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Name : amtB (L0236) Accession : NP_267748.1 Strain : Lactococcus lactis IL1403 Genome accession: NC_002662 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0004 EC number : - Position : 1635861 - 1637102 bp Length : 1242 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGACACAGGCTCAATTGCATTTATTTTAATTTGTGCGGCATTGGTTTTTTTGATGACGCCTGCACTAGCATTTTTTTA TGGAGGGCTTGGACGCCGAAAAAATGTGTTAAACACAATGATGATGTCTCTCGCACCAATGGCTCTGGCTTCTATTTTAT GGATAATTATTGGCTTCTCATTTTCATTTTCAGGAAGCAATAGTTGGATTGGTGATTTCCACCATTTGTTTATGAATGGT GTGGATATGGCTAAAAATTCACTTTTCCCTGCTAATCATATTCCAGATGGCCTTTTTTCTGGTTTTCAAATGATGTTCTC GATTATCACAGTAGCTCTAATTACGGGATCTGTTGTTGGAAGAATGAGATTTACACCAATTTTGATTTTTATGACTGCTT GGTTAATTTTAGTTTATTATCCTTTGGCTCATATGGTTTGGGGCGGTGGATTTTTGGCTCAAATTCATGCGATTGACTTT GCGGGTGGAGATGTTGTTCATATTTCAAGTGGGGTTACAGGACTTGGACTTGCGTTAGTACTTGGAAAACGTCGAGATTA CGAACGTTTAGATTATCGTCCACATAATATTCCTTTTGTTGTTTTGGGCGCTGGTCTCCTATGGTTTGGTTGGTTCGGCT TTAATGCTGGGTCAGCGCTTGCTGCCAATGGTGTGGCAATTAACGCTTTTATGACGACTAATACAGCGGCAGCAGCAGCA ATGTTTTCATGGATGATTGTTGAