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Name : clpB (RC0059) Accession : NP_359696.1 Strain : Rickettsia conorii Malish 7 Genome accession: NC_003103 Putative virulence/resistance : Virulence Product : clpB protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG0542 EC number : - Position : 49891 - 52464 bp Length : 2574 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATATTGATAAATTTACTGCACATGCTAAATCAGTGATAGCTAGTAGCCAATTACTTGCTGCTAAAAATGATCATCA GCAAATATTACCTTTGCATTTATTATCTAGTCTTTTAAGTGAAGAAACAGGTATAATTCAAACCCTTATTAATAATACTG GCGGTAATATAAACTTATTAAAAGATCAAGTTCAGCTAGAACTAAATAAAATCCCAAAAGTTCAGGTTGAGGGAGGGGGA CAAGTTTATTCTTCTGCTGAAGCTCTTAAAGTTTTAGAAAAAGCTAGTAGCATTGCTAAAGACAATGGGGATAGCTTTGT AACCATAGAGCGTATATTTGAAGCATTAACGTATGATAATACTATAGCCGGTAAAATTTTAACGAATAATGGAATTAATA ATAAAAAAATAGCAACAGCTATTTTACAGTTTCGTAAAGGCAAAAAAGCAGATACCGAATCGGCAGAAAATAGTTACGAT GCTTTAAAGAAATACGGCAGAGACGTAACAGAGCTTGCCGAAAGCGGTAAGCTTGATCCGATAATTGGACGTGATGAAGA AATAAGAAGAACGGTGCAGGTACTATCACGACGTATGAAAAATAATCCTGTATTGATTGGAGAACCTGGAGTCGGTAAAA CTGCTATAATAGAGGGGCTTGCACAACGAATATTTAGTAAGGACGTACCTGAATCGCTTATTAATTGCCGTATTATTGAG CTTGATATGGGAGCTTTAATAGCGGGAGCTAAATATCGAGGCGAATTTGAAGAACGTCTTAAAGCAGTGCTTAGCGAAAT CAAAGAATCAAGCGGTGAAATTATTTTATTTATCGATGAATTGCATCTATTAGTCGGTACGGGAAAAACCGACGGTGCTA TGGATGCCTCGAATTTACTAAAGCCGATGCTTGCTCGTGGTGAGCTGCATTGTATCGGTGCTACTACTTTAGATGAATAT CGTAAATATATCGAGAAAGATGCGGCACTTGCTCGTCGTTTTCAGCCTGTTTACGTGAGTGAGCCGACGGTTGAGGATAC TATATCAATACTTAGAGGAATTAAAGAAAAATATGAGCTGCATCATGCAGTGCGAATTTCCGATAGTGCAATAGTTGCAG CAGCGACGTTATCAAACCGTTATATTACCGATCGTTATTTACCTGATAAAGCTATTGATTTGATTGATGAAGCTTGTAGC CGTATGAAAATAGAGCTATCAAGTAAACCAGAAGAGCTTGATGAGCTGGACCGTCGTATTATTCAGATAAAAATAGAGCT TGCAGCACTTAAAAAAGAAAATGACGAGCATTCTAAAAAGAAAATAGAGCATTTAACTACAGCATTAGAAAAATTAGAGT CTCAATCCTATGATATGGGAGCTAAATGGCAAGCTGAAAAGTCTAAACTACAGCAAACACAAAAGCTCAAAGAAGAACTA GACCGTAGCCGAAACGAGCTTGAACGTGCCGAACGTGATGCTAATCTCGCTAAAGCTAGTGAGCTAAAATACGGAATTAT ACCTGAGATTATGAAAAAGCTTCAGGAAGCCGAAAGTATGGATAATAAAGGGCTGTTAAAAGAAATTGTATCGGAAAGCG ATATAGCAAGTATTATCTCTCGTATTACTGGTATTCCAATTGATACGATGCTATCAAGTGAACGTGAGCGTCTGCTTGTG ATGGAGCAGAAATTACGAGAATCGGTAATAGGGCAGGATAAGGCAATTAAAGGTGTTAGTGATGCGGTAAGAAGATCACG