|
Name : SERP1537 (SERP1537) Accession : YP_189102.1 Strain : Staphylococcus epidermidis RP62A Genome accession: NC_002976 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase III, alpha subunit Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0587 EC number : - Position : 1589146 - 1591632 bp Length : 2487 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGATATAGATATAGACTGTGAAGGTTCTAAACGTCAACGTATTATCGGTGCATTAAAAAAACATTATGGTGAAGATAG AGTATTAAATGTATGTACATATGGAACTGAAGGTGCTAAATCTGCAATTAAAATGGCGGCTCGAGGTTTAAATATCCCAG ATACAGAAGCACAATATTTAGGTTCATTTATTAAAGTTGAACGTGGTCAACAATGGAGTATTAAAGATACACTATATGGA AACCCTGATAAAGATAGAAAACCAGATACTCAATTCAAAAATGAAATGGAGAAATATCCTAGATTACTTGAAACCGCAAT GAAACTAGAAGGTTTAGTAACTAGAAGAGGTATACATGCTGGTGGAGTAATTATCTTTAATGATGAAGCTTATAAGAATA ATGCGATCATGACTGCTTCTGGTGGAGATGTTCATGTAACACAATATAATTTGTCTGACTCAGAATACATGGGAGGAGTA AAATTTGACTTATTAAGTGTAGAGAACTTAGATAGAATTAGAGCAACATTAGAATTATTATCTAAAGATGTACTAATTGA TAATACAAAATCACTTAGAGAAAACTTTAGTGATTTACTACACCCTAAGAATTTAGACTTAGAAAGCAATGAATACTTTG AGTTAGCTTCAACTGGAGAAATTAATGACTTATTTCAATTCCAAACCGAGATTGGACAAACGACATTAAAGAGGGTACAA CCAGAAACATTTGAACAATTCTGTGCAGCAAACTCGTTAATGAGATTACAGTCTGACGGAGAAGAACAACCAATTGATAA ATACATTCGTCATAAGAATGATATTAACGAATGGTATAAAGAAATGCGTGAATTTGGTTTAAATGAAGAAGAAATTAAGA TTATGGAAGAGCATTTATTACATGACAAAGGCTTAAACATTACTCAAGAAAACTCAATGGGGCTATCTGCGGACAATAGG ATATCTAACTTCACTATTTTGGAGCAAAATAAGCTCAGAAAGGCCATTGCTAAGCCTAAAGGTTCGGCTTTAGACCAAAT AAAATCTCTGTTTTATTCTAAGGGTAAAGAATGTGGAGCAAGAGAAGTATTCTTAGATTATGTATGGAATGTCCAGTTCG CAATGCAATTCTCATATAGTTTCAGTTTATTACATACAACTGCTTATTCAGTTATTGGTATTCAAAACTTAGAATTAAAT AGAAGGTTCCCAAGAATTTATTGGCAAACTGCATGTTTAAATGTAGATAGTGACTCAATATCAACTGATAGTAAAGATAT TGATTATGAAAAGATTGCTAATGGTATTGGTAAGATGAAAGAGAATGGCGTAACAGTTAAGCTGCCTTCTATTAATAAAT CTACATTAGAGTTTAGTCCAGACGTAGAGCACAATGCTATTGTCTATGGTTTAAAACCAGTTAAGAATATTAATAACGAA ATAGTGGATCATATCATTGCAAATCGTCCATATCATTCACTAGATGATGTGTTAACTAAGTTATACGACACTAAATTGAT TACTAACAAACATTTAATTTCTATTGTTAAATCTGGTATGTTAGATGAATTTGGTGAACGTAAGAAGATTATGATGGACG TGGTTAAATACATAACAGACTTGAAGACTAACTTAACTTTAGCGAATATCAAATTGTTACTTGAAGCGGATATTCTTAGT GAGCGACCTGAATATGAATTAGTCTTATTAAGAGAAAACATCAAGAATAAAGTGTTAAGAAAAGTTCAAACAGGTAAGAG TAAAACTAAACACAAAATCTTTAAAGTTGAAGACACTGAACTTTATGATCGTTTGATTGGTAATGAAGCTATTGTTAATG TAGTAGGAAGCTATTATGAAGTAGACGAAAAAGAATTCAAGAAAATCTTTGATAAGAAGACTAAAGATTTAAAAGAATGG CTGAAGACAGATAAGCCTATTGAATTAGCAAATAGATATGTATTAAATGAAGCTTGGAAAAAACATGCATTAGGTAATTA TTCATCTTGGGAAATGGAGACATTATCGTTCTATTACCATAAGCATGAGTTATACAACGTAAATAAAGAGACTTATGATA TTACTGATTTTAAAGAGTTACCAGTTGATCCAGTAGTAGCAGATGTATTTAAATTTAAGGGTAGAGAAATGCCTAAGTAT GAAATTGTTAATATTGCTGGCACAGTTATTGCAAAAAATGCACCTAAGAAGTCAGTAACTATTCTTGCTACTGATGGTTC AGTTGTAACAATTAAATATCATGGCAATTTTTCTTACTACGACAAGACTAGTAAACTTAATGGTAGTGTAGTTGAGGAGT CATGGTTTAAGAAGGGCAACAAATTGATATTTAGTGGCTTCAGACGTGGAGGACAATTTGTATCTAAGAAGTATAAAGAC ACCTCAACTTCATCTTCAACCAAGTTGATCGAAAGCATTTCTAAAGATGGTGTACTTAGATATAAATTAGAGAGAGACTA TTTATAA Protein sequence : MDIDIDCEGSKRQRIIGALKKHYGEDRVLNVCTYGTEGAKSAIKMAARGLNIPDTEAQYLGSFIKVERGQQWSIKDTLYG NPDKDRKPDTQFKNEMEKYPRLLETAMKLEGLVTRRGIHAGGVIIFNDEAYKNNAIMTASGGDVHVTQYNLSDSEYMGGV KFDLLSVENLDRIRATLELLSKDVLIDNTKSLRENFSDLLHPKNLDLESNEYFELASTGEINDLFQFQTEIGQTTLKRVQ PETFEQFCAANSLMRLQSDGEEQPIDKYIRHKNDINEWYKEMREFGLNEEEIKIMEEHLLHDKGLNITQENSMGLSADNR ISNFTILEQNKLRKAIAKPKGSALDQIKSLFYSKGKECGAREVFLDYVWNVQFAMQFSYSFSLLHTTAYSVIGIQNLELN RRFPRIYWQTACLNVDSDSISTDSKDIDYEKIANGIGKMKENGVTVKLPSINKSTLEFSPDVEHNAIVYGLKPVKNINNE IVDHIIANRPYHSLDDVLTKLYDTKLITNKHLISIVKSGMLDEFGERKKIMMDVVKYITDLKTNLTLANIKLLLEADILS ERPEYELVLLRENIKNKVLRKVQTGKSKTKHKIFKVEDTELYDRLIGNEAIVNVVGSYYEVDEKEFKKIFDKKTKDLKEW LKTDKPIELANRYVLNEAWKKHALGNYSSWEMETLSFYYHKHELYNVNKETYDITDFKELPVDPVVADVFKFKGREMPKY EIVNIAGTVIAKNAPKKSVTILATDGSVVTIKYHGNFSYYDKTSKLNGSVVEESWFKKGNKLIFSGFRRGGQFVSKKYKD TSTSSSTKLIESISKDGVLRYKLERDYL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SERP1537 | YP_189102.1 | DNA polymerase III, alpha subunit | Not tested | ¥ÕSP¥â | Protein | 0.0 | 100 |
