|
Name : SERP1590 (SERP1590) Accession : YP_189155.1 Strain : Staphylococcus epidermidis RP62A Genome accession: NC_002976 Putative virulence/resistance : Unknown Product : single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0608 EC number : - Position : 1618839 - 1620605 bp Length : 1767 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF01368 DNA sequence : ATGAAAGTAAAACTTAAAGGAGAGTATACTCCGAACCTTGATCCTCTTGAGTATATTTTATCTAATAGAGGTATTAAGGA AGAAGATTATGAGAAATATATAAGCCCAACTGAAGAATTGCAACCAGATTGGAAGAAATTAGAAGATATTGAAGAAGGCG TTAAATCGTTAAAGAGTAAGATTGATGATGACAATGCTAAGATTGGTATATTAATTGACGCTGACCAAGATGGTTTAGCT AGTGGCTCAATAATGTATAAATTCTTAACTAAACAGTTACAATTTGATAAAGAGCGTATTATTGTTATTCCTCCACTAAA TAAGTCTCATGGTATTAATATTGAAAGAGTATTAGAACATGGAATGACAAGTGGGGATATATTGATTACTCCAGACTCAG CGTCTTCAGACTTTGAGCAACACGAAGAATTATATAATAAAGGTATTAATACATTAGTTATTGATCATCACTTAGCACCA AAAAACAAAGATAGTAAAGCTATTATTATAAACAACCAATTAAGTGATGAATTTGAAAACAAAGCTTTAACTGGTTCAGC AATGACATATTTATTCTGTGTAGCTTATTGCGAGCTTTTAGGAATAGATTTAACAGTAAATTTAAAAGATTTGGCAGCAA TTGGTTTAGTTGCGGATAGGGCAAACTTTGCTCATGATTTAGGTGCATACTATATGATGAGAGACGGTTTAAGAAAAGAA AATATTGATAGTTTAATGTTAAAAATGATTATTAATAAAAGTAGTAATCTTGAGCAAGGCGTTGATTTAAACGCTAAAGA TATTGGCTTCAATGTAGCACCAACAATCAATGCAGTATTCAGAATGGGAACACAAGACGAGTTAACACAAGTCATTCATG GAATGTGTGAATTTGATTATACTATACATAATAAACGCAAGAAGATGGACTTACATATTAGTGAAGAAGCTTATTTACGT GCTATGGCAGTTAAGCGTAGACAAAAGAAACAAGAAAATGAAGTATTAGATAAGATTAAAGAACGCATTAAAGAAAAAGG ATCAGATAAGCATAAAATCTTAATTGTTAATTCAACTGGTATTGTTGAAAATAATGGTTTAAATGGTTTAATTGCTATGA AATTAGCTAGAGAATATGGTAGACCAGTGCTAATGGTTAAAAGAATAGGGGAATACTTTAAAGGTTCAGGTCGTAATATA AATAATAGTCCTATTCCAGATTTAAATAAAATGTTAACTGATACAGGTTTATTCACTTGTAAAGGCCATGCCAATGCTTT TGGTGTAGAGTTTCATGTATCAGACGCTTTAGAAGTTTTAAAAGCTATTGAAAGTGAACTTATAGATGTTAACTTATCTG ATATTGAGTATGAAGCGGACTTTCAATGGACAAATAATTTAGATAGTAATATTATTCATACCTTAGCTAACAATAAAGAT ATGTGGTGTAATGGAATTGATGAACCATTAATTCATTTAAAAAATATTTTAGTTAGAAAAGAAAATATAAAATTAATTGG TAAAACTGGTAATACACTGAAAATTAATGTCAATGGAATTGATTGTGTTAAGTTTTTCCTTAAAGAAGAACAAAAGAATG AAATCGTTACTGCACCAGATATTATGTACTTTGACTTGATTTGCACAGCGAGTGTAAACTCATTTAGAGGGATGAATACT CCTCAATTAATGATTGAAGAATACTCAATTAGTGACGCAAAGGATCATGTTGAGAATTATTTATGTGAAGATGAGTTACC ATTTTAA Protein sequence : MKVKLKGEYTPNLDPLEYILSNRGIKEEDYEKYISPTEELQPDWKKLEDIEEGVKSLKSKIDDDNAKIGILIDADQDGLA SGSIMYKFLTKQLQFDKERIIVIPPLNKSHGINIERVLEHGMTSGDILITPDSASSDFEQHEELYNKGINTLVIDHHLAP KNKDSKAIIINNQLSDEFENKALTGSAMTYLFCVAYCELLGIDLTVNLKDLAAIGLVADRANFAHDLGAYYMMRDGLRKE NIDSLMLKMIINKSSNLEQGVDLNAKDIGFNVAPTINAVFRMGTQDELTQVIHGMCEFDYTIHNKRKKMDLHISEEAYLR AMAVKRRQKKQENEVLDKIKERIKEKGSDKHKILIVNSTGIVENNGLNGLIAMKLAREYGRPVLMVKRIGEYFKGSGRNI NNSPIPDLNKMLTDTGLFTCKGHANAFGVEFHVSDALEVLKAIESELIDVNLSDIEYEADFQWTNNLDSNIIHTLANNKD MWCNGIDEPLIHLKNILVRKENIKLIGKTGNTLKINVNGIDCVKFFLKEEQKNEIVTAPDIMYFDLICTASVNSFRGMNT PQLMIEEYSISDAKDHVENYLCEDELPF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SERP1590 | YP_189155.1 | single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ | Not tested | ¥ÕSP¥â | Protein | 0.0 | 100 |
