|
Name : nuoF (SERP0084) Accession : YP_187681.1 Strain : Staphylococcus epidermidis RP62A Genome accession: NC_002976 Putative virulence/resistance : Unknown Product : NADH dehydrogenase subunit 5 Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1009 EC number : 1.6.5.3 Position : 70144 - 71640 bp Length : 1497 bp Strand : + Note : Catalyzes the transfer of electrons from NADH to ubiquinone DNA sequence : ATGTTAAGTTCAGAGTTAATTTTGTTTATGTTTTTTATTACACTTGTCATTGCTATACTGAGTGGATTAATATTTTTGAA TCATCGAGTTCCCATTCAATATATTAAATTTCATATATATTTACTTGTTTTACCTATCATTACGGGATTAAGTGGATTAA TATTTTTCGGTGAAAGGGCGAATGTTGGACCTTTTGTAGTTGATCATCTTACTTGGTTAATGATGACATTTATTTTGACT TTAGGCTTTATCATTCAAAAGTTTTCTATGCGTTATTTAATTGGCGACATGCATTACCGTAAATATTTTCCGTTTTTTAC ATTAATTACTGCATTTGCTTCATTGGCATGGTTAAGTGGAGACTTAAGGTTAATGACCATGTTTTGGGGTGCAACATTAT TTGTGTTAACACGGCTCATTAAAGTTAACAAATTATGGAAGGTGCCTAGGGAAGCAGCAAGAATTTCAGCTTGGTCATTT ATATTGGCATGGTTGTCGTTATTGATTGCTGTCATTTTATTGTATATCGCTACAGGAGATTGGTATATTTATTCGAATAT GTCAGATGATAATGCAATCAATTATGGAATGCGTCTCTGTATCAATTTACTTATTGTTTTAGCTGTGATTATTCCGGCGG CACAATTTCCATTTCAAGGCTGGCTTATTGAATCTGTAGCTGCGCCTACGCCAGTTTCAGCTATTATGCACGCTGGTATT GTTAATGCTGGTGGCGTTATTCTTACACGCTTTTCTCCGGTATTTAATGACGAAATAGCCATTTCACTGTTATTAATTAT TGCAAGTATTTCAGTATTGTTGGGTTCTGGAATCAGTCTTGTGCATGTTGATTACAAGAGACAACTTGTAGGTTCTACGA TAAGTCAAATGGGTTTTATGTTAGTACAATGTGCGCTTGGGGCATATTCTGCGGCGATAGTACATTTAATATTGCATGGT GTGTTTAAAGCGACATTATTTCTACAATCGGGTTCTGTTGTTAAAAGATTTAACATTCCTACGCCTCCATCTGTTAAAAA ATCATATGGCTGGCTTGTATTTGGTCGTCTACTAGCTATTCTTATAGCGATAATATTTTGGTTGAATAGTGATAGACATG CATATGATGTATTAAGCGCTCTTATATTAGCTTGGTCGTTAATGGTGTCATGGAATCAATTAGTTGCTTTTAGTCATGGA CTCATCGGAAGAGTCATCGGAGTATGTATGATTATTGTTGTAGTAATTGTTTATATTATTACGCATCATTATTTCTTCAC GACATTAAGTAACGTTGATATTCATATTGTTTCACCACCACTCATAAGTATTATTCTATCGATTGCTATTATAGTTTTCG GCAGTATGTTAAGCATATGGGTATCACGGCGAAGAGAATCAAAGGCATTTGCGAAGTTATACTTGTGGCTTATTAAAGTA GGAGAGGCTAAAACCCAATCTATAGAAAGTCATCCATCATATTTAAAACGATTTTAG Protein sequence : MLSSELILFMFFITLVIAILSGLIFLNHRVPIQYIKFHIYLLVLPIITGLSGLIFFGERANVGPFVVDHLTWLMMTFILT LGFIIQKFSMRYLIGDMHYRKYFPFFTLITAFASLAWLSGDLRLMTMFWGATLFVLTRLIKVNKLWKVPREAARISAWSF ILAWLSLLIAVILLYIATGDWYIYSNMSDDNAINYGMRLCINLLIVLAVIIPAAQFPFQGWLIESVAAPTPVSAIMHAGI VNAGGVILTRFSPVFNDEIAISLLLIIASISVLLGSGISLVHVDYKRQLVGSTISQMGFMLVQCALGAYSAAIVHLILHG VFKATLFLQSGSVVKRFNIPTPPSVKKSYGWLVFGRLLAILIAIIFWLNSDRHAYDVLSALILAWSLMVSWNQLVAFSHG LIGRVIGVCMIIVVVIVYIITHHYFFTTLSNVDIHIVSPPLISIILSIAIIVFGSMLSIWVSRRRESKAFAKLYLWLIKV GEAKTQSIESHPSYLKRF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SAS0410 | YP_042536.1 | NADH dehydrogenase subunit 5 | Not tested | vSa¥á | Protein | 9e-126 | 62 |
| SAR0452 | YP_039900.1 | NADH dehydrogenase subunit 5 | Not tested | vSa¥á | Protein | 7e-125 | 62 |
