Name : SAS1618 (SAS1618) Accession : YP_043737.1 Strain : Staphylococcus aureus MSSA476 Genome accession: NC_002953 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1740769 - 1743399 bp Length : 2631 bp Strand : - Note : Ortholog of S. aureus MRSA252 (BX571856) SAR1769 DNA sequence : GTGAATAAATTAGTATTAATCGATGGTAATAGCTTAAGTTTTAGAGCTTTTTATGCATTACCTTTGTTATCAAACAAAGC AGGCATTCATACCAATGCAGTATATGGTTTTGCAATGTTACTAGAGAAGATTTTAAAAGAAGAAAAGCCAAATCATTTTT TAGTAGCGTTTGATGCAGGTAAAACGACTTTCAGACATGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGACGCCAGAAAACGCCG CCTGAACTAAGTGAGCAATTTCCTTATATTCGCCAATTATTAGATGCTTATCATATTAAACGTTATGAATTAGATAACTA TGAGGCAGATGATATTATCGGAACTTTAAGTAAAGAAGCAGATAAAGCGGGATTTCAGACAATTATTATTACGGGAGACC GAGATTTAACACAACTTGCAACGGATAATGTAACCATTTATTACACTAAAAAAGGTGTTACTGATGTTGATCATTATACA CCTGACTTTATTGCGGAAAAATACAACGGGTTAACACCTAATCAAATTATTGATATGAAAGGATTAATGGGAGATACTTC TGATAATATACCAGGTGTTGCAGGTGTTGGAGAGAAAACAGCAATAAAATTGCTAAACCAATTTGACACAGTAGAAGGTG TCTATGAACATTTAGATGAAATTTCAGGTAAAAAGTTAAAAGAAAAACTTCAAAATAGCAAAGAAGATGCATTAATGAGT AAAGAATTAGCAACGATTAATGTAGATAGTCCGATTGAAGTAAAACTTGAAGATACGTTAATGACTCATCAAGATGAACA ACAAGAAAAAATCGAATTGTTTAAGAAGTTAGAATTCAAACAATTGTTGGCTGACATTGATCAATCAGCAAGCGTTGAAG ATGCAATAGAAAAGACATTTGAAATTGAAACGTCTTTTGATAATATTGATTTTACTTCATTGAAAGAAGCGGCCATCCAT TTCGAATTAGACGGTGGTAACTATTTGCGAAATAATATTTTAAAATTCTCTTTATTTACAGGTGAGAAACATATTGTAAT TAATGCGGATGACATAAATAATTATGTCGAACTAGTTTCATGGTTAGAAAATCCGAATTCGAAAAAAGTCGTATATGATG CTAAAAAAACATATGTAGCATCACATAGATTGGGGATTGATATTCAAAATATTTCTTTCGATATTATGTTGGCCAGTTAT ATAATTGATCCATCTCGTACGATTAGTGATGTTCAATCAGTTGTTTCATTGTACGGTCAAAGTTTTGTGAAAGACGATGT GAGTATATATGGAAAAGGTAAGAAATTTAAGGTACCTGAAGATGATGTTTTAAATCCATATGTTGCTTCTATTACTGATG CAATTTACTTTGCGAAACCAAATATGGATAAACAATTAGAAGAATACAATCAGGTAGAACTCTTGGCTGATTTAGAGCTA CCGCTAGCTAAGATTTTAAGTGAAATGGAAGAAATTGGTATATTTACAGATGTTCATGATTTAGAAGAAATGGAAAAAGA AATTCAAGAAAAATTAGACGTCTTGATTCGAAATATCCATGATGCAGCTGGTGAAGATTTTAATATAAATTCTCCTAAGC AATTAGGTGTTGTATTGTTTGAGACATTACAATTACCTGTTATTAAAAAGACGAAAACAGGATATTCTACTGCTGTAGAT GTCTTAGAGCAATTGCAAGGTGAACATCCTATCATTGATTATATTTTAGAATATCGTCAATTATCTAAGTTACAGTCTAC TTATGTTGAAGGATTGCAAAAGGTAATTAGTGATGATCAACGTATCCATACACGTTTTAATCAAACTTTAGCGCAAACTG GACGTTTATCAAGTGTAGATCCTAATTTACAAAATATTCCGGTTAGACTTGAAGAAGGGCGTAAAATAAGAAAAGCCTTT AAACCAACTTCAAAAGATAGCGTTATATTATCAGCAGATTATTCTCAAATTGAATTGCGCGTATTAGCACACATTACACA AGATGAGAGTATGAAAGAAGCATTTATCAACGGCGATGATATTCATACAGCAACTGCTATGAAAGTATTTGGTGTAGAAG CTGATCAAGTCGATAGTTTAATGCGTCGTCAAGCAAAAGCAGTTAACTTTGGAATTGTTTATGGGATAAGTGATTATGGT TTAAGTCAAAGTTTAGGTATTACTCGTAAAAAAGCAAAAGCATTCATTGATGATTATTTAGCTAGTTTCCCAGGTGTAAA ACAATATATGTCTGATATTGTAAAAGATGCCAAAGCTTTAGGTTACGTGGAAACATTGCTACATCGTCGACGCTATATTC CTGATATTACGAGTCGTAACTTTAATTTACGCGGCTTTGCTGAACGTACTGCTATGAATACGCCAATACAGGGCAGTGCT GCAGATATCATTAAACTGGCAATGGTTAAATTTGCTCAAAAAATGAAAGAGACAACATATCAAGCTAAACTATTATTACA AGTACACGATGAATTAATTTTTGAAGTACCTAAGTCAGAAGTAGATTCATTTAGTGAATTTGTAGAAGAGATAATGGAAA ATGCATTGCAATTAGATGTTCCATTAAAAGTAGACTCAAGTTATGGTGCAACTTGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKILKEEKPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQKTP PELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSKEADKAGFQTIIITGDRDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYT PDFIAEKYNGLTPNQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFDTVEGVYEHLDEISGKKLKEKLQNSKEDALMS KELATINVDSPIEVKLEDTLMTHQDEQQEKIELFKKLEFKQLLADIDQSASVEDAIEKTFEIETSFDNIDFTSLKEAAIH FELDGGNYLRNNILKFSLFTGEKHIVINADDINNYVELVSWLENPNSKKVVYDAKKTYVASHRLGIDIQNISFDIMLASY IIDPSRTISDVQSVVSLYGQSFVKDDVSIYGKGKKFKVPEDDVLNPYVASITDAIYFAKPNMDKQLEEYNQVELLADLEL PLAKILSEMEEIGIFTDVHDLEEMEKEIQEKLDVLIRNIHDAAGEDFNINSPKQLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVD VLEQLQGEHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAF KPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINGDDIHTATAMKVFGVEADQVDSLMRRQAKAVNFGIVYGISDYG LSQSLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKALGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSA ADIIKLAMVKFAQKMKETTYQAKLLLQVHDELIFEVPKSEVDSFSEFVEEIMENALQLDVPLKVDSSYGATWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 48 |