|
Name : inlA (lmo0433) Accession : NP_463962.1 Strain : Listeria monocytogenes EGD-e Genome accession: NC_003210 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin A Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 454534 - 456936 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAGAAAAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGCGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCACAAACAGATCTAGACCAAGTTACAACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGAGTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGACATAACGCCACTTAAAAATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATATAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCCAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTTGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTTTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTTAATGAAAATCAGCTGGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACTTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCACTTGCGAACTTAACAAATATTAATTGGCTTTCAGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATCACCCAACTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACTGGCGCTTTAATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACA CAGAGCCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACAAATGAAGTAAGCTATACCTTTAGCCAACCTGTCACTATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACCGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGTTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCCGTAAAAGAAGGTCACACATTTGTTG GTTGGTTTGATGCCCAAACAGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCAATTTATAT GCACAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTTGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGTTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTTAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGTGGTGACA AGTGGGATTTCGCAACTAGCAAAATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCCCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACGTTTGATGTTGATGGAAAATCAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAGGCACCAACGAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGAAAAAACAGATGGGAAAAAATGGGATTTTGCGACGGATAAAATGCCAG CAAATGACATTACGCTGTACGCTCAATTTACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACACCGCCTACA ACAAATAACGGCGGGAATACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCGACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC AGCCAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTTTTGTTAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAATGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRKKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGVEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKNLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQAWTNAPVNYKANVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYTEPDITWNLPSYTNEVSYTFSQPVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNVKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGHTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDINLY AQFSINSYTATFDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKSTTQAVDYQGLLKEPKAPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSDTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLLGLLAVGTAMALTKKARASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 100 |
| inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 9e-137 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | NP_463962.1 | internalin A | VFG0075 | Protein | 0.0 | 100 |
