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Name : SACOL0180 (SACOL0180) Accession : YP_185079.1 Strain : Staphylococcus aureus COL Genome accession: NC_002951 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type I restriction-modification enzyme, R subunit Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0610 EC number : - Position : 208190 - 210979 bp Length : 2790 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00270; match to protein family HMM PF04313; match to protein family HMM PF04851; match to protein family HMM TIGR00348 DNA sequence : ATGGCATACCAAAGTGAATACGCATTAGAAAATGAAATGATGAATCAACTTGAACAATTGGGTTACGAAAGAGTAACGAT ACGTGATAATAAGCAATTGCTTGATAATTTTAGAACGATTTTAAATGAGCGTCATGCGGACAAATTAGAAGGCAATCCCT TAACAGATAAAGAATTTCAACGTCTGTTAACGATGATTGATGGAAAAAGTATTTTCGAGAGTGCCCGTATTTTACGTGAT AAATTACCACTTAGACGTGATGATGAGTCTGAGATTTATTTGTCGTTTTTAGATACGAAAAGTTGGTGTAAAAATAAGTT TCAAGTGACGAATCAAGTATCTGTCGAGGATACATATAAAGCACGTTATGATGTAACGATATTAATCAACGGACTACCCC TTGTCCAAGTTGAATTGAAACGTCGAGGTATTGATATTAATGAGGCGTTTAACCAAGTAAAACGTTACCGCAAACAAAAT TACACAGGCTTATTCCGCTACATACAAATGTTTATCATTAGTAATGGTGTTGAAACGCGATACTTTTCTAATAATGATAG CGAACTATTGAAGAGTCACATGTTTTATTGGAGTGATAAACAGAATAACCGTATCAATACATTGCAATCGTTTGCTGAGT CATTTATGAGACCTTGTCAATTAGCTAAGATGATATCGCGCTATATGATTATTAATGAAACAGATAGAATACTGATGGCA ATGCGTCCGTATCAAGTGTATGCGGTAGAAGCACTTATTCAACAAGCGACTGAGACAGGGAATAATGGATATGTATGGCA TACAACTGGAAGTGGTAAGACGTTGACTTCTTTTAAAGCGAGTCAGATTTTATCACAGCAAGATGACATTAAGAAAGTTA TCTTTTTGGTTGACCGTAAAGACTTGGATAGTCAAACAGAAGAGGAATTTAATAAATTTGCTAAGGGTGCTGTAGACAAA ACTTTTAATACCTCGCAACTGGTACGCCAACTAAATGATAAAAGTTTGCCACTTATTGTAACGACGATTCAAAAAATGGC TAAAGCGATTCAAGGGAATGCCCCTTTATTAGAACAGTATAAAACGAATAAAGTTGTATTTATTATTGATGAGTGTCATC GCAGTCAATTTGGTGACATGCATCGTCTAGTTAAACAACATTTCAAAAATGCCCAATACTTTGGATTCACTGGTACGCCA CGTTTTCCAGAAAATAGTAGTCAAGATGGTAGAACAACTGCAGATATTTTCGGTAGATGCTTACATACGTATTTAATTAG AGATGCCATTCATGATGGTAATGTACTTGGTTTCTCAGTTGACTATATTAATACTTTTAAAAATAAAGCTTTAAAAGCAG AAGATAACAGCATGGTTGAAGCAATTGATACGGAAGAAGTATGGTTAGCGGATAAACGTGTGGAATTAGTAACACGACAT ATCATCAATAATCATGATAAATATACACGTAATCGTCAATATTCAAGTATATTTACAGTCCAAAGTATTCACGCGCTTAT TAAATATTATGAGACATTTAAGCGACTTAACAAAAAGTTGGAACAACCGTTAACGATAGCTGGTATATTTACGTTTAAAC