|
Name : SACOL0379 (SACOL0379) Accession : YP_185271.1 Strain : Staphylococcus aureus COL Genome accession: NC_002951 Putative virulence/resistance : Unknown Product : prophage L54a, TP901 family tail tape meausure protein Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG3953 EC number : - Position : 382423 - 388623 bp Length : 6201 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF01551; match to protein family HMM TIGR01760 DNA sequence : ATGAATGAAAAAGTAGAAGGCATGACCTTGGAGCTGAAATTAGACCATTTAGGTGTCCAAGAAGGCATGAAAGGTTTAAA GCGACAATTAGGTGTTGTTAATAGTGAAATGAAAGCTAATCTGTCAGCATTTGATAAGTCTGAAAAATCAATGGAAAAAT ATCAGGCGAGAATTAAGGGGTTAAATGATAGGCTTAAAGTTCAAAAAAAGATGTATTCTCAAGTAGAAGATGAGCTTAAA CAAGTTAACGCTAATTACCAAAAAGCTAAATCCAGTGTAAAAGATGTTGAGAAAGCATATTTAAAGTTAGTAGAAGCCAA TAAAAAAGAAAAATTAGCTCTTGATAAATCTAAAGAAGCCTTAAAATCATCGAATACAGAACTTAAAAAAGCTGAAAATC AATATAAACGTACAAATCAACGTAAACAAGATGCGTATCAAAAACTTAAACAGTTGAGAGATGCAGAACAAAAGCTTAAG AATAGTAACCAAGCTACTACTGCACAACTAAAAAGAGCAAGTGACGCAGTACAGAAGCAGTCCGCTAAGCATAAAGCACT TGTTGAACAATATAAACAAGAAGGCAATCAAGTTCAAAAACTAAAAGTGCAAAATGACAATCTTTCAAAATCAAATGATA AAATTGAAAGTTCTTACGCTAAAACTAATACTAAATTAAAGCAAACAGAAAAAGAATTTAATGATTTAAACAATACTATT AAGAATCATAGCGCTAATGTCGCAAAAGCTGAAACAGCTGTTAATAAAGAAAAAGCTGCTTTAAATAATTTGGAGCGTTC AATAGATAAAGCTTCATCCGAAATGAAGACTTTTAACAAAGAACAAATGATAGCTCAAAGTCATTTCGGTAAACTTGCAA GTCAAGCGGATGTCATGTCAAAGAAATTTAGTTCTATTGGAGACAAAATGACTTCCCTGGGACGTACAATGACGATGGGC GTATCTACACCAATTACTTTAGGGTTAGGTGCAGCATTAAAAACAAGTGCAGACTTTGAAGGCCAAATGTCTCGAGTTGG AGCGATTGCGCAAGCAAGCAGTAAAGACTTGAAAAGCATGTCTAATCAAGCAGTTGACTTAGGAGCTAAAACCAGTAAAA GTGCTAACGAAGTTGCTAAAGGTATGGAAGAATTGGCAGCTTTAGGCTTTAATGCCAAACAAACAATGGAGGCTATGCCA GGTGTTATCAGTGCAGCAGAAGCAAGTGGTGCAGAAATGGCTACAACTGCAACTGTAATGGCTTCAGCGATTAACTCTTT CGGTTTAAAAGCATCTGATGCAAATCATGTTGCTGATTTACTTGCGAGATCAGCAAATGATAGTGCTGCAGATATTCAGT ACATGGGAGATGCATTGAAGTATGCTGGTACTCCTGCAAAAGCATTAGGAGTTTCAATAGAGGACACTTCCGCAGCAATT GAAGTTTTATCTAACTCAGGTTTAGAGGGTTCTCAAGCAGGTACTGCCCTAAGAGCTTCATTTATCAGGCTAGCTAATCC AAGTAAAAATACAGCTAAGGAAATGAAAAAATTAGGTATTCATTTGTCTGATGCTAAAGGTCAATTTGTTGGCATGGGTG AATTGATTAGACAGTTCCAAGATAATATGAAAGGCATGACGAGAGAACAAAAACTAGCTACAGTGGCTACAATAGTTGGT ACTGAAGCAGCAAGTGGATTTTTAGCCTTGATTGAAGCGGGACCAGATAAAATTAATAGCTATAGTAAATCCTTAAAGAA TTCCAATGGCGAAAGTAAAAAAGCAGCAGATTTGATGAAAGATAATCTCAAAGGCGCTCTGGAACAATTAGGTGGCGCTT