Gene Information

Name : hsdR (SA0189)
Accession : NP_373432.1
Strain : Staphylococcus aureus N315
Genome accession: NC_002745
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : type I restriction enzyme restriction protein
Function : -
COG functional category : V : Defense mechanisms
COG ID : COG0610
EC number : -
Position : 222427 - 225216 bp
Length : 2790 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGCATACCAAAGTGAATACGCATTAGAAAATGAAATGATGAATCAACTTGAACAATTGGGTTACGAAAGAGTAACGAT
ACGTGATAATAAGCAATTGCTTGATAATTTTAGAACGATTTTAAATGAGCGTCATGCGGACAAATTAGAAGGCAATCCCT
TAACAGATAAAGAATTTCAACGTCTGTTAACGATGATTGATGGGAAAAGTATTTTCGAGAGTGCCCGTATTTTACGTGAT
AAATTACCACTTAGACGTGATGATGAGTCTGAGATTTATTTGTCGTTTTTAGATAAGAAAAGTTGGTGTAAAAATAAGTT
TCAAGTGACGAATCAAGTATCTGTCGAGGATACATATAAAGCACGTTATGATGTAACGATATTAATCAACGGACTACCCC
TTGTCCAAGTTGAATTGAAACGTCGAGGTATTGATATTAATGAGGCGTTTAACCAAGTAAAACGTTACCGCAAACAAAAT
TACACAGGCTTATTCCGCTACATACAAATGTTTATCATTAGTAATGGTGTTGAAACGCGATACTTTTCTAATAATGATAG
CGAACTATTGAAGAGTCACATGTTTTATTGGAGTGATAAACAGAATAACCGAATCAATACATTACAATCATTTGCTGAGT
CGTTTATGAGACCCTGTCAATTAGCTAAGATGATATCGCGCTATATGATTATTAATGAAACAGATAGAATACTGATGGCA
ATGCGTCCGTATCAAGTGTATGCGGTAGAAGCACTTATTCAACAAGCGACTGAGACAGGGAATAATGGATATGTATGGCA
TACAACTGGAAGTGGTAAGACATTGACTTCTTTTAAAGCGAGTCAGATTTTATCACAGCAAGATGACATTAAGAAAGTTA
TCTTTTTGGTTGACCGTAAAGACTTGGATAGTCAAACAGAAGAGGAATTTAATAAATTTGCTAAGGGTGCTGTAGACAAA
ACTTTTAATACCTCGCAACTGGTACGCCAACTAAATGATAAAAGTTTGCCACTTATTGTAACGACGATTCAAAAAATGGC
TAAAGCGATTCAAGGGAATGCCCATTTATTAGAACAGTATAAAACGAATAAAGTTGTATTTATTATTGATGAGTGTCATC
GCAGTCAATTTGGTGACATGCATCGTCTAGTTAAACAACATTTCAAAAATGCCCAATACTTTGGATTCACTGGTACGCCA
CGTTTTCCAGAAAATAGTAGTCAAGATGGTAGAACAACTGCAGATATTTTCGGTAGATGCTTACATACGTATTTAATTAG
AGATGCCATTCATGATGGTAATGTACTTGGTTTCTCAGTTGACTATATTAATACTTTTAAAAATAAAGCTTTAAAAGCAG
AAGATAACAGCATGGTTGAAGCAATTGATACGGAAGAAGTATGGTTAGCGGATAAACGTGTGGAATTAGTAACACGACAT
ATCATCAATAATCATGATAAATATACACGTAATCGTCAATATTCAAGTATATTTACAGTCCAAAGTATTCACGCGCTTAT
TAAATATTATGAGACATTTAAGCGACTTAACAAAAAGTTGGAACAACCGTTAACGATAGCTGGTATATTTACGTTTAAAC
CTAATGAAGATGATCGTGATGGTGAAGTGCCATATCATTCACGTGAAAAATTAGAGATAATGATTAGTGATTATAATAAA
AAGTTCGAGACGAATTTTTCAACAGACACAACTAATGAGTATTTTAATCATATTTCAAAAAACGTTAAAAAGGGCGTTAA
