|
Name : HD0887 (HD0887) Accession : NP_873384.1 Strain : Haemophilus ducreyi 35000HP Genome accession: NC_002940 Putative virulence/resistance : Unknown Product : nucleoside transporter Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG1972 EC number : - Position : 710136 - 711404 bp Length : 1269 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGTGCGTTAAATAGTATATTAGGTATTGTGGTACTCTTATTAATAGCTTTTGCATTATCTAATAATCGCAAAGCCAT TAGTTTGCGTACAGTATTCGGTGCATTATTTTTACAAATTGGGATTGGTGCAATCATTTTATATTGGGAAACAGGTCGGC AAGCGCTATTAGCCATTGCGGAAGGCGTAAGTAAAGTTATCAGTTATGGTAATGATGGTATTAATTTCTTATTCGGTGGT TTAGTCAGCGATAAAATGTTTGAAGTTTTCGGTGGTGGCGGTTTCGTATTCGCATTAAAAGTGCTTCCACCGATTATTTT CTTCTCCTCACTGATTTCAGTCCTCTATTATTTAGGCATCATGCAAATGGTGATTCGTATTCTTGGTGGTGCATTACAAA AACTATTGGGGACGTCAAAGCCAGAATCCATGTCTGCTGCTGCAAATATTTTCGTTGGTCAAACAGAAGCGCCTCTTTTA GTTAGACCTTATATTAAATCAATGACAAATTCAGAATTATTTGCGGTGATGAGCGGGGGTTTAGCCTCTGTCGCAGGCGT AGTTATGATTGGCTATGCAGGTATGGGAGTACCGCTTCCTTATTTAATTGCAGCTTCATTTATGGCAGCACCCGGTGGAT TATTATTTGCTAAAATTTTACATCCACAATTAGAAACATTTAAAGATGAATTAAGTGCAGATGATATGGACGACAAACCT GCTAATGTGATTGAAGCAGCCGCTGTTGGTGCGTTTTCTGGTATGCAGTTAGCGATGAATGTGGGGGCGATGTTATTAGC ATTTATTGCATTAATCGCATTATTTAATGGTTTTGTTGGTTGGATTGGTGCATTAGCCGGTTTTGAAGGATTAACATTAC AAATGCTATTTGGGTATATTTTCCAACCTTTAGCTTGGTTAATTGGTGTGCCATGGGGAGGCGAAGCACAAATTGCGGGT TCATTAATTGGGCAAAAATTGATCGTAAACGAATTTGTTGCCTATGCAGATTTTGTGAATTATTTAAAACCAGAGGCAGG TGTAGCATTAAGTCCAAAAACGATCGCTATTATCACCTTCTCTCTATGTGGTTTTGCCAACTTAAGTTCGATTGCTATTT TAATCGGTGGTTTAGGTGGTATGGCGCCAAGCCGTCGTAGCGATGTAGCAAGAATGGGGATCAAAGCAGTTATGGCAGGA ACCCTATCCAACTTAATGAGTGCTGCCATTGCTGGTTTATTTATCGGTATTGGCGGTGCAGTAATGTAA Protein sequence : MSALNSILGIVVLLLIAFALSNNRKAISLRTVFGALFLQIGIGAIILYWETGRQALLAIAEGVSKVISYGNDGINFLFGG LVSDKMFEVFGGGGFVFALKVLPPIIFFSSLISVLYYLGIMQMVIRILGGALQKLLGTSKPESMSAAANIFVGQTEAPLL VRPYIKSMTNSELFAVMSGGLASVAGVVMIGYAGMGVPLPYLIAASFMAAPGGLLFAKILHPQLETFKDELSADDMDDKP ANVIEAAAVGAFSGMQLAMNVGAMLLAFIALIALFNGFVGWIGALAGFEGLTLQMLFGYIFQPLAWLIGVPWGGEAQIAG SLIGQKLIVNEFVAYADFVNYLKPEAGVALSPKTIAIITFSLCGFANLSSIAILIGGLGGMAPSRRSDVARMGIKAVMAG TLSNLMSAAIAGLFIGIGGAVM |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 3e-64 | 48 |