CTAATGAAGATGATCGTGATGGTGAAGTGCCATATCATTCACGTGAAAAATTAGAGATAATGATTAGTGATTATAATAAA AAGTTCGAGACGAATTTTTCAACAGACACAACTAATGAGTATTTCAATCATATTTCAAAAAACGTTAAAAAGGGCGTTAA AGATAGTAAAATTGATATCTTAATCGTTGTTAATATGTTCTTAACTGGTTTTGATAGTAAAGTACTGAACACTTTATATG TTGATAAGAATTTAATGTATCATGATTTAATTCAAGCGTATTCACGTACAAATAGGGTTGAAAAAGAATCAAAGCCATTT GGTAAAATTGTAAACTATCGTGACTTGAAAAAAGAGACAGACGATGCACTGAGAGTATTCTCACAAACAAATGATACGGA TACAATTTTAATGCGCAGTTATGAAGAGTATAAAAAAGAATTTATGGACGCTTATCGTGAGCTTAAAATGATTGTGCCGA CACCACACATGGTTGATGACATTCAAGATGAAGAAGAGCTAAAGCGCTTTGTTGAAGCTTATCGTTTATTAGCTAAAATA ATATTACGTTTAAAAGCATTTGACGAGTTTGAGTTTACAATTGATGAAATTGGAATGGATGAACAAGAGAATGAAGACTA TAAAAGTAAATATTTAGCTGTGTACGATCAAGTAAAAAGAGCGACGGCTGAGAAAAATAAAGTATCCATTTTAAATGATA TTGATTTCGAAATAGAAATGATGCGTAATGATACGATTAATGTGAATTATATTATGAATATATTGAGACAAATTGATCTT GAAGACAAAGCGGAACAACGTCGTAACCAAGAACAAATTAGACGCATTTTAGATCATGCAGATGATCCGACATTGAGGTT AAAACGAGATCTAATTAGAGAATTCATCGACAATGTTGTACCTTCTTTAAATAAGGATGATGATATCGATCAAGAATATG TTAATTTCGAAAGTATTAAAAAAGAAGCGGAGTTCAAAGGATTTGCTGGAGAGAGATCTATCGATGAACAAGCCCTAAAA ACAATTTCAAATGACTACCAGTATAGTGGTGTTGTAAACCCACATCACCTTAAAAAAATGATTGGTGATTTGCCATTGAA AGAAAAGCGTAAAGCAAGAAAAGCCATTGAATCTTTCGTGGCAGAAACAACTGAAAAATACGGTGTGTAA Protein sequence : MAYQSEYALENEMMNQLEQLGYERVTIRDNKQLLDNFRTILNERHADKLEGNPLTDKEFQRLLTMIDGKSIFESARILRD KLPLRRDDESEIYLSFLDTKSWCKNKFQVTNQVSVEDTYKARYDVTILINGLPLVQVELKRRGIDINEAFNQVKRYRKQN YTGLFRYIQMFIISNGVETRYFSNNDSELLKSHMFYWSDKQNNRINTLQSFAESFMRPCQLAKMISRYMIINETDRILMA MRPYQVYAVEALIQQATETGNNGYVWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQDDIKKVIFLVDRKDLDSQTEEEFNKFAKGAVDK TFNTSQLVRQLNDKSLPLIVTTIQKMAKAIQGNAPLLEQYKTNKVVFIIDECHRSQFGDMHRLVKQHFKNAQYFGFTGTP RFPENSSQDGRTTADIFGRCLHTYLIRDAIHDGNVLGFSVDYINTFKNKALKAEDNSMVEAIDTEEVWLADKRVELVTRH IINNHDKYTRNRQYSSIFTVQSIHALIKYYETFKRLNKKLEQPLTIAGIFTFKPNEDDRDGEVPYHSREKLEIMISDYNK KFETNFSTDTTNEYFNHISKNVKKGVKDSKIDILIVVNMFLTGFDSKVLNTLYVDKNLMYHDLIQAYSRTNRVEKESKPF GKIVNYRDLKKETDDALRVFSQTNDTDTILMRSYEEYKKEFMDAYRELKMIVPTPHMVDDIQDEEELKRFVEAYRLLAKI ILRLKAFDEFEFTIDEIGMDEQENEDYKSKYLAVYDQVKRATAEKNKVSILNDIDFEIEMMRNDTINVNYIMNILRQIDL EDKAEQRRNQEQIRRILDHADDPTLRLKRDLIREFIDNVVPSLNKDDDIDQEYVNFESIKKEAEFKGFAGERSIDEQALK TISNDYQYSGVVNPHHLKKMIGDLPLKEKRKARKAIESFVAETTEKYGV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 75 |