AGATAGTAAAATTGATATCTTAATCGTTGTTAATATGTTCTTAACTGGTTTTGATAGTAAAGTACTGAACACTTTATATG
TTGATAAGAATTTAATGTATCATGATTTAATTCAAGCGTATTCACGTACAAATAGGGTTGAAAAAGAATCAAAGCCATTT
GGTAAAATTGTAAACTATCGTGACTTGAAAAAAGAGACAGACGATGCACTGAGAGTATTCTCACAAACAAATGATACGGA
TACAATTTTAATGCGCAGTTATGAAGAGTATAAAAAAGAATTTATGGACGCTTATCGTGAGCTTAAAATGATTGTGCCGA
CACCACACATGGTTGATGACATTCAAGATGAAGAAGAGCTAAAGCGCTTTGTTGAAGCTTATCGTTTATTAGCTAAAATA
ATATTACGTTTAAAAGCATTTGACGAGTTTGAGTTTACAATTGATGAAATTGGAATGGATGAACAAGAGAATGAAGACTA
TAAAAGTAAATATTTAGCTGTGTACGATCAAGTAAAAAGAGCGACGGCTGAGAAAAATAAAGTATCCATTTTAAATGATA
TTGATTTCGAAATAGAAATGATGCGTAATGATACGATTAATGTGAATTATATTATGAATATATTGAGACAAATTGATCTT
GAAGACAAAGCGGAACAACGTCGTAACCAAGAACAAATTAGACGCATTTTAGATCATGCAGATGATCCGACATTGAGGTT
AAAACGAGATCTAATTAGAGAATTCATCGACAATGTTGTACCTTCTTTAAATAAGGATGATGATATCGATCAAGAATATG
TTAATTTCGAAAGTATTAAAAAAGAAGCGGAGTTCAAAGGATTTGCTGGAGAGAGATCTATCGATGAACAAGCCCTAAAA
ACAATTTCAAATGACTACCAGTATAGTGGTGTTGTAAACCCACATCACCTTAAAAAAATGATTGGTGATTTGCCATTGAA
AGAAAAGCGTAAAGCAAGAAAAGCCATTGAATCTTTCGTGGCAGAAACAACTGAAAAATACGGTGTGTAA

Protein sequence :
MAYQSEYALENEMMNQLEQLGYERVTIRDNKQLLDNFRTILNERHADKLEGNPLTDKEFQRLLTMIDGKSIFESARILRD
KLPLRRDDESEIYLSFLDKKSWCKNKFQVTNQVSVEDTYKARYDVTILINGLPLVQVELKRRGIDINEAFNQVKRYRKQN
YTGLFRYIQMFIISNGVETRYFSNNDSELLKSHMFYWSDKQNNRINTLQSFAESFMRPCQLAKMISRYMIINETDRILMA
MRPYQVYAVEALIQQATETGNNGYVWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQDDIKKVIFLVDRKDLDSQTEEEFNKFAKGAVDK
TFNTSQLVRQLNDKSLPLIVTTIQKMAKAIQGNAHLLEQYKTNKVVFIIDECHRSQFGDMHRLVKQHFKNAQYFGFTGTP
RFPENSSQDGRTTADIFGRCLHTYLIRDAIHDGNVLGFSVDYINTFKNKALKAEDNSMVEAIDTEEVWLADKRVELVTRH
IINNHDKYTRNRQYSSIFTVQSIHALIKYYETFKRLNKKLEQPLTIAGIFTFKPNEDDRDGEVPYHSREKLEIMISDYNK
KFETNFSTDTTNEYFNHISKNVKKGVKDSKIDILIVVNMFLTGFDSKVLNTLYVDKNLMYHDLIQAYSRTNRVEKESKPF
GKIVNYRDLKKETDDALRVFSQTNDTDTILMRSYEEYKKEFMDAYRELKMIVPTPHMVDDIQDEEELKRFVEAYRLLAKI
ILRLKAFDEFEFTIDEIGMDEQENEDYKSKYLAVYDQVKRATAEKNKVSILNDIDFEIEMMRNDTINVNYIMNILRQIDL
EDKAEQRRNQEQIRRILDHADDPTLRLKRDLIREFIDNVVPSLNKDDDIDQEYVNFESIKKEAEFKGFAGERSIDEQALK
TISNDYQYSGVVNPHHLKKMIGDLPLKEKRKARKAIESFVAETTEKYGV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SSP0054 YP_300144.1 type I site-specific restriction-modification system restriction subunit Not tested SCC15305cap Protein 0.0 75