TTGAATCATTAGCAATCGAAGTCGGTAAAGATTTAACGCCTATGATTAGAGCAGGAGCGGAAGGTTTAACAAAATTAGTT GATGGATTTACACATCTCCCTGGTTGGGTTAGAAAAGCTTCAGTAGGATTAGCACTTTTTGGTGCAGCAATTGGACCTGC AGTTCTTGCTGGAGGGTTATTAATACGTACAGTTGGAAGTGCTGCTAAAGGATATGCGTCATTAAATAGACGTATTGCTG AAAATACAATCCTTTCAAATACTAATTCAAAAGCAATGAAATCTTTAGGTCTTCAAACATTATTTCTTGGTTCTACAACA GGAAAAACGTCAAAAGGCTTTAAAGGGTTAGCCGGAGCTATGATGTTTAATTTAAAACCTATAAATGTTTTGAAAAATTC TGCAAAGCTAGCAATTTTACCGTTCAAACTTTTGAAAAACGGTTTAGGATTAGCTGCAAAATCTTTATTTGCAGTAAGTG GAGGCGCAAGATTTGCGGGTGTAGCCTTAAGGTTTTTAACAGGACCTATAGGTGCTACAATAACTGCTATTACAATTGCG TATAAAGTTTTTAAAACCGCATATGATCGTGTGGAATGGTTCAGAAACGGTATTAACGGTTTAGGAGAAACTATAAAGTT TTTTGGTGGTAAAATTATTGGCGGCGCTGTTAGAAAGCTAGGAGAGTTTAAAAACTATCTTGGAAGTATCGGCAAAAGCT TCAAAGAAAAGTTTTCAAAAGATATGAAAGATGGTTATAAATCATTAAGCGACGATGACCTTCTCAAAGTAGGAGTCAAC AAGTTTAAAGGATTTATGCAAACCATGGGCACAGCTTCTAAAAAAGCGTCTGATACTGTAAAAGTGTTAGGGAAAGGTGT TTCAAAAGAAACAGAAAAAGCTTTAGAAAAATATGTGCATTATTCTGAAGAAAATAGCAGAATCATGGAAAAAGTACGTT TAAACTCGGGTCAGATATCAGAAGACAAAGCAAAAAAACTTTTGAAAATTGAAACGGATTTATCTAATAACCTTATAGCT GAAATAGAAAAAAGAAATAAAAAGGAACTCGAAAAAACTCAAGAACTTATTGATAAGTATAGTGCATTCGATGAACAAGA AAAGCAAAACATTTTAACTCGAACTAAAGAAAAAAATGACTTGCGAATTAAAAAAGAGCAAGAACTCAATCAGAAAATCA AAGAATTGAAAGAAAAAGCTTTGAGTGATGGTCAGATTTCAGAAAATGAAAGAAAAGAAATTGAAAAGCTTGAAAATCAA AGACGTGATATCACTGTTAAAGAATTGAGTAAGACTGAAAAAGAGCAAGAGCGTATTTTAGTAAGAATGCAAAGAAACAG AAATGCTTATTCAATAGACGAAGCGAGCAAAGCAATTAAAGAAGCAGAAAAAGCAAGAAAAGCAAGAAAAAAAGAAGTGG ACAAGCAATATGAAGATGATGTCATTGCTATAAAAAATAACGTCAACCTTTCTAAGTCTGAAAAAGATAAATTGTTAGCT ATTGCTGATCAAAGACATAAGGATGAAGTAAGAAAGGCAAAATCTAAAAAAGATGCTGTAGTAGACGTTGTTAAAAAGCA AAATAAAGATATTGATAAAGAAATGGATTTATCCAGTGGACGTGTATATAAAAATACTGAAAAGTGGTGGAATGGTCTTA AAAGTTGGTGGTCTAACTTTAGAGAAGACCAAAAGAAGAAAAGTGATAAATACGCTAAAGAACAAGAAGAAACAGCTCGT AGAAACAGAGAAAATATAAAGAAATGGTTTGGAAATGCTTGGGACGGCGTAAAAACTAAAACTGGTGAAGCCTTTAGTAA AATGGGCAGAAATGCTAATCATTTTGGCGGCGAAATGAAAAAAATGTGGAGTGGAATCAAAGGAATTCCAAGCAAATTAA GTTCAAGTTGGAGCTCAGCCAAAAGTTCTGTAGGATATCACACTAAGGCTATAGCTAATAGTACTGGTAAATGGTTTGGA AAAGCTTGGCAATCTGTTAAATCGACAACAGGAAGTATTTACAATCAAACTAAGCAAAAGTATTCAGATGCCTCAGATAA AGCTTGGGCGCATTCAAAATCTATTTGGAAAGGGACATCAAAATGGTTTAGCAATGCATATAAAAGTGCAAAGGGCTGGC TAACGGATATGGCTAATAAATCGCGCTCGAAATGGGATAATATTTCTAGTACAGCATGGTCGAATGCAAAATCCGTTTGG