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Name : polA (SAR1769) Accession : YP_041156.1 Strain : Staphylococcus aureus MRSA252 Genome accession: NC_002952 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1832736 - 1835366 bp Length : 2631 bp Strand : - Note : Similar to Bacillus stearothermophilus DNA polymerase I PolA SW:DPO1_BACST (P52026) (876 aa) fasta scores: E(): 5.7e-169, 55.79% id in 880 aa, and to Bacillus subtilis DNA polymerase I PolA SW:DPO1_BACSU (O34996) (880 aa) fasta scores: E(): 2.2e-179, 59.6 DNA sequence : GTGAATAAATTAGTATTAATCGATGGTAATAGCTTAAGTTTTAGAGCTTTTTATGCATTACCTTTGTTATCAAACAAAGC AGGCATTCATACCAATGCAGTATATGGTTTTGCAATGTTACTAGAGAAGATTTTAAAAGAAGAAAAGCCAAATCATTTTT TAGTAGCGTTTGATGCAGGTAAAACGACTTTCAGACATGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGACGCCAGAAAACGCCG CCTGAACTAAGTGAGCAATTTCCTTATATACGCCAATTATTAGATGCTTATCATATTAAACGTTATGAATTAGATAACTA TGAGGCAGATGATATTATCGGAACTTTAAGTAAAGAAGCAGATAAAGCGGGCTTTCAGACAATTATTATTACGGGAGACC GAGATTTAACACAACTTGCAACGGATAATGTAACCATTTATTACACTAAAAAAGGTGTTACTGATGTTGATCATTATACA CCTGACTTTATTGCTGAAAAATACAACGGGTTAACACCTAATCAAATTATTGATATGAAGGGATTAATGGGAGATACTTC TGATAATATACCAGGTGTTGCAGGTGTTGGAGAGAAAACAGCAATAAAATTGCTGAACCAATTTGACACAGTAGAAGGTG TTTATGAACATTTAGATGAAATTTCAGGTAAAAAGTTAAAAGAAAAACTTCAAAACAGCAAAGAAAATGCATTAATGAGT AAAGAATTAGCAACGATTAATGTAGATAGTCCGATTGAAGTAAAACTTGAAGATACGTTAATGACTCATCAAGATGAACA ACAAGAAAAAATCGAATTGTTTAAGAAGTTAGAATTCAAACAATTGTTGGCTGACATTGATCAATCAGCAAGTGGTGAAG ATGCAATAGAAAAGACATTTGAAATTGAAACGTCTTTTGATAATGTTGATTTTACTTCATTGAAAGAAGCGACCATCCAT TTCGAATTAGACGGTGGCAACTATTTGCGAAATAATATTTTAAAATTCTCTTTATTTACAGGTGAGAAACATATTGTAAT TAATGCGGATGACATAATTAATTATGCTGAACTAGTTTCATGGTTAGAAAATCCGAATACGAAAAAAGTCGTATATGATG CTAAAAAAACATATGTAGCATCACATAGATTGGGAATTGATATTCAAAATATTTCATTCGATATTATGTTGGCCAGTTAT ATAATTGATCCATCTCGTACGATTAGTGATGTTCAATCAGTTGTTTCATTGTACGGTCAAAGTTTTGTGAAAGACGATGT GAGTATATATGGAAAAGGTAAGAAATTTAAGGTACCTGAAGATGATGTTTTAAATCCATATGTTGCTTCTATTACTGATG CAATTTACTTTGCGAAACCAAATATGGATAAACAATTAGAAGAATACAATCAGGTAGAACTCTTAGCTGATTTAGAGCTA CCGCTAGCTAAGATTTTAAGTGAAATGGAAGAAATTGGTATATATACAGATGTTCATGATTTAGAAGAAATGGAAAAAGA AATTCAAGAAAAATTAGACGTCTTGATTCGAAATATCCATGATGCAGCTGGTGAAGATTTTAATATAAATTCTCCTAAGC AATTAGGTGTTGTATTGTTTGAGACATTACAATTACCTGTTATTAAAAAGACGAAAACAGGATATTCTACTGCTGTAGAT GTCTTAGAGCAATTGCAAGGTGAACATCCTATCATTGATTATATTTTAGAATATCGTCAATTATCTAAGTTGCAGTCTAC TTATGTTGAAGGATTGCAAAAGGTAATTAGTGATGATCAACGTATCCATACACGTTTTAACCAAACTTTAGCGCAAACTG GACGTTTATCAAGTGTAGATCCTAATTTACAAAATATTCCGGTTAGACTTGAAGAAGGGCGTAAAATAAGAAAAGCCTTT AAACCAACTTCAAAAGATAGCGTTATATTATCAGCAGATTATTCTCAAATTGAATTGCGTGTATTAGCACACATTACACA AGATGAGAGTATGAAAGAAGCATTTATCAACGGCGATGATATTCATACAGCAACTGCTATGAAAGTATTTGGTGTAGAAG CTGATCAAGTCGATAGTTTAATGCGTCGTCAAGCAAAAGCGGTTAACTTTGGAATTGTTTATGGGATAAGTGATTATGGT TTAAGTCAAAGTTTAGGTATTACTCGTAAAAAAGCAAAAGCATTCATTGATGATTATTTAGCTAGTTTCCCAGGTGTAAA ACAATATATGTCTGATATTGTAAAAGATGCCAAAGCTTTAGGTTTCGTGGAAACATTGCTACATCGTCGACGCTATATTC CTGATATTACGAGTCGTAACTTTAATTTACGTGGCTTTGCTGAACGTACTGCTATGAATACGCCAATACAAGGCAGTGCT GCAGATATCATTAAACTGGCAATGGTTAAATTTGCGCAAAAAATGAAAGAGACAACATATCAAGCTAAACTATTATTACA AGTACACGATGAATTAATTTTTGAAGTACCTAAGTCAGAAGTAGATTCATTTAGTGAATTTGTAGAAGAGATAATGGAAA ATGCATTGCAATTAGATGTTCCATTAAAAGTAGACTCAAGTTATGGTGCAACTTGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKILKEEKPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQKTP PELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSKEADKAGFQTIIITGDRDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYT PDFIAEKYNGLTPNQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFDTVEGVYEHLDEISGKKLKEKLQNSKENALMS KELATINVDSPIEVKLEDTLMTHQDEQQEKIELFKKLEFKQLLADIDQSASGEDAIEKTFEIETSFDNVDFTSLKEATIH FELDGGNYLRNNILKFSLFTGEKHIVINADDIINYAELVSWLENPNTKKVVYDAKKTYVASHRLGIDIQNISFDIMLASY IIDPSRTISDVQSVVSLYGQSFVKDDVSIYGKGKKFKVPEDDVLNPYVASITDAIYFAKPNMDKQLEEYNQVELLADLEL PLAKILSEMEEIGIYTDVHDLEEMEKEIQEKLDVLIRNIHDAAGEDFNINSPKQLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVD VLEQLQGEHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAF KPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINGDDIHTATAMKVFGVEADQVDSLMRRQAKAVNFGIVYGISDYG LSQSLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKALGFVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSA ADIIKLAMVKFAQKMKETTYQAKLLLQVHDELIFEVPKSEVDSFSEFVEEIMENALQLDVPLKVDSSYGATWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 48 |
