Gene Information

Name : SAS1878 (SAS1878)
Accession : YP_043992.1
Strain : Staphylococcus aureus MSSA476
Genome accession: NC_002953
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG5412
EC number : -
Position : 2038044 - 2042693 bp
Length : 4650 bp
Strand : -
Note : Ortholog of S. aureus MRSA252 (BX571856) SAR2050

DNA sequence :
ATGCCTAATCCTATAGGTAATATGGTCATAAAGGTTGATTTAGATGGTTCTGGATTCAATAGAGGTGTGACAGGTTTAAA
TAGGCAAATGAAAATGGTTTCGCGTGAGCTTTCGGCTAATTTATCACAATTTTCTAGATATGATAATTCATTAGAAAAGT
CGAAGATAAAAGTCGAAGGTTTGAGTAAAAAACAAAAAGTTCAAGCCCAGATTACTAAAGAGCTGAAAGATAGTTATGAC
AAACTTAGTAAAGAAACTGGTGAAAACAGTGCAAAGACACAAGCTGCGGCTGCTAAATACAATGAAGCTTACGCTAAATT
AAACCAATATGAGCGAGAGTTAAACCAAGCCACACAAGAATTAAAAGACATGCAAAGAGAGCAGAAAGCATTAAATACTG
CAATGGGAAAACTTGGTACCAACTTTAATAATTTTGGTCCTAAACTTCAAGAAATTGGTAACAGTATGAAAAATGTAGGC
CGTAACATGACTATGTATGTAACTGCGCCGGTGGTTGCTGGGTTTGCTGTAGCAGCTAAAAAAGGTATTGAATTCGATGA
CAGTATGAGAAAAGTTAAAGCAACTTCAGGTGCTACTGGGGAAGAGTTTGAAGCTTTGAAGAAAAAGGCTCGCGAAATGG
GTGCAACAACAAAATTTAGTGCATCAGATTCGGCTGAAGCATTAAATTACATGGCACTTGCTGGTTGGGATTCTAAGCAA
ATGATGGAAGGTTTAAGCGGAGTTATGGATTTAGCGGCAGCATCTGGCGAAGAACTGGGAGCAGTAAGTGACATTGTTAC
AGATGGACTAACGGCATTTGGTTTAAAAGCAAAGGATAGTGGTCATTTTGCGGACGTTTTAGCACAAACTAGCTCGAAGG
CAAATACGGATGTTAGAGGGCTCGGAGAAGCTTTTAAATATGTCGCTCCTGTAGCAGGTGCGTTAGGTTACACGATTGAA
GATACATCTATTGCGATAGGTTTAATGAGTAATGCTGGTATCAAAGGTGAAAAAGCAGGTACAGCGTTACGAACAATGTT
CACCAATCTTTCAAGTCCAACTAGAGCTATGGGGAATGAAATGGAACGCTTAGGAATATCTATTACAGATAGTAATGGGA
AAATGATTCCTATGCGAAAGCTTTTAGACCAACTGAGGGAAAAATTTAAACATCTTTCAAAAGACCAACAAGCTAGTTCT
GCAGCTACAATATTTGGTAAAGAAGCGATGTCAGGAGCATTAGCGATTATAAATGCTTCTGATGAAGACTATCAAAAGTT
AACCAAATCTATAGATTCATCTACCGGCGCATCTAAAAGAATGGCCGATACAATGGAATCTGGTTTAGGTGGGAAATTAA
GAACTTTAAGGTCGCAATTAGAAGAACTAGCCCTAACGATTTATGACAGAATAGAACCAGCACTAAAGATTATAGTAAGT
GCTTTTAGCAAAGTAGTGACATGGGTTACTAAATTACCAACGTCAATTCAATTAGCGGTTGTTGAGTTTGGATTATTTGT
AGCAGTTTTAGGTCCTTTAGTTTTTATGTTCGGTTTATTTATCAGCGTGATGGGGAATGCAATGACAGTTTTAGGACCCT
TGTTAATAAACGTTAATAAAGCTAGTGGTTTATTCGCGTTTTTAAGAACTAAAATCGCATCACTTGTTAAACTATTTCCG
ATTTTAGGTGTGTCGATATCAAGTTTAACGTTGCCTATAACATTAATTGTAGGTGCATTAGTTGGTATTGGCATAGCTTT
CTATCAAGCTTATAAACGTTCAGAAACTTTTAGAAATATTGTAAATCTGGCAATCTCTGGTGTAGCAAACGCATTTAAAG
CAGCTAAACTAGCGTTACAAGGTTTCTTTGATTTATTCAAAGGTGATAGTAAAGGCGCGGTTACCCTAGAGAAGATATTT
CCACCCGAAACTGTAGCAGGAATACAAAATGTAGTTAATACGATTAGAACAACTTTCTTTAAAGTAGTTGATGCAATCGT
