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Name : qoxA (SERP0645) Accession : YP_188230.1 Strain : Staphylococcus epidermidis RP62A Genome accession: NC_002976 Putative virulence/resistance : Unknown Product : quinol oxidase, subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.- Position : 638799 - 640787 bp Length : 1989 bp Strand : - Note : identified by similarity to EGAD:7190; match to protein family HMM PF00115 DNA sequence : ATGAATTTTCCATGGGATCAACTACTAGTTAAAGGAAATTGGATGATTATCTCAGCACAAATTGCTGCGCCATTCTTAGT CATCGGCCTTATAGCAGTTATATCTTATTTCAAATTATGGAAATATCTATATAAAGAATGGTTCACATCCGTAGACCATA AAAAAATCGGTATCATGTATTTAATTTCTGCCGTATTAATGTTCGTTCGTGGTGGTATCGATGCGTTAATGTTACGTACT CAATTAACAATTCCAGATAACAAATTCTTGGAAGCAAACCACTATAATGAAGTATTTACTACGCACGGCGTAATTATGAT TATATTTATGGCTATGCCATTTATCTTTGGTTTATGGAATGTTGTTATTCCATTACAACTTGGTGCACGCGATGTTGCCT TCCCTGTAATGAATAACGTTAGTTTCTGGCTATTCTTCGCTGGTATGATTTTATTCAACCTATCATTTATTGTAGGTGGA TCACCAGCTGCTGGTTGGACTAACTACGCACCACTTGCTGGTGAATTCAGTCCAGGTCCAGGTGTTAACTATTATTTAAT TGCAATTCAAATATCTGGTATCGGATCGTTAATGACTGGTATCAACTTCTTTGTTACGATTCTAAGATGTAAAACTCCAA CAATGAAGTTTATGCAAATGCCAATGTTCAGTGTAACAACATTCATTACAACATTAATCGTTATATTAGCATTCCCAGTG TTCACTGTAGCACTTGCTTTAATGACTGCTGATAGAATTTTTGGAACTCAGTTCTTCACTGTAGCAAATGGCGGTATGCC AATGCTTTGGGCAAACTTCTTCTGGGTATGGGGGCACCCTGAAGTTTATATCGTTATTTTGCCAGCATTCGGTATGTACT CAGAAATCATCCCTACTTTTGCCCGTAAACGTTTATTCGGTCATCAAAGTATGATTTGGGCAACTGCAGGTATCGCATTC TTAAGTTTCTTAGTTTGGGTTCACCATTTCTTCACTATGGGTAATGGTGCGTTAATTAACTCATTCTTCTCTATCTCAAC AATGTTAATCGGTGTTCCAACCGGAGTTAAACTATTTAACTGGTTGCTCACATTATACAAAGGTAGAATTACATTTGAGT CACCTATGCTATTCTCATTAGCATTCATCCCTAACTTCTTATTAGGAGGGGTTACTGGTGTAATGCTTGCAATGGCATCA GCTGACTATCAATATCACAACACTTATTTCTTAGTAGCTCACTTCCACTATACATTGGTTACTGGTGTAGTATTTGCCTG CTTAGCTGGTTTAATCTTCTGGTATCCAAAAATGATGGGCTACAAGTTAAATGAAACATTAAACAAATGGTGCTTCTGGT TCTTCATGATCGGATTTAACGTTTGTTTCTTACCACAATTCATTCTAGGTTTAGATGGTATGCCACGTCGTCTATACACT TACATGCCTTCTGATGGTTGGTGGTTACTAAACTTCATCTCAACTATCGGTGCAGTATTGATGGCAATTGGATTCTTATT CCTAGTTGCAAGTATCGTTTATAGTCATATCAAAGCTCCACGTGAAGCTACTGGAGATAACTGGGATGGACTTGGTCGTA CTTTAGAATGGTCTACAGCATCAGCTATTCCACCTAAATACAACTTTGCTATCACTCCTGATTGGAATGACTACGATACA TTCGTTGATATGAAAGAACATGGTCGTCATTATTTAGACAACCATAACTACAAAGATATTCATATGCCAAACAATACTCC AGTAGGATTCTGGATGGGTATATTTATGACTATTGGTGGTTTCTTCTTAATCTTCGAATCTATTGTTCCAGCACTTATCT GTTTAGCAGGTATCTTCATTACTATGATTTGGAGAAGTTTCCAAATTGATCATGGTTACCACATCCCTGCTTCAGAAGTT GCAGAAACTGAAGCTCGTTTAAGAGAAGCTCGAATTAAAGAAAGGGAGGCTGTAAGTCATGAGTCATGA Protein sequence : MNFPWDQLLVKGNWMIISAQIAAPFLVIGLIAVISYFKLWKYLYKEWFTSVDHKKIGIMYLISAVLMFVRGGIDALMLRT QLTIPDNKFLEANHYNEVFTTHGVIMIIFMAMPFIFGLWNVVIPLQLGARDVAFPVMNNVSFWLFFAGMILFNLSFIVGG SPAAGWTNYAPLAGEFSPGPGVNYYLIAIQISGIGSLMTGINFFVTILRCKTPTMKFMQMPMFSVTTFITTLIVILAFPV FTVALALMTADRIFGTQFFTVANGGMPMLWANFFWVWGHPEVYIVILPAFGMYSEIIPTFARKRLFGHQSMIWATAGIAF LSFLVWVHHFFTMGNGALINSFFSISTMLIGVPTGVKLFNWLLTLYKGRITFESPMLFSLAFIPNFLLGGVTGVMLAMAS ADYQYHNTYFLVAHFHYTLVTGVVFACLAGLIFWYPKMMGYKLNETLNKWCFWFFMIGFNVCFLPQFILGLDGMPRRLYT YMPSDGWWLLNFISTIGAVLMAIGFLFLVASIVYSHIKAPREATGDNWDGLGRTLEWSTASAIPPKYNFAITPDWNDYDT FVDMKEHGRHYLDNHNYKDIHMPNNTPVGFWMGIFMTIGGFFLIFESIVPALICLAGIFITMIWRSFQIDHGYHIPASEV AETEARLREARIKEREAVSHES |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 5e-79 | 45 |
