|
Name : SAS0084 (SAS0084) Accession : YP_042208.1 Strain : Staphylococcus aureus MSSA476 Genome accession: NC_002953 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease 1 Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 96314 - 97906 bp Length : 1593 bp Strand : + Note : Ortholog of S. aureus MRSA252 (BX571856) SAR0113 DNA sequence : ATGACACTACTTACTGTAAATCCATTCGATAATGTTGGATTATCAGCCTTAGTTGCAGCAGTACCTATTATTTTATTTTT ATTATGCTTAACCGTTTTTAAAATGAAAGGCATTTATGCAGCATTGACAACTTTGGTTGTTACATTGATTGTGGCTTTAT TTGTATTTGAATTACCAGTGCGTGTATCAGCAGGTGCGATTACAGAAGGCGTTGTTGCCGGTATTTTCCCAATAGGATAT ATCGTTTTAATGGCAGTTTGGTTATATAAAGTTTCTATTAAAACAGGACAATTTTCTATTATTCAAGATAGTATTGCAAG TATTTCAGAGGACCAAAGAATCCAACTATTATTAATTGGATTTTGTTTCAACGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTGCCAATTGCGATTTGTGCAGTATTATTAATTCAACTTGGATTTGAACCATTAAAAGCAGCGATGTTATGCTTAATT GCTAATGGTGCGGCGGGTGCCTTTGGTGCAATTGGTTTACCAGTTAGTATTATTGATACGTTTAACTTAAGTGGAGGCGT TACAACATTAGATGTTGCGAGATATTCAGCATTAACACTTCCAATTTTAAACTTTATTATCCCATTTGTTTTAGTATTCG TTATAGATGGCATGAAAGGTATTAAAGAAATTTTACCTGTCATTTTAACAGTGAGTGGTACATATACTGGATTACAATTA TTATTAACAATATTCCATGGTCCAGAACTAGCAGACATTATCCCATCACTAGCAACAATGGTGGTGTTAGCATTTGTTTG TCGTAAATTTAAACCGAAAAACATTTTCAGGTTGAAAGAATCAGAACATAAAATTCAAAAACGAACGCCTAAAGAAATTG TCTTTGCTTGGAGTCCGTTCGTCATTTTAACTGCCTTTGTTTTAGTATGGAGTGCACCATTCTTCAAAAAATTATTCCAA CCTGGAGGTGCACTTGAAAGTTTAGTAATAAAATTGCCAATTCCAAATACTGTGAGTGATTTATCGCCTAAAGGAATTGC GTTGCGTCTCGATTTAATTGGTGCAACTGGGACAGCGATTTTATTAACAGTAATTATTACAATTTTAATTACGAAGCTAA AATGGAAAAGTGCAGGTGCTTTATTGGTCGAAGCAATTAAAGAATTATGGTTACCGATCCTTACAATTTCAGCTATCCTA GCTATTGCTAAAGTTATGACATACGGTGGTTTGACTGTAGCAATTGGACAAGGTATTGCTAAAGCTGGAGCAATTTTCCC ATTATTCTCTCCAGTATTAGGTTGGATTGGTGTGTTTATGACTGGTTCAGTTGTAAATAACAATACTTTATTCGCACCTA TTCAAGCGACAGTAGCACAACAAATTTCAACAAGCGGTTCATTACTTGTGGCAGCTAACACTGCAGGTGGTGTAGCAGCG AAACTTATTTCACCACAATCAATTGCCATTGCGACTGCAGCTGTTAAAAAAGTTGGTGAAGAATCTGCATTATTAAAAAT GACGCTAAAATACAGTATTATATTTGTTGCTTTTATTTGTGTTTGGACGTTTATACTAACGTTAATATTCTAA Protein sequence : MTLLTVNPFDNVGLSALVAAVPIILFLLCLTVFKMKGIYAALTTLVVTLIVALFVFELPVRVSAGAITEGVVAGIFPIGY IVLMAVWLYKVSIKTGQFSIIQDSIASISEDQRIQLLLIGFCFNAFLEGAAGFGVPIAICAVLLIQLGFEPLKAAMLCLI ANGAAGAFGAIGLPVSIIDTFNLSGGVTTLDVARYSALTLPILNFIIPFVLVFVIDGMKGIKEILPVILTVSGTYTGLQL LLTIFHGPELADIIPSLATMVVLAFVCRKFKPKNIFRLKESEHKIQKRTPKEIVFAWSPFVILTAFVLVWSAPFFKKLFQ PGGALESLVIKLPIPNTVSDLSPKGIALRLDLIGATGTAILLTVIITILITKLKWKSAGALLVEAIKELWLPILTISAIL AIAKVMTYGGLTVAIGQGIAKAGAIFPLFSPVLGWIGVFMTGSVVNNNTLFAPIQATVAQQISTSGSLLVAANTAGGVAA KLISPQSIAIATAAVKKVGEESALLKMTLKYSIIFVAFICVWTFILTLIF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-72 | 43 |