TGGTTTCGCCAAAGAGATAGGCGCTCAATTAGCCTCTTTCTGGAAAGAGAACGGCTCAGAAATAACACAAGCTTTGCAAA
ATATAGCTGGTTTCATTAAAGCAACCTTTGAATTTATTTTTAACTTTATTATTAAACCAATCATGTTTGCGATTTGGCAA
GTGATGCAATTTATTTGGCCGGCGGTTAAAGCTTTGATTGTCAGCACTTGGGAAAATATCAAAGGTGTAATACAAGGTGC
TTTAAATATAATACTTGGCTTTATTAAGTTCTTTTCAAGTTTATTCACTGGTAATTGGCGAGGTGTTTGGGACGGTATTG
TGATGATACTAAAAGGCACTGTGCAGTTAATTTGGAATTTAATACAACTGTGGTTTGTAGGTAAGATTCTAGGTGTTGTT
AGATACTTTGGTGGATTGCTTAAAGGTTTAATATCCGGTATCTGGGGTGTTATCAAAGGTATTTTCACAAAATCATTATC
TGCAATTTGGAATGCAACGAAAAGTATTTTTGGTTTCTTATACAATAGTGTTAAATCTATTTTCACTAATATGAAAAACT
GGTTATCTAGTACGTGGAATAATATCAAAAGCAATACCGTCGGCAAGGCTCATTCGTTATTTACGGGTGTAAGGTCTAAA
TTCACAAGTTTATGGAATGCGACGAAAGATATATTTACTAAATTAAGAAATTGGATGTCAAACATCTGGAACTCTATTAA
AGATAACACGGTAGGTATAGCTGGTCGTTTGTGGGATAAAGTGCGTAACATCTTTGGAAGCATGCGTGACGGTTTAAAAT
CTATCATTGGTAAAATTAAAGATCATATCGGTGGTATGGTAGACGCTGTTAAAAGAGGTCTTAATAAATTAATTGAAGGT
TTAAACTGGGTCGGTGGTAAGTTGGGTATGGACAAAATACCGAAGTTACACACTGGTACTGAACATACGCATACTACTAC
AAGATTAGTTAAGAACGGTAAGATTGCGCGGGATACGTTCGCTACGGTTGGGGATAAAGGACGTGGAAATGGTCCGAATG
GTTTCAGAAATGAAATGATTGAATTCCCTAATGGCAAACGGGTACTTACGCCTAATACAGATACGACAGCGTACTTACCT
AAAGGTTCAAAAGTATATAACGGCGCACAAACTTATTCAATGTTAAATGGAACGCTTCCAAGATTTAGCATAGGTACTAT
GTGGAAAGATATTAAATCCGGTGCATCATCGGCATTTAACTGGACAAAAGATCAAATAGGTAAAGGTACAAAGTGGCTTG
GCGATAAAGTTGGTGATGTCATGGACTTTATCGATAATCCAGGCAAACTTTTAAATTATGTACTTCAAGCGTTTGGAGTT
GATTTCAGTTCTCTAACTAAAGGTATGGGTATTGCTGGCGATATAACAAAAGCTGCATGGTCTAAGATTAAGAAAAGTGC
AATCAAGTGGCTTGAGGATGCTTTCGCAGAGTCGGGTGATGGCGGTGTATTAGATATGAATAAATTACGTTACTTATACG
GTCACACTGCTGCTTATACACGAGAAACCGGACGCCCATTCCATGAAGGTCTGGATTTTGATTACATTTACGAACCTGTT
CCATCAACCATTAATGGTAGAGCACAAGTTATGCCTTTTCATAATGGTGGTTATGGAAAATGGGTGAAAATTGTAAAGGG
CGCCTTAGAAGTTATTTATGCACATTTATCTAAATATAAAGTTAAAACTGGTCAACAAGTTAGGGTCGGCCAGACTGTTG
GTATATCGGGGAATACGGGGTTTAGTACAGGACCTCACTTACATTATGAGATGCGTTGGAATGGAAGACATAGAGACCCG
TTACCGTGGTTAAGAAAGAATAATGGGGGCGGCAAAAGTACACCCGGTGGTAATGGTGCAGCTAATGCTAGACGAGCTAT
TAAGGCTGCTCAAAATATTTTAGGAGGAAGGTATAAGGCGAGTTGGATTACTAACGAGATGATGCGTGTTGCGAGTCGTG
AATCCAATTATACAGCTAATGCAGTCAATAATTGGGATAGCAACGCAAGAGCTGGTATACCTTCAAGAGGTATGTTCCAA
ATGATAGATCCTTCATTTAGAGCGTACGCAAAGTCGGGTTACAATAATCCTCTCAACCCAACTCATCAAGCTATATCGGC
TATGAGATATATTGTGGGTAAATGGGTACCAAGAACAGGCTCATGGAGAGCTGCGTTCAAACGCGCTGGTGATTACGCAT
ATGCTACTGGTGGCAAAGTCTATAACGGATTGTACCACTTAGGGGAAGAAGGATATCCAGAGTGGATAATACCTACTGAT
CCAAGTAGAGCGAACGAAGCACACAAATTATTAGCTTTAGCTGCTAACGATATTGATAACCGCTCTAAAAATAAGCGACC
