Name : gltS (HD1707) Accession : NP_874078.1 Strain : Haemophilus ducreyi 35000HP Genome accession: NC_002940 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium/glutamate symporter Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG0786 EC number : - Position : 1422527 - 1423747 bp Length : 1221 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAACCTATTGTATTTAATGGTTACCACACATTAATTACTGCGACACTTGTACTTTTAGTCGGACGGTTTTTTGTGAA TAAAATTAAAGTATTACAAGACTTTAATATTCCTGAGGCCGTTGCAGGTGGTTTAATCGCAGCAGTGGCTATTCTCTGCT TATATAATTGGTTTGGCGTTTCTCTACAATTTGAACAAAGCTTACAAAATGCGTTTATGCTAGCCTTCTTTTCATCTGTT GGATTATCTGCTGATTTCTCACGTCTAAAACAAGGTGGTATGCCATTAGTGATTTTCCTGGTTGTCGTCAGCCTCTATAT TATTATCCAAAATGTGATCGGGGTTGGCCTAGCCAGTGCCTTAGGGCTCGATCCAATGATAGGCTTACTCACCGGTTCAA TCACATTAACAGGTGGTCACGGTACGGGTGCGGCTTGGGCGAAAATCTTTTCAGAAGAATATAATATTACCGGCGTAATG GAAATGGCGATGGCATCAGCCACTTTTGGTTTAGTGGCTGGTGGGTTAATCGGTGGGCCGATTGCACGGCGATTAATCAA TAAAATGAAAAAAGATCGCTCGCAACAGATCACTAAACGGGTAGATACCTCTGCAGAACAATATGACGGCAGTACTTTCG AAGATCACGATTCTATTCGTTATATCACCGCTAGCTCTACCATTGAGACTATGGCACTCTTTGCTGCTTGTTTAGGTTTT TCATCTATTATCGTCAACACTTTTCCTGATATTAGTTTACCTCAATTCGTCTGGGCACTGGGGTTCGGGGTTATCTTGCG TAATGTTTTAACTAAAGTATTCAAATTTGATATGTTTGACCGTGCTATTGATGTGTTCGGTAATGCTTCTTTAAGTATGT TCCTAGCAATGGCCTTAATGAGTATCAAACTGTGGGAATTAACGGGGCTAGCCGGTCCAATGCTGATTATTTTAGTGGTG CAAACGTTAGTGATGATTCTCTACGGTTATTTCGTTACGTATCGTGTTATGGGTAAAGATTATGATGCCGCTATTTTAAC TGCCGGTCATTGTGGTTTTGGATTAGGCGCTACGCCAACAGCGGTGGCTAATATGCAATCTGTGACTGAAAAATTTGGGT CTTCGCATAAAGCGTTCTTAATTGTGCCATTAGTTGGGGCTTTTTTTGTGGATATATTAAATTTGGCGGTAATTACTTCG TTTGTGGATTTCTTACGCTAA Protein sequence : MEPIVFNGYHTLITATLVLLVGRFFVNKIKVLQDFNIPEAVAGGLIAAVAILCLYNWFGVSLQFEQSLQNAFMLAFFSSV GLSADFSRLKQGGMPLVIFLVVVSLYIIIQNVIGVGLASALGLDPMIGLLTGSITLTGGHGTGAAWAKIFSEEYNITGVM EMAMASATFGLVAGGLIGGPIARRLINKMKKDRSQQITKRVDTSAEQYDGSTFEDHDSIRYITASSTIETMALFAACLGF SSIIVNTFPDISLPQFVWALGFGVILRNVLTKVFKFDMFDRAIDVFGNASLSMFLAMALMSIKLWELTGLAGPMLIILVV QTLVMILYGYFVTYRVMGKDYDAAILTAGHCGFGLGATPTAVANMQSVTEKFGSSHKAFLIVPLVGAFFVDILNLAVITS FVDFLR |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
gltS | NP_273147.1 | sodium/glutamate symport carrier protein | Not tested | IHT-A | Protein | 7e-108 | 64 |
unnamed | AEA34672.1 | sodium/glutamate symport carrier protein | Not tested | Not named | Protein | 3e-73 | 50 |