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Name : qoxB (LMOf2365_0017) Accession : YP_012629.1 Strain : Listeria monocytogenes F2365 Genome accession: NC_002973 Putative virulence/resistance : Unknown Product : quinol oxidase AA3 subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 19426 - 21405 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : identified by similarity to SP:P34956; match to protein family HMM PF00115 DNA sequence : ATGAAATGGAATGAGTTTATCGTAACTGGCGACCCAATGATTTTAGGCGCGCAGATTTCTATCGTACTTGTAAGTATTGG TGTTGTTGCGTTACTAACTTATACAAAAAAATGGAAGTGGCTCATGAAAGAGTGGATTTCTTCCGTTGATCATAAAAAAA TTGGTATTATGTACTTGCTTGCTGCTGTCTTAATGTTTTTCCGTGGTGGTGTGGATGCGCTAATGATGCGTACCCAGCTC GCTTTACCGGATATGAAATTTTTAGACGCACAGCATTACAATGAAGTTTTTTCTACACATGGAACGATTATGATTTTATT TATGGCGATGCCGTTTATCATCGGATTGATGAACATTGCCGTACCACTTCAAATTGGTGCGCGTGATGTAGCATTTCCAT TTTTAAACAACTTAAGTTTTTGGACGTTCTTTATGGGAGCGATGCTATTTAACTTATCATTCGTAATTGGTGGTTCGCCA GATGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTTGCGACAGATTTTAGCGCTGGATATGGAATTAACTTCTATCTTCTAGGTGT TCAAATCGCTGGTATTGGTACGCTGATGACGGGGATTAACTTTTTCGTCACGATTTTAAGAATGCGTACAAAAGGTATGA CGTTAATGAAAATGCCAATGTTTACTTGGTCTTCATTAATTACAAGTTTGATCATTATTTTCGCTTTCCCAGTTTTAACA GTGGCACTTGCTTTGATGTCATTTGACCGACTGTTTGGGACAGCATTCTTCACACTCACGAATGGCGGGCTCCCAATGAT GTGGGCCAACTTGTTCTGGGTTTGGGGTCATCCGGAAGTATATATTGTTATTTTGCCAGCTTTCGGTATTTTCTCAGAGA TTATTTCTACTTTCTCGAGGAAAAAATTATTCGGTTATCCGGCGATGGTTGCCGCGATGGCAGTTATTTCTTTACTAAGT TTCCTAGTTTGGGTCCATCACTTCTTTACAATGGGATCAGGGGCGCTTGTTAACTCCTTCTTCTCCATTACAACGATGAT GATTGCGATACCGACCGGGATTAAGATATTCAACTGGCTCTTTACGATGTACAAAGGGCGAATAACCTTTACAACGCCAA TGCTTTGGTCGCTTGCCTTTATCCCTAACTTTGTTGTTGGTGGGGTAACTGGGGTTATGCTTGCGATGGCTGCAGCCGAT TATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTATCCCATTTCCACTACGTATTAATTGCTGGAACTGTGTTCTCCTGCTTTGC CGGGCTTACATACTGGTATCCAAAAATGGTCGGTTACAGACTAAATGAAAAAATTGGTAAATGGTTCTTCTGGATTTTCG TTGTTGGATTTAACGTTTGTTTCTTCCCGCAATATTTCCTAGGACTAGATGGTATGCCGCGTCGTATTTACACTTACGTA CAAGGTGATGGCTGGACAACGCTTAACTTTATCTCTACTGTGGGCGGATTCTTGATGGGTGTAGCATTCTTAGTTCTTTG CTACAACATCTACTACAGCTACAAAAACTCTAAACGTGAAGTTACTGGTGACCCGTGGGATGCTCGTACGCTTGAATGGG CTACAAGTTCCGCTGTTCCTCCAAAATATAACTTTGCTGTTTTACCTGAATGGAATGACTTGGATGATTTCTGGAATAGA AAACAAAAAGGCGATCCATATGTAAATGATAAAAATTATAAACCAATCCATATGCCAAGTAATACCATGGTTGGGTTTGT AATGTCTGTCTTCTTCTTCATTGCAGGTTTCGGACTAGTCTTCTACTGGTACTGGATGGGAATTATTGGCCTAGTTGGTA TTTTAGGATGTATGATTTATCGTTCATTCCAAAATAACGATGGTTACCACGTTGAAGTGGACGAAATTAAAGCAACAGAA GAACATAATGCGCGCGAACTTGCGACTGGTGTGAAGGAGGGTAACCCATGGAATCTGTAG Protein sequence : MKWNEFIVTGDPMILGAQISIVLVSIGVVALLTYTKKWKWLMKEWISSVDHKKIGIMYLLAAVLMFFRGGVDALMMRTQL ALPDMKFLDAQHYNEVFSTHGTIMILFMAMPFIIGLMNIAVPLQIGARDVAFPFLNNLSFWTFFMGAMLFNLSFVIGGSP DAGWTNYAPLATDFSAGYGINFYLLGVQIAGIGTLMTGINFFVTILRMRTKGMTLMKMPMFTWSSLITSLIIIFAFPVLT VALALMSFDRLFGTAFFTLTNGGLPMMWANLFWVWGHPEVYIVILPAFGIFSEIISTFSRKKLFGYPAMVAAMAVISLLS FLVWVHHFFTMGSGALVNSFFSITTMMIAIPTGIKIFNWLFTMYKGRITFTTPMLWSLAFIPNFVVGGVTGVMLAMAAAD YQYHNTYFLVSHFHYVLIAGTVFSCFAGLTYWYPKMVGYRLNEKIGKWFFWIFVVGFNVCFFPQYFLGLDGMPRRIYTYV QGDGWTTLNFISTVGGFLMGVAFLVLCYNIYYSYKNSKREVTGDPWDARTLEWATSSAVPPKYNFAVLPEWNDLDDFWNR KQKGDPYVNDKNYKPIHMPSNTMVGFVMSVFFFIAGFGLVFYWYWMGIIGLVGILGCMIYRSFQNNDGYHVEVDEIKATE EHNARELATGVKEGNPWNL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-90 | 45 |
