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Name : coxA (WD0301) Accession : NP_966102.1 Strain : Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster wMel Genome accession: NC_002978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase, subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 280476 - 282026 bp Length : 1551 bp Strand : + Note : Identified by similarity to EGAD:5976; match to PF00115 protein family HMM PF00115 DNA sequence : ATGAGTGACGTACCAAAGGGCATAAAGCGTTGGTTGTTTTCCACCAATCATAAAGATATAGGGACACTGTACATTATTTT TTCCATATTAGCTGGAATTATTGGTGGATTATTATCGGTGATTATTCGCACTCAGCTAATGCACATTAATATACTTAACA ATAACTATCAATTATATAACGTAATGGTTACAGGGCATGCGTTGATAATGGTGTTTTTTATGATAATGCCAGCCCTCATG GGAGGATTTGGTAACTGGTTTGTACCTCTCATGATTGGCGCACCAGATATGGCATTTCCTCGTATGAATAATTTAAGTTT TTGGTTATTAGTGTCATCTTTTATTTTGCTCATTCTCTCAGTGTTTATTGGTGAAGGTCCAGGTACAGGTTGGACTTTAT ATCCACCTCTATCACAGGTAATGTCCCATCCAAGTGCAGGAGTTGACATTGCTATACTTGCACTTCATGTTGCTGGTATG TCGTCAATTGTTGGGGCGATCAACTTTATAGTTACTATATTTAACATGCGCACAAAAGGAATGTCATTAACTAAGATGCC ACTGTTTGTTTGGTCTGTCTTGCTAACAGCATTTATGTTGATTGTTGCCTTACCAGTGCTTGCCGGTGCTATAACTATGC TTCTTACTGATCGCAATATTGGTACTTCCTTTTTTGATCCTGCCGGTGGCGGCGATCCTGTGTTATTTCAACATCTATTT TGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTACGTAATTATTTTTCCTGCATTTGGCATCATAAGTCAGGTTGTATCAACTTTTTC TCACAGACCTGTATTTGGTTACATAGGGATGGTTTATGCAATGATAGGTATAGCAGTATTTGGCTTTATGGTTTGGGCTC ACCATATGTTCACTGTTGGGCTTAGTGCTGACGCTGCTGCATTTTTTAGCACTACCACAATTTTTATCGGTGTTATAACT GGTGTAAAAGTCTTTAGCTGGATTGCAACTATGTGGGGTGGAGCAATTGAGTTTAAGACCCCTATGCTATTTGCACTAGG TTTTATTTTCATGTTTGTTGGCGGTGGCATAACGGGAATAATTCTTTCTCATGGTGGAATAGATAAGCTCCTGCACGACA CCTATTATGTTGTTGCTCACTTCCATTATGTCATGTCACTTGCTGCATTATTTGGAGCTTTTGCTGGCTTTTATTATTGG ATTGGTAAAATGTCGGGTAAACAATATAATGAGCGCTTAGGTCAAATCCACTTTTGGCTTACTTTTATTAGCACCAATAT CACTTTTTTACCTCAACATTTCTTAGGATTAGCTGGTATGCCAAGGCGTATACCTGATTATCCTGATGCGTTTATCCCTT GGAATTATATATCCTCAATTGGTTCGTATATGTCCTTTGTTTCAGTTATGTTTTTTGTGTTTATAGTTATACATCTTTTT AAATGGGGCAAGAAAGCTGGAGATAATCCTTGGGAAGGTGACACCTTGGAATGGACGGTATCTTCACCACCGCCTTTTCA TACTTTCGAAAAGCCACCAGTGGTAAAATAG Protein sequence : MSDVPKGIKRWLFSTNHKDIGTLYIIFSILAGIIGGLLSVIIRTQLMHINILNNNYQLYNVMVTGHALIMVFFMIMPALM GGFGNWFVPLMIGAPDMAFPRMNNLSFWLLVSSFILLILSVFIGEGPGTGWTLYPPLSQVMSHPSAGVDIAILALHVAGM SSIVGAINFIVTIFNMRTKGMSLTKMPLFVWSVLLTAFMLIVALPVLAGAITMLLTDRNIGTSFFDPAGGGDPVLFQHLF WFFGHPEVYVIIFPAFGIISQVVSTFSHRPVFGYIGMVYAMIGIAVFGFMVWAHHMFTVGLSADAAAFFSTTTIFIGVIT GVKVFSWIATMWGGAIEFKTPMLFALGFIFMFVGGGITGIILSHGGIDKLLHDTYYVVAHFHYVMSLAALFGAFAGFYYW IGKMSGKQYNERLGQIHFWLTFISTNITFLPQHFLGLAGMPRRIPDYPDAFIPWNYISSIGSYMSFVSVMFFVFIVIHLF KWGKKAGDNPWEGDTLEWTVSSPPPFHTFEKPPVVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 8e-73 | 43 |