TGCAGGGATTCAAGATATTAACCGCCCGCTTGGTTCGTTCTTATTCTTAGGACCGACCGGAGTCGGTAAAACCGAGCTTA CCAAAGCCTTAGCTGGTTTTCTTTTTGATGACCGTAATGCAATACTTCGTATAGATATGTCAGAATATATGGAGAAGCAC GCTATTTCTCGCCTGATAGGAGCTCCTCCCGGCTATATCGGATATGATCAAGGCGGAGTGTTGACGGAGGCAGTAAGACG CCGTCCTTATCAGGTAATATTATTTGATGAGGTTGAAAAAGCCCATCCCGACATATTTAATATTATGCTGCAAATACTTG ATGAGGGAAGATTAACAGATAGTCAAGGTATAACGGTTGATTTTAAGAATACTATAATAGTTTTAACGTCTAATTTAGGT GCTGAGATACTCGTTAATCAGAAAGAGGACGAAGATACATATAAAGTAAAGGATGAGGTTATGGAATATGTAAAAGCAGT ATTTAAACCTGAGTTTTTAAACAGACTAGACGAGATTATATTATTCCATCGCCTAAATCGTAATAATATTCATGATATAG TTAAGATACAGCTTGAAAGTTTAAAGAAAATTTTACTAGCACAAAATATTATTCTTGAATTTGATGAATCTGCATTAAAT TATTTAGCCGAAAAAGGTTATGATCCAAGCTTTGGAGCAAGACCCTTAAAACGTCTTATCCAGCGGGAAATACAAAATAA TTTAGCCAAAATGATTTTAGCAGGTGAAATAAGTAGCGGTAAAACGGTTAAAATAAATTCAAAGGATAAAGAATTGAAGG TAACAATGAGTTGA Protein sequence : MNIDKFTAHAKSVIASSQLLAAKNDHQQILPLHLLSSLLSEETGIIQTLINNTGGNINLLKDQVQLELNKIPKVQVEGGG QVYSSAEALKVLEKASSIAKDNGDSFVTIERIFEALTYDNTIAGKILTNNGINNKKIATAILQFRKGKKADTESAENSYD ALKKYGRDVTELAESGKLDPIIGRDEEIRRTVQVLSRRMKNNPVLIGEPGVGKTAIIEGLAQRIFSKDVPESLINCRIIE LDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLSEIKESSGEIILFIDELHLLVGTGKTDGAMDASNLLKPMLARGELHCIGATTLDEY RKYIEKDAALARRFQPVYVSEPTVEDTISILRGIKEKYELHHAVRISDSAIVAAATLSNRYITDRYLPDKAIDLIDEACS RMKIELSSKPEELDELDRRIIQIKIELAALKKENDEHSKKKIEHLTTALEKLESQSYDMGAKWQAEKSKLQQTQKLKEEL DRSRNELERAERDANLAKASELKYGIIPEIMKKLQEAESMDNKGLLKEIVSESDIASIISRITGIPIDTMLSSERERLLV MEQKLRESVIGQDKAIKGVSDAVRRSRAGIQDINRPLGSFLFLGPTGVGKTELTKALAGFLFDDRNAILRIDMSEYMEKH AISRLIGAPPGYIGYDQGGVLTEAVRRRPYQVILFDEVEKAHPDIFNIMLQILDEGRLTDSQGITVDFKNTIIVLTSNLG AEILVNQKEDEDTYKVKDEVMEYVKAVFKPEFLNRLDEIILFHRLNRNNIHDIVKIQLESLKKILLAQNIILEFDESALN YLAEKGYDPSFGARPLKRLIQREIQNNLAKMILAGEISSGKTVKINSKDKELKVTMS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpC | YP_005163377.1 | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit | Not tested | Not named | Protein | 2e-160 | 48 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpB | NP_359696.1 | clpB protein | VFG0079 | Protein | 2e-167 | 47 |
| clpB | NP_359696.1 | clpB protein | VFG2084 | Protein | 7e-105 | 41 |
