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Name : Transporter-truncation (spr0106) Accession : NP_357700.1 Strain : Streptococcus pneumoniae R6 Genome accession: NC_003098 Putative virulence/resistance : Virulence Product : transporter, truncation Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 113839 - 115773 bp Length : 1935 bp Strand : + Note : Similar to competence factor transporting ATP-binding/permease ComA DNA sequence : GTGGTATTACATAGTATCAAAAGGAATAGTAAGTTCTACGTAGCAGACCCTGCTAGTGGCATACGCAAGATGTCAAGTGA CGAACTGGGAGAAATTTATCAAGGTATTACTCTTTTTATGGTTCCAAATTCGGATTTTGAAAGAGGGAAACTAAAGGGAA AAGGACTTCTTGATTTATTTGGAAGGTTAATTTTTAATCAAAAAGGATTGATTAGTACAGTCATATTAGCTTCCTTTGTT TTAAGTATCATTGGTATTTTATCGAGTCTCTTTTCAAAAGTTATCATGGACGAGGTGATTCCATATGCTTTAAAAAATAG TCTGTATATGTTTTTGATAGTATTTGGAATAGTGTCGTTCTTACAGACTCTTCTATCTGCATTTCGTCAGCACGTTCTTT TGTTTCTATCTCGAAAAATTGATATACCGGTTTTAATGGGATATTATGACCATATTATTCATCTTCCTTATAGTTTTTTT GGAAGTCGTAGAGTTGGTGATGTTTTAACAAGATTTCAAGATGCGATGACGATAAAGAATGTGTTTACGTCAGTCTCTAT TTCATTAGTCATGGATATCACCTTGTCAGTTATTAGTGCGGTTGTCCTTTGGACTATTAATCAATCTTTATTTCTGATAT TAGTTTTTATGGTTATTGTTAACATCATTCTTATATACTGTTTTAAAAAGCCTTATAAAAAAATTAATCATGAACAAATG GAAGCAAATGGACTTCTTAATTCACAGTTAATTGAATCTATTCGTAACATTGATACCATTAAGTCTCAGCATGATGAGGA ACAACGTTTAAACAAAATTGAAGAAAAATTTGTTCATACTTTAGAAATTGGTTATAAAGAGGGTGTTTTGCAGAATATTC AATCTACAATATCTTCAATGACCTCAACCATGGGTGGGTTATTATTTATGGGAGTGGGCGCCTTATTTATCATTGATGGA AAAATGACTATTGGGGACCTCTTGGTTTTTCAGACATTAAGTCAATATTTTACAGAACCTATTCAGAATTTAGTTGGTTT GCAGTTAACCTTTCAAGAGGTACAGGTTGCGGTTAGTCGACTTCAAGAATTGATGGAAGTAGATCGTGAAGACATTGCCT TGGATTATAGTATTAGAGACTTCACCTTATGTGATGATATCGAGTTTAAAGATGTAACATTTGCCTATGGTTCGCGCCCA CCTGTTATCAAGAACTTTAATTTGCGAATTAAACAAGGAGAAAAAATAGCTTTTGTTGGTGAAAGTGGAGCAGGAAAAAG TACGCTAGTTCGTTTATTATTAAGATTTATAAATCCGAATGAGGGGAAAATTTGTATAGGAGCAAATGACTTATCAGATC TTGACTATGGTAAACTACGTAAGAAAATTTCCTACATTCCACAGACCATAGAACTCTTTACAGGGACAATTATTGATAAT CTAAAAATTGGTAATCCTTCTGTTACATATGAGGATATGGTGAGAGTTTGTCGTATTGTTGGTATTCATGATACGATTCA ACGCCTTCAAAATCGTTATGGCTCCTTTGTAGAAGAAGGCGGTCAAAATTTCTCGGGTGGAGAGAAACAACGATTGGCTA TTGCAAGAGCACTACTGAGTAAAGCTGATTTGTATATATTTGATGAGGCAACCTCTAACTTAGATTCATTTAGTGAACAG ATTATTCAGGATTTAATCTTTAATAAAATAATGGATAAGACAACAATTGTAGTAGCCCACAGGCTGTCTACAATTCTTCG ATGTGATAAGATATGCTTTTTAGAAAATGGGACTATTGTGGAATATGGGACTCATGAAGAACTAATGGCGAAAAATGGAA AGTATGCTAGAATGGTTGGTTTGCAGAGCGTTCAAGTGAATCAACAAATTCAGTCACAGGCTGTGTTAGATACAGAGGAG GTTACTTATGGCTAA Protein sequence : MVLHSIKRNSKFYVADPASGIRKMSSDELGEIYQGITLFMVPNSDFERGKLKGKGLLDLFGRLIFNQKGLISTVILASFV LSIIGILSSLFSKVIMDEVIPYALKNSLYMFLIVFGIVSFLQTLLSAFRQHVLLFLSRKIDIPVLMGYYDHIIHLPYSFF GSRRVGDVLTRFQDAMTIKNVFTSVSISLVMDITLSVISAVVLWTINQSLFLILVFMVIVNIILIYCFKKPYKKINHEQM EANGLLNSQLIESIRNIDTIKSQHDEEQRLNKIEEKFVHTLEIGYKEGVLQNIQSTISSMTSTMGGLLFMGVGALFIIDG KMTIGDLLVFQTLSQYFTEPIQNLVGLQLTFQEVQVAVSRLQELMEVDREDIALDYSIRDFTLCDDIEFKDVTFAYGSRP PVIKNFNLRIKQGEKIAFVGESGAGKSTLVRLLLRFINPNEGKICIGANDLSDLDYGKLRKKISYIPQTIELFTGTIIDN LKIGNPSVTYEDMVRVCRIVGIHDTIQRLQNRYGSFVEEGGQNFSGGEKQRLAIARALLSKADLYIFDEATSNLDSFSEQ IIQDLIFNKIMDKTTIVVAHRLSTILRCDKICFLENGTIVEYGTHEELMAKNGKYARMVGLQSVQVNQQIQSQAVLDTEE VTYG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_0658 | YP_697985.1 | lactococcin g processing and transport ATP-binding protein | Virulence | Not named | Protein | 4e-123 | 47 |
