Name : SAS0432 (SAS0432) Accession : YP_042559.1 Strain : Staphylococcus aureus MSSA476 Genome accession: NC_002953 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycosyl hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 483006 - 484646 bp Length : 1641 bp Strand : + Note : Ortholog of S. aureus MRSA252 (BX571856) SAR0474 DNA sequence : GTGTCGAAAGAAATAGATTGGAGAAAATCCGTTGTATATCAAATTTATCCTAAGTCGTTTAATGATACGACGGGGAATGG TATAGGAGATATCAATGGAATTATAGAAAAATTGGATTATATCAAGTTATTGGGTGTTGATTATATTTGGTTAACACCAG TGTATGAATCACCGATGAATGATAATGGCTATGATATCAGCAATTATTTAGAAATCAATGAAGACTTTGGAACGATGGAT GATTTTGAAAAGTTAATCAAAGTTGCTCATCAAAAAGACTTGAAAGTGATGTTAGATATTGTCATTAATCATACGTCGAC GGAGCATGAATGGTTTAAAGAAGCCCGTAAATCTAAAGACAACCCTTATAGAGATTATTACTTTTTCAGATCATCTGAAG ACGGGCCGCCAACAAATTGGCATTCTAAATTCGGTGGTAATGCATGGAAGTTTGATTCTGAGACAGATGAATATTATTTA CATTTATTTGATGTCAGTCAAGCTGATTTAAATTGGGATAATCCGGAAGTACGTCAATCGTTATATCGCATAGTCAATCA TTGGATAGACTTCGGCGTTGATGGTTTTCGATTTGATGTCATTAACTTAATTTCTAAAGGTGAATTTAAGGACTCTGACA AAATAGGTAAAGAATTTTATACGGATGGTCCTAGAGTGCATGAGTTTCTGCATGAATTAAATCGTCAAACGTTTGGTAAC ACTGACATGATGACTGTAGGAGAAATGTCTTCGACGACGATTGAAAATTGTATTAAGTATACACAGCCAGAACGCCAAGA ATTGAATAGTGTTTTTAATTTTCATCATCTAAAGGTTGATTATGTTGATGGTGAAAAGTGGACAAATGCGAAGCTTGATT TCCATAAGTTAAAGAAAATTCTGATGCAATGGCAACGAGGTATTTATGACGGTGGCGGATGGAACGCGATTTTCTGGTGT AATCATGATCAGCCACGGGTAGTGTCTAGATTTGGTGATGATACGTCGGAAGAGATGAGGATACAAAGTGCTAAAATGTT AGCTATCGCACTGCATATGTTGCAAGGGACGCCATATATTTACCAAGGTGAAGAAATTGGTATGACGGACCCACATTTTA CATCAATAGCACAATATCGCGATGTTGAATCGATTAATGCCTACCATCAGTTGTTAAGTGAAGGGCATGCTGAAGCGGAT GTGTTAACGATTTTAGGACAGAAGTCACGAGACAATTCGAGAACGCCTATGCAATGGAGTGATGATGTTAATGCTGGATT TACAGCTGGTAAGCCTTGGATTGATATTTCGGAAAATTATCATCAGGTCAACGTTAGACAAGCACTTCAGAATAAAGAGT CTATTTTCTATACGTATCAAAAATTAATACAATTAAGACATACGCATGATATTATTACGTATGGAGACATTGTGCCACGT TTTATGGATCATGATCATTTATTTGTTTATGAACGTCATTATAAGAATCAACAATGGCTAGTAATTGCGAATTTCTCAGC ATCGGCTGTTGATTTGCCAGAAGGATTGGCTAGAGAAGGTCGTGTTGTGATTCAAACAGGCACAGTGGAAAATAATACGA TAAGCGGGTTTGGTGCAATTGTAATCGAAACAAACGCGTAA Protein sequence : MSKEIDWRKSVVYQIYPKSFNDTTGNGIGDINGIIEKLDYIKLLGVDYIWLTPVYESPMNDNGYDISNYLEINEDFGTMD DFEKLIKVAHQKDLKVMLDIVINHTSTEHEWFKEARKSKDNPYRDYYFFRSSEDGPPTNWHSKFGGNAWKFDSETDEYYL HLFDVSQADLNWDNPEVRQSLYRIVNHWIDFGVDGFRFDVINLISKGEFKDSDKIGKEFYTDGPRVHEFLHELNRQTFGN TDMMTVGEMSSTTIENCIKYTQPERQELNSVFNFHHLKVDYVDGEKWTNAKLDFHKLKKILMQWQRGIYDGGGWNAIFWC NHDQPRVVSRFGDDTSEEMRIQSAKMLAIALHMLQGTPYIYQGEEIGMTDPHFTSIAQYRDVESINAYHQLLSEGHAEAD VLTILGQKSRDNSRTPMQWSDDVNAGFTAGKPWIDISENYHQVNVRQALQNKESIFYTYQKLIQLRHTHDIITYGDIVPR FMDHDHLFVYERHYKNQQWLVIANFSASAVDLPEGLAREGRVVIQTGTVENNTISGFGAIVIETNA |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-119 | 49 |