AAACAACTTACCAAATCCAAGTATAAGTAATAGTGATACAAACTATATTCATACATTGGAGAATAAACTGGATGCGGTTA
TTAATTGTTTGGTTAGTTTGGTTGAGTCTAATCAAGTTATTGCAGATAAGGATTACGAACCAGTTATTAATAAGTATGTG
TTTGAAGATGAGGTAAATAATTCTATCGATAAACGAGAGCGTCACGAATCTACAAGAGTTAGATTTAGAAGAGGAGGCAC
GATAATCTAA

Protein sequence :
MPNPIGNMVIKVDLDGSGFNRGVTGLNRQMKMVSRELSANLSQFSRYDNSLEKSKIKVEGLSKKQKVQAQITKELKDSYD
KLSKETGENSAKTQAAAAKYNEAYAKLNQYERELNQATQELKDMQREQKALNTAMGKLGTNFNNFGPKLQEIGNSMKNVG
RNMTMYVTAPVVAGFAVAAKKGIEFDDSMRKVKATSGATGEEFEALKKKAREMGATTKFSASDSAEALNYMALAGWDSKQ
MMEGLSGVMDLAAASGEELGAVSDIVTDGLTAFGLKAKDSGHFADVLAQTSSKANTDVRGLGEAFKYVAPVAGALGYTIE
DTSIAIGLMSNAGIKGEKAGTALRTMFTNLSSPTRAMGNEMERLGISITDSNGKMIPMRKLLDQLREKFKHLSKDQQASS
AATIFGKEAMSGALAIINASDEDYQKLTKSIDSSTGASKRMADTMESGLGGKLRTLRSQLEELALTIYDRIEPALKIIVS
AFSKVVTWVTKLPTSIQLAVVEFGLFVAVLGPLVFMFGLFISVMGNAMTVLGPLLINVNKASGLFAFLRTKIASLVKLFP
ILGVSISSLTLPITLIVGALVGIGIAFYQAYKRSETFRNIVNLAISGVANAFKAAKLALQGFFDLFKGDSKGAVTLEKIF
PPETVAGIQNVVNTIRTTFFKVVDAIVGFAKEIGAQLASFWKENGSEITQALQNIAGFIKATFEFIFNFIIKPIMFAIWQ
VMQFIWPAVKALIVSTWENIKGVIQGALNIILGFIKFFSSLFTGNWRGVWDGIVMILKGTVQLIWNLIQLWFVGKILGVV
RYFGGLLKGLISGIWGVIKGIFTKSLSAIWNATKSIFGFLYNSVKSIFTNMKNWLSSTWNNIKSNTVGKAHSLFTGVRSK
FTSLWNATKDIFTKLRNWMSNIWNSIKDNTVGIAGRLWDKVRNIFGSMRDGLKSIIGKIKDHIGGMVDAVKRGLNKLIEG
LNWVGGKLGMDKIPKLHTGTEHTHTTTRLVKNGKIARDTFATVGDKGRGNGPNGFRNEMIEFPNGKRVLTPNTDTTAYLP
KGSKVYNGAQTYSMLNGTLPRFSIGTMWKDIKSGASSAFNWTKDQIGKGTKWLGDKVGDVMDFIDNPGKLLNYVLQAFGV
DFSSLTKGMGIAGDITKAAWSKIKKSAIKWLEDAFAESGDGGVLDMNKLRYLYGHTAAYTRETGRPFHEGLDFDYIYEPV
PSTINGRAQVMPFHNGGYGKWVKIVKGALEVIYAHLSKYKVKTGQQVRVGQTVGISGNTGFSTGPHLHYEMRWNGRHRDP
LPWLRKNNGGGKSTPGGNGAANARRAIKAAQNILGGRYKASWITNEMMRVASRESNYTANAVNNWDSNARAGIPSRGMFQ
MIDPSFRAYAKSGYNNPLNPTHQAISAMRYIVGKWVPRTGSWRAAFKRAGDYAYATGGKVYNGLYHLGEEGYPEWIIPTD
PSRANEAHKLLALAANDIDNRSKNKRPNNLPNPSISNSDTNYIHTLENKLDAVINCLVSLVESNQVIADKDYEPVINKYV
FEDEVNNSIDKRERHESTRVRFRRGGTII

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
MW1895 NP_646712.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 100
SA1766 NP_375064.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 53
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAKOR_01932 YP_008492120.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAV1955 NP_372479.1 phi PVL ORF 15 and 16-like protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAOV_1114 YP_005736609.1 Phage tail length tape-measure protein Not tested ¥ÕSa2 Protein 0.0 51