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Name : recG (L0262) Accession : NP_268401.1 Strain : Lactococcus lactis IL1403 Genome accession: NC_002662 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 2329913 - 2331913 bp Length : 2001 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGAAATTAACAGATTCAGTGCAATTTTTAAAAGGTGTGGGACCGAAATCTGTGGAAAATTTCCATAAGTTAGGAATTTT CACGGTTCAAGATTTATTGCTTTATTTCCCTTTTCGTTATGAAGATTTCGCAAGTCGTTCGGTTTTTGAACTTGTTGACG GAGAAAAAGCAACAATTATTGGAACGGTAGTGACACCAGCTAATGTCCAGTATTACGGATTTAAACGTAATCGACTTTCA TTTAAAATTAAAGAAGGTGAGGCCGTGGTTGCTGTCAGCTTTTTTAATCAACCTTATTTGGCTGACAAAGTGGAAGTTGG TAAGGAAATTGCAGTTTACGGAAAATGGGAGCAGGCAAAGCAACAACTGATGGGGATGAAGGTTGTGGCTCAGGTGGACG ATGGCTTAGAACCTGTTTATCATTTGGCAGCGGGTATGAAACAAAGTCAATTGGTCAAAGTAATTCATCAGGTTTTTGAA TCAGACCTTCTATCAGAATTACCTGAGAACTTACCAGAATTTTTGATTAAAAAATATCGTCTGATGAACCGGCAAGAAGC CGTTTTGGCTATGCATTTTCCTGAAGATATGGAAGCTCATAAGCAGGCTTTACGTCGTGTAAAATTTGAAGAATTATTCA TGTTTCAGTTGAAATTACAGGCCTTAAAAAATAAAGAAAAATCAGGCCGAGCAGGATTAGAAGTTGTTTTTGAGCAAGGA GAAATTGATCAGAAGATTTCTGAATTACCTTTTGAACTGACAGGTGCTCAATTAAGCGCTTTGTCAGAGATTCTGACGGA TATGAAATCTCCTTATCACATGAATCGACTTTTGCAAGGTGATGTGGGTTCTGGTAAAACAGTTGTTGCTTCCCTTGCCA TGTACGCGGCTTGTTTGGCGAATTTTCAAGCAGCAATTATGGTACCAACGGAAATCCTTGCCCGTCAGCATTTTGCAAAC TTGAAAGCTCTTTTTCCAGAATTGCAAATTTCACTTTTGGTTTCGGGTTTGAAAGTGGCAGAGCGCCGCGAGATTTTGGC TGATTTAGTTAGTGGTCATACACATATGGTAGTTGGAACTCATGCGCTAATTCAAGAAGGGGTTAATTTTTATAATTTGG GTTTGGTGATTACAGACGAACAACACCGTTTCGGAGTCAATCAACGAAAAATTTTACGAGAAAAAGGGCAAAATCCAGAT GTTCTAATGATGACAGCTACACCCATTCCAAGAACGCTTGCGATTACGGCTTTTGGGGATATGGATGTTTCAATTATTGA TGAACTACCCAAGGGACGTCAACCCATTACTACAAGGTGGGTCAAACATGAACAATTTTCCGAAGTTTTAAGTTGGATAA AAGCAGAGGTTGCTAAAGATTCACAGGTTTATTTTATTTCACCTTTAATTGAGGAAAGTGAAACGTTGGACCTGAAAAAC GCAGAAGCTCTTTTTGCGGAATTAAATGAATACTTTGGATTATTTGCCAAAATTGGTCTTTTACATGGAAAAATGAAAAA TGATGAAAAAGACCAAATCATGCAAGAATTTAAGGCTAAAAAATTAGATATTTTGGTTTCAACAACAGTGATTGAAGTGG GAGTTGACGTTCCTAATGCTACCATTATGGTGATTATGGATGCTGACCGCTTTGGACTTTCGCAGCTTCACCAATTGCGT GGTCGTGTTGGTCGGGGAACAAAAAAATCTTATGCCATTTTAGTAGCAAATCCTAAGTCCGATTCAGGAAAACAACGGAT GAAAATTATGACAGAAACACAAAATGGTTTTATTTTAGCCGAAGAAGATTTGAAAATGCGTGGTTCTGGAGAGATTTTTG GACTTCGTCAGTCAGGACTTCCAGAATTTATTGCGGCTGATTTAGTCAATGATTATAATATTTTAGAAGTGGCTAGAAAA GAAGCAGTTGAAATTTTTAAAAATGCAGATGAGTTTCCTGATTTGATTGCTCAAGTTAATGTTGACGGGGGCTTTGATTG A Protein sequence : MKLTDSVQFLKGVGPKSVENFHKLGIFTVQDLLLYFPFRYEDFASRSVFELVDGEKATIIGTVVTPANVQYYGFKRNRLS FKIKEGEAVVAVSFFNQPYLADKVEVGKEIAVYGKWEQAKQQLMGMKVVAQVDDGLEPVYHLAAGMKQSQLVKVIHQVFE SDLLSELPENLPEFLIKKYRLMNRQEAVLAMHFPEDMEAHKQALRRVKFEELFMFQLKLQALKNKEKSGRAGLEVVFEQG EIDQKISELPFELTGAQLSALSEILTDMKSPYHMNRLLQGDVGSGKTVVASLAMYAACLANFQAAIMVPTEILARQHFAN LKALFPELQISLLVSGLKVAERREILADLVSGHTHMVVGTHALIQEGVNFYNLGLVITDEQHRFGVNQRKILREKGQNPD VLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIIDELPKGRQPITTRWVKHEQFSEVLSWIKAEVAKDSQVYFISPLIEESETLDLKN AEALFAELNEYFGLFAKIGLLHGKMKNDEKDQIMQEFKAKKLDILVSTTVIEVGVDVPNATIMVIMDADRFGLSQLHQLR GRVGRGTKKSYAILVANPKSDSGKQRMKIMTETQNGFILAEEDLKMRGSGEIFGLRQSGLPEFIAADLVNDYNILEVARK EAVEIFKNADEFPDLIAQVNVDGGFD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-101 | 45 |
