|
Name : qoxB (SAR1033) Accession : YP_040448.1 Strain : Staphylococcus aureus MRSA252 Genome accession: NC_002952 Putative virulence/resistance : Unknown Product : quinol oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.- Position : 1077944 - 1079932 bp Length : 1989 bp Strand : - Note : Similar to Bacillus subtilis quinol oxidase polypeptide I QoxB SW:QOX1_BACSU (P34956) (649 aa) fasta scores: E(): 1.7e-163, 62.154% id in 650 aa, and to Bacillus halodurans cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I BH2065 TR:Q9KB66 (EMBL:AP001514) (647 aa) DNA sequence : ATGAATTTTCCATGGGATCAATTACTAGTTAAAGGTAACTGGATGATTACAATGGCACAAATTGGTGCCCCATTCTTAGT TATTGGTTTAATCGCAGTAATTACTTACTTTAAATTATGGAAATATCTTTACAAAGAATGGTTCACATCTGTAGACCATA AGAAAATCGGTATTATGTATTTAATCTGTGCCGTATTAATGTTCGTCCGTGGTGGTATTGATGCGTTACTTATTCGTGCG CAACTAACAGTACCTGATAACAAATTTTTAGAATCTAACCACTATAACGAAATTTTTAGTACACATGGTGTAATCATGAT TATCTTCATGGCAATGCCATTTATCTTTGGTTTATGGAATATCGTTGTTCCATTACAAATTGGAGCACGTGATGTTGCAT TCCCAGTATTAAACAACGTAAGTTTCTGGCTATTCTTTGCAGGTATGATTTTATTCAACCTGTCATTTATTATTGGTGGT TCACCAGCAGCTGGTTGGACAAACTATGCGCCACTAGCAGGTGAATTCAGTCCTGGTCCGGGTGTTAACTATTACTTAAT AGCTATACAAATTTCAGGGCTTGGTACCTTAGCTACAGGTATCAACTTCTTTGTAACAATTTTAAGATGTAAAACACCAA CTATGAAGTTTATGCAAATGCCAATGTTTACAGTAACAACATTTATTACTACATTAATTGTTATTCTTGCTTTCCCTCCT TTAACAGTAGCGTTAGCATTAATGACAACTGATAGAATATTTGACACAGCATTCTTCACAGTTGCACATGGTGGTATGCC AATGCTTTGGGCTAACTTCTTCTGGGTATGGGGGCACCCTGAAGTTTATATCGTTATCCTTCCAGCATTTGGTATTTACT CAGAAATTATTCCGACATTCGCTCGTAAGCGTTTATTCGGACATCAAAGTATGGTATGGGCAACTGCCGGTATCGCTTTC CTTAGTTTCTTAGTTTGGGTTCACCATTTCTTCACAATGGGTAATGGTGCGTTAATCAACTCATTCTTCTCAATTTCAAC AATGCTGATTGGTATTCCAACTGGTGTGAAATTGTTTAACTGGTTATTAACATTATATAAAGGACGTATTACATTTGAGT CACCAATGTTATTCTCATTAGCATTCATCCCTAACTTCCTTTTAGGTGGTGTTACGGGTGTAATGTTAGCAATGGCATCT GCTGACTATCAATATCACAATACGTACTTCTTAGTAGCTCACTTCCACTATACATTGGTTACTGGTGTTGTATTTGCCTG CTTAGCTGGTTTAATCTTCTGGTATCCAAAGATGATGGGTTACAAATTAAACGAAACATTAAACAAATGGTGCTTCTGGT TCTTCATGATCGGATTTAACGTTTGTTTCTTACCACAATTCATTCTTGGATTAGATGGTATGCCACGTCGTTTATACACT TATATGCCATCAGATGGTTGGTTCTTATTAAACTTAATTTCAACTATCGGTGCATTATTAATGGCAATCGGATTCTTATT CCTTGTTGTTAGTATCGTATACAGTCACTTCAAATCTCCACGTGAAGCAACTGGAGATAACTGGGATGGCCTTGGTCGTA CTCTAGAGTGGACTACTGCATCAGCAATTCCACCTAAATACAACTTTGCCATTACACCAGATTGGAATGGCTACGACACA TTTGTTGATATGAAAGAACATGGTCGTCATTATTTAGACAACCATAATTACAAAGACATTCATATGCCAAACAATACTCC TGTTGGATTCTGGATTGGTATCTTTATGACTATCGGCGGTTTCTTCTTAATTTTCGAAACTGTAATTCCAGCATTAATTT GTTTATTCGGTATTTTTGGTACTATGATTTATCGCAGTTTCCAAATCGATCACGGATATCATATCCCTGCTGCTGAAGTT GCTGAAACTGAAGCTAGATTAAGAGAAGCGCGTATTAAAGAAAGGGAGGCTGTAAGTCATGAGTCATGA Protein sequence : MNFPWDQLLVKGNWMITMAQIGAPFLVIGLIAVITYFKLWKYLYKEWFTSVDHKKIGIMYLICAVLMFVRGGIDALLIRA QLTVPDNKFLESNHYNEIFSTHGVIMIIFMAMPFIFGLWNIVVPLQIGARDVAFPVLNNVSFWLFFAGMILFNLSFIIGG SPAAGWTNYAPLAGEFSPGPGVNYYLIAIQISGLGTLATGINFFVTILRCKTPTMKFMQMPMFTVTTFITTLIVILAFPP LTVALALMTTDRIFDTAFFTVAHGGMPMLWANFFWVWGHPEVYIVILPAFGIYSEIIPTFARKRLFGHQSMVWATAGIAF LSFLVWVHHFFTMGNGALINSFFSISTMLIGIPTGVKLFNWLLTLYKGRITFESPMLFSLAFIPNFLLGGVTGVMLAMAS ADYQYHNTYFLVAHFHYTLVTGVVFACLAGLIFWYPKMMGYKLNETLNKWCFWFFMIGFNVCFLPQFILGLDGMPRRLYT YMPSDGWFLLNLISTIGALLMAIGFLFLVVSIVYSHFKSPREATGDNWDGLGRTLEWTTASAIPPKYNFAITPDWNGYDT FVDMKEHGRHYLDNHNYKDIHMPNNTPVGFWIGIFMTIGGFFLIFETVIPALICLFGIFGTMIYRSFQIDHGYHIPAAEV AETEARLREARIKEREAVSHES |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 3e-79 | 46 |
