Name : lldP1 (SAR0113) Accession : YP_039577.1 Strain : Staphylococcus aureus MRSA252 Genome accession: NC_002952 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease 1 Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 121907 - 123499 bp Length : 1593 bp Strand : + Note : Similar to Escherichia coli L-lactate permease LldP SW:LLDP_ECOLI (P33231) (551 aa) fasta scores: E(): 1.2e-49, 43.414% id in 539 aa, and to Bacillus halodurans L-lactate permease LctP TR:Q9K5Z9 (EMBL:AP001520) (524 aa) fasta scores: E(): 2.3e-115, 59.322 DNA sequence : ATGACACTACTTACTGTAAATCCATTCGATAATGTTGGATTATCAGCCTTAGTTGCAGCAGTACCTATTATTTTATTTTT ATTATGCTTAACCGTTTTTAAAATGAAAGGCATTTATGCAGCATTGACAACTTTGGTTGTTACATTGATTGTGGCTTTAT TTGTATTTGAATTACCAGCGCGTGTATCAGCAGGTGCGATTACAGAAGGCGTTGTTGCCGGTATTTTCCCAATAGGATAT ATCGTTTTAATGGCAGTTTGGTTATATAAAGTTTCTATTAAAACAGGACAATTTTCTATTATTCAAGATAGTATTGCAAG TATTTCAGAGGACCAAAGAATCCAACTATTATTAATTGGATTTTGTTTCAACGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTGCCAATTGCGATTTGTGCAGTATTATTAATTCAACTTGGATTTGAACCATTAAAAGCAGCGATGTTATGTTTAATT GCTAATGGTGCGGCGGGTGCCTTTGGTGCAATTGGTTTACCAGTTAGTATTATTGATACGTTTAACTTAAGTGGAGGCGT TACAACATTAGATGTTGCGAGATACTCAGCATTAACACTTCCAATTTTAAACTTTATTATTCCATTTGTTTTAGTATTCA TTGTAGATGGTATGAAAGGTATTAAAGAAATTTTACCTGTCATTTTAACAGTGAGTGGTACATATACTGGATTACAATTA TTATTAACAATATTCCATGGTCCAGAACTAGCAGACATTATTCCATCACTAGCAACAATGGTGGTGTTAGCATTTGTTTG TCGTAAATTTAAACCGAAAAACATTTTCAGATTGGAAGCGTCTGAACATAAAATTCAAAAACGAACGCCTAAAGAAATTG TCTTTGCTTGGAGTCCGTTCGTCATTTTAACTGCCTTTGTATTAGTATGGAGTGCACCATTCTTCAAAAAATTATTCCAA CCTGGAGGTGCACTTGAAAGTTTAGTAATAAAATTGCCAATTCCAAATACTGTGAGTGATTTATCGCCTAAAGGAATTGC GTTGCGTCTCGATTTAATTGGTGCAACTGGGACAGCGATTTTATTAACAGTAATTATTACAATTTTAATTACGAAGTTAA AATGGAAAAGTGCAGGTGCTTTATTGGTCGAAGCAATTAAAGAATTATGGTTACCGATCCTTACAATTTCAGCTATCCTA GCTATTGCTAAAGTTATGACATACGGTGGTTTGACTGTAGCAATTGGACAAGGTATTGCTAAAGCGGGAGCAATTTTCCC ATTATTCTCTCCAGTATTAGGTTGGATTGGTGTGTTTATGACTGGTTCAGTTGTAAATAACAATACTTTATTCGCACCTA TTCAAGCGACAGTGGCACAACAAATTTCAACAAGCGGTTCATTACTTGTGGCGGCTAACACTGCAGGTGGTGTAGCAGCG AAACTTATTTCACCACAATCAATTGCCATTGCGACTGCAGCTGTTAAAAAAGTTGGTGAAGAATCTGCATTATTAAAAAT GACGTTAAAATACAGTATTATATTTGTTGCCTTTATTTGTGTTTGGACGTTTATACTAACGTTAATATTCTAA Protein sequence : MTLLTVNPFDNVGLSALVAAVPIILFLLCLTVFKMKGIYAALTTLVVTLIVALFVFELPARVSAGAITEGVVAGIFPIGY IVLMAVWLYKVSIKTGQFSIIQDSIASISEDQRIQLLLIGFCFNAFLEGAAGFGVPIAICAVLLIQLGFEPLKAAMLCLI ANGAAGAFGAIGLPVSIIDTFNLSGGVTTLDVARYSALTLPILNFIIPFVLVFIVDGMKGIKEILPVILTVSGTYTGLQL LLTIFHGPELADIIPSLATMVVLAFVCRKFKPKNIFRLEASEHKIQKRTPKEIVFAWSPFVILTAFVLVWSAPFFKKLFQ PGGALESLVIKLPIPNTVSDLSPKGIALRLDLIGATGTAILLTVIITILITKLKWKSAGALLVEAIKELWLPILTISAIL AIAKVMTYGGLTVAIGQGIAKAGAIFPLFSPVLGWIGVFMTGSVVNNNTLFAPIQATVAQQISTSGSLLVAANTAGGVAA KLISPQSIAIATAAVKKVGEESALLKMTLKYSIIFVAFICVWTFILTLIF |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 7e-72 | 43 |