|
Name : SACOL0093 (SACOL0093) Accession : YP_184998.1 Strain : Staphylococcus aureus COL Genome accession: NC_002951 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 105443 - 107035 bp Length : 1593 bp Strand : + Note : identified by similarity to EGAD:8633; match to protein family HMM PF02652; match to protein family HMM TIGR00795 DNA sequence : ATGACACTACTTACTGTAAATCCATTCGATAATGTCGGATTATCAGCCTTAGTTGCAGCAGTACCTATTATTTTATTTTT ATTATGCTTAACCGTTTTTAAAATGAAAGGCATTTATGCAGCATTGACAACTTTGGTTGTTACATTGATTGTGGCTTTAT TTGTATTTGAATTACCAGCGCGTGTATCAGCAGGTGCGATTACAGAAGGCGTTGTTGCCGGTATTTTCCCAATAGGATAT ATCGTTTTAATGGCAGTTTGGTTATATAAAGTTTCTATTAAAACAGGACAATTTTCTATTATTCAAGATAGTATTGCAAG TATTTCAGTGGACCAAAGAATCCAACTATTATTAATTGGATTTTGTTTCAACGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTGCCAATTGCGATTTGTGCAGTATTATTAATTCAACTTGGATTTGAACCATTAAAAGCAGCGATGTTATGTTTAATT GCTAATGGTGCGGCGGGTGCCTTTGGTGCAATTGGTTTACCAGTTAGTATTATTGATACGTTTAACTTAAGTGGAGGCGT TACAACATTAGATGTTGCGAGATACTCAGCATTAACACTTCCAATTTTAAACTTTATTATTCCATTTGTTTTAGTATTCA TTGTAGATGGTATGAAAGGTATTAAAGAAATTTTACCTGTCATTTTAACAGTGAGTGGTACATATACTGGATTACAATTA TTATTAACAATATTCCATGGTCCAGAACTAGCAGACATTATTCCATCACTAGCAACAATGGTGGTGTTAGCATTTGTTTG TCGTAAATTTAAACCGAAAAACATTTTCAGATTGGAAGCGTCTGAACATAAAATTCAAAAACGAACGCCTAAAGAAATTG TCTTTGCTTGGAGTCCGTTCGTAATTTTAACTGCCTTTGTATTAGTATGGAGTGCACCATTCTTCAAAAAATTATTCCAA CCTGGAGGTGCACTTGAAAGTTTAGTAATAAAATTGCCAATTCCAAATACTGTGAGTGATTTATCGCCTAAAGGAATTGC GTTGCGTCTCGATTTAATTGGTGCAACTGGGACAGCGATTTTATTAACAGTAATTATTACAATTTTAATTACGAAGTTAA AATGGAAAAGTGCAGGTGCTTTATTGGTCGAAGCAATTAAAGAATTATGGTTACCGATCCTTACAATTTCAGCTATCCTA GCTATTGCTAAAGTTATGACATACGGTGGTTTGACTGTAGCAATTGGACAAGGTATTGCTAAAGCGGGAGCAATTTTCCC ATTATTCTCTCCAGTATTAGGTTGGATTGGTGTGTTTATGACTGGTTCAGTTGTAAATAACAATACTTTATTCGCACCTA TTCAAGCGACAGTGGCACAACAAATTTCAACAAGCGGTTCATTACTTGTGGCAGCTAACACTGCAGGTGGTGTAGCAGCG AAACTTATTTCACCACAATCAATTGCCATTGCGACTGCAGCTGTTAAAAAAGTTGGTGAAGAATCTGCATTATTAAAAAT GACGTTAAAATACAGTATTATATTTGTTGCTTTTATTTGTGTTTGGACGTTTATACTAACGTTAATATTCTAA Protein sequence : MTLLTVNPFDNVGLSALVAAVPIILFLLCLTVFKMKGIYAALTTLVVTLIVALFVFELPARVSAGAITEGVVAGIFPIGY IVLMAVWLYKVSIKTGQFSIIQDSIASISVDQRIQLLLIGFCFNAFLEGAAGFGVPIAICAVLLIQLGFEPLKAAMLCLI ANGAAGAFGAIGLPVSIIDTFNLSGGVTTLDVARYSALTLPILNFIIPFVLVFIVDGMKGIKEILPVILTVSGTYTGLQL LLTIFHGPELADIIPSLATMVVLAFVCRKFKPKNIFRLEASEHKIQKRTPKEIVFAWSPFVILTAFVLVWSAPFFKKLFQ PGGALESLVIKLPIPNTVSDLSPKGIALRLDLIGATGTAILLTVIITILITKLKWKSAGALLVEAIKELWLPILTISAIL AIAKVMTYGGLTVAIGQGIAKAGAIFPLFSPVLGWIGVFMTGSVVNNNTLFAPIQATVAQQISTSGSLLVAANTAGGVAA KLISPQSIAIATAAVKKVGEESALLKMTLKYSIIFVAFICVWTFILTLIF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-71 | 43 |
