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Name : gabD (RC0621) Accession : NP_360258.1 Strain : Rickettsia conorii Malish 7 Genome accession: NC_003103 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : 1.2.1.16 Position : 604613 - 606040 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAACTTACTTAAAAATATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACAG TGACTAGTTTTTCTTTATGGTCACAAAGTTCATTTGAAGCGAGAATAGCAATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GAAAATATTGAGGAGTTAAGTTATATATTAACCCTAGAGCAGGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCTGGTAATAGTAACACTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCCAATGCAATGATTACT CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACTCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACCGGCGCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA GAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTACTTCACCTAACAGAATATTTATAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCCGGTGACGGATTTGATAAG GAATCAGATATAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG AGCTAAATTAATTTGCGGTGGTAAAACTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG ATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAATTTAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACATGCA AATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGA TTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTG GAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGAATTAA Protein sequence : MNLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFSLWSQSSFEARIAILRRWYNLVI ENIEELSYILTLEQGKVLAESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSNTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGATNVGKILYQN AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK ESDIGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKTVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEHA NNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 5e-94 | 47 |