AAAGGCACATCGAAATGGTTTGGTAACTCATACAAATCTTTAAAAGGTTGGACTGGGGATATGTATTCAAGAGCCCACGA TCGTTTTGATGCAATTTCAAGTTCGGCATGGTCTAACGCTAAATCAGTATTTAATGGTTTTAGAAAATGGCTATCAAAAA CATATGATTGGATTAGAGATATTGGTAAAGACATGGGAAGAGCTGCGGCTGATTTAGGTAAAAATGTTGCTAATAAAGCT ATTGGCGGTTTGAATAGCATGATTGGCGGTATTAATAAAATATCTAAAGCCATTACTGATAAAAATCTCATCAAGCCAAT ACCTACATTGTCTACTGGTACTTTAGCAGGAAAGGGTGTAGCTACCGATAATTCGGGAGCATTAACGCAACCGACATTTG CTGTATTAAATGATAGAGGTTCTGGAAACGCTCCAGGCGGTGGAGTTCAAGAAGTAATTCACAGGGCTGACGGAACATTC CATGCACCCCAAGGACGAGATGTGGTTGTTCCACTAGGAGTTGGAGATAGTGTAATAAATGCCAATGACACTCTGAAGTT ACAGCGGATGGGTGTTTTGCCAAAATTCCATGGTGGTACGAAAAAGAAAAAATGGATGGAACAAGTTACTGAAAATCTTG GTAAAAAAGCAGGGGACTTCGGTTCTAAAGCTAAAAACACAGCTCATAATATCAAAAAAGGTGCAGAAGAAATGGTTGAA GCCGCAGGCGATAAAATCAAAGATGGTGCATCTTGGTTAGGCGATAAAATCGGCGATGTGTGGGATTATGTACAACATCC AGGGAAACTAGTAAATAAAGTAATGTCAGGTTTAAATATTAATTTTGGAGGCGGAGCTAACGCTACAGTAAAAATTGCTA AAGGCGCGTACTCATTGCTCAAAAAGAAATTAGTAGACAAAGTAAAATCGTGGTTTGAAGATTTTGGTGGCGGAGGCGAT GGAAGCTATCTATTTGACCATCCAATTTGGCAAAGGTTTGGGAGTTACACAGGTGGACTTAACTTTAATGGCGGTCGTCA CTATGGTATCGACTTTGGTATGCCTACAGGAACGAACATTTATGCTGTTAAAGGCGGTATAGCTGATAAAGTATGGACTG ATTACGGTGGCGGTAATTCTATACAAATTAAGACCGGTGCTAACGAATGGAACTGGTATATGCATTTATCTAAGCAATTA GCAAGACAAGGCCAACGTATTAAAGCTGGTCAACTGATAGGGAAATCAGGTGCTACAGGTAATTTCGTTAGAGGAGCACA CTTACATTTCCAATTGATGCAAGGGTCGCATCCAGGGAATGATACAGCTAAAGATCCAGAAAAATGGTTGAAGTCACTTA AAGGTAGTGGCGTTCGAAGTGGTTCAGGTGTTAATAAGGCTGCATCTGCTTGGGCAGGCGATATACGTCGTGCAGCAAAA CGAATGGGGGTTAATGTTACTTCGGGTGACGTAGGAAATATCATTAGCTTGATTCAACACGAATCAGGAGGAAATGCAGG TATAACTCAATCTAGTTCGCTTAGAGACATCAACGTTTTACAGGGCAATCCAGCAAAAGGATTGCTTCAATATATCCCAC AAACATTTAGACATTATGCTGTTAGAGGTCACAACAATATATATAGTGGTTACGATCAGTTATTAGCGTTCTTTAACAAC AGATATTGGCGCTCACAGTTTAACCCAAGAGGTGGTTGGTCTCCAAGTGGTCCAAGAAGATATGCGAATGGTGGTTTGAT TACAAAGCATCAACTTGCTGAAGTGGGTGAAGGAGATAAACAGGAGATGGTTATCCCTTTAACTAGACGTAAACGAGCAA TTCAATTAACTGAACAGGTTATGCGCATCATCGGTATGGATGGCAAGCCAAATAACATCACTGTAAATAATGATACTTCA ACAGTTGAAAAATTGTTGAAACAAATTGTTATGTTAAGTGATAAAGGAAATAAATTAACAGATGCATTGATTCAAACTGT TTCTTCTCAGGATAATAACTTAGGTTCTAATGATGCAATTAGAGGTTTAGAAAAAATATTGTCAAAACAAAGTGGGCATA GAGCAAATGCAAATAATTATATGGGAGGTTTGACTAATTAA Protein sequence : MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKGLNDRLKVQKKMYSQVEDELK QVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLK NSNQATTAQLKRASDAVQKQSAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMG VSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMP GVISAAEASGAEMATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKNTAKEMKKLGIHLSDAKGQFVGMGELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVG TEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLV DGFTHLPGWVRKASVGLALFGAAIGPAVLAGGLLIRTVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGSTT GKTSKGFKGLAGAMMFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAVSGGARFAGVALRFLTGPIGATITAITIA YKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKLGEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVN KFKGFMQTMGTASKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENSRIMEKVRLNSGQISEDKAKKLLKIETDLSNNLIA EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKALSDGQISENERKEIEKLENQ RRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLA IADQRHKDEVRKAKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR RNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSSWSSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFG KAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWKGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRSKWDNISSTAWSNAKSVW KGTSKWFGNSYKSLKGWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSKTYDWIRDIGKDMGRAAADLGKNVANKA IGGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGALTQPTFAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTF HAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGVLPKFHGGTKKKKWMEQVTENLGKKAGDFGSKAKNTAHNIKKGAEEMVE AAGDKIKDGASWLGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWFEDFGGGGD GSYLFDHPIWQRFGSYTGGLNFNGGRHYGIDFGMPTGTNIYAVKGGIADKVWTDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQL ARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQLMQGSHPGNDTAKDPEKWLKSLKGSGVRSGSGVNKAASAWAGDIRRAAK RMGVNVTSGDVGNIISLIQHESGGNAGITQSSSLRDINVLQGNPAKGLLQYIPQTFRHYAVRGHNNIYSGYDQLLAFFNN RYWRSQFNPRGGWSPSGPRRYANGGLITKHQLAEVGEGDKQEMVIPLTRRKRAIQLTEQVMRIIGMDGKPNNITVNNDTS TVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| MW1390 | NP_646207.1 | hypothetical protein | Not tested | ¥ÕSa2 | Protein | 0.0 | 99 |
| SAUSA300_1393 | YP_494090.1 | phiSLT ORF2067-like protein, phage tail tape measure protein | Not tested | ¥ÕSa2 | Protein | 0.0 | 99 |
