Name : LMOf2365_1786 (LMOf2365_1786) Accession : YP_014380.1 Strain : Listeria monocytogenes F2365 Genome accession: NC_002973 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium:neurotransmitter symporter family protein Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG0733 EC number : - Position : 1812799 - 1814154 bp Length : 1356 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00209 DNA sequence : ATGCAAGAAAACAGAGAAGAATGGGGCTCAAAAGTCGGGTTTATATTAGCATCCGCTGGGTCCGCAATAGGAATTGGCGC GATTTGGAAACTGCCTTATGTGGCTGCAACTGCAGGAGGTGGCGCATTTTTCTTATTGTTTTTAGTTTTAACTTTACTCG TTGTGATGCCACTTTTAATTGCAGAATTTGTGATTGGACGAGGCTCTGGCGGAGATGCTGTTCAAGCTTATAAAACACTC GCGCCCGGAACAAAGTGGAATTTACTTGGAAAATTAGGCGTTGTAGGCGCAAGTATTTTATTTTCGTTTTATAGCGTAGT TGGTGGTTGGATTATCACTTACTTAATTAAAACACTTGCTGGCGGGATTGCTGGCGAAAATCAAGCAAGTCTGCTGCATG ATTTCCAAGTGACGACAGCTAACCCGTGGATATCAGTTGGCGCAACGATTCTCTTTATTTTACTAAATGTCATTGTTATT AGCCGCGGAGTTGTTAGTGGAATTGAAAAAATGAGTAAGTTTATGATGCCAGCTCTATTTATTTTATTTATTGTTTTAAT TATCAGGTCCTTAACACTACCTGGTGCGATGGAAGGTGTCGCATTTTTCTTACGTCCAGATTTTAGTCATTTCACAGCGC AAACGGTTCTTATAACGCTTGGTCAGGCCTTCTTCTCACTCAGTGTGGGGATTTCAGTAATGGTGACCTATAGTTCTTAT TTAAATCGGTCGACTAGTTTACCGCAGTCTGCCATTTCGGTTTCGCTTATGAATGTGTTTGTGTCGCTTCTTGCGGGATT GGCCATTTTCCCGGCAGCATTTTCGTTTAATATTACACCAGATGCGGGACCTGGATTGCTATTCGTTATTTTACCTTCGA TCTTCAATCAAATGCCCTTTGGGATGTTGTTCTTTATTATTTTCTTGATTTTATTCTTATTCGCCGCATTAACCTCTAGT TTCTCGATGCTTGAAGCAACGGTTGCGCCACTGATGAATGCGGGTGTTAATCGTAAAAAAGCAAGTCTTTGGATGGGGCT CGTGATTGTCTTGATGGCTATTCCAAGTGCGCTTAGTTTTGGCGTTTGGAGCGATGTTCAGATTTTCGGACTAAGTATTT TTGATGCTGCCGATTATCTTGTGTCGAATATTATCTTGCCAGTTGGTGCTTTATTTATCGCAATTTTCGTTGGTTACCGA TTACCTCGTGAATTACTTTTAAAAGAATTTACCACAAGCAGCCATTTTGGAAAAAAAGTGTTTATTCTTTGGCTCTTTCT TATTAAATATATTGCACCAATCGCGATTATTTTCGTCTTCCTCTCCGCAACTGGTTTAATCGATTTTCTGTTTTAA Protein sequence : MQENREEWGSKVGFILASAGSAIGIGAIWKLPYVAATAGGGAFFLLFLVLTLLVVMPLLIAEFVIGRGSGGDAVQAYKTL APGTKWNLLGKLGVVGASILFSFYSVVGGWIITYLIKTLAGGIAGENQASLLHDFQVTTANPWISVGATILFILLNVIVI SRGVVSGIEKMSKFMMPALFILFIVLIIRSLTLPGAMEGVAFFLRPDFSHFTAQTVLITLGQAFFSLSVGISVMVTYSSY LNRSTSLPQSAISVSLMNVFVSLLAGLAIFPAAFSFNITPDAGPGLLFVILPSIFNQMPFGMLFFIIFLILFLFAALTSS FSMLEATVAPLMNAGVNRKKASLWMGLVIVLMAIPSALSFGVWSDVQIFGLSIFDAADYLVSNIILPVGALFIAIFVGYR LPRELLLKEFTTSSHFGKKVFILWLFLIKYIAPIAIIFVFLSATGLIDFLF |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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SAS0416 | YP_042543.1 | sodium:neurotransmitter symporter family protein | Not tested | vSa¥á | Protein | 2e-60 | 46 |