCATGGAATCTGTAG Protein sequence : MKWNEFIVTGDPMILGAQISIVLVSIGVVALLTYTKKWKWLMKEWISSVDHKKIGIMYLLAAVLMFFRGGVDALMMRTQL ALPDMKFLDAQHYNEVFSTHGTIMILFMAMPFIIGLMNIAVPLQIGARDVAFPFLNNLSFWTFFMGAMLFNLSFVIGGSP DAGWTNYAPLATDFSAGYGINFYLLGVQIAGIGTLMTGINFFVTILRMRTKGMTLMKMPMFTWSSLITSLIIIFAFPVLT VALALMSFDRLFGTAFFTLTNGGLPMMWANLFWVWGHPEVYIVILPAFGIFSEIISTFSRKKLFGYPAMVAAMAVISLLS FLVWVHHFFTMGSGALVNSFFSITTMMIAIPTGIKIFNWLFTMYKGRITFTTPMLWSLAFIPNFVVGGVTGVMLAMAAAD YQYHNTYFLVSHFHYVLIAGTVFSCFAGLTYWYPKMVGYRLNEKIGKWFFWIFVVGFNVCFFPQYFLGLDGMPRRIYTYV QGDGWTTLNFISTVGGFLMGVAFLVLCYNIYYSYKNSKREVTGDPWDARTLEWATSSAVPPKYNFAVLPEWNDLDDFWNR KQKGDPYVNDKNYKPIHMPSNTMVGFVMSVFFFIAGFGLVFYWYWMGIIGLVGILGCMIYRSFQNNDGYHVEVDEIKATE EHNARELATGVKEGNPWNL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-90 | 45 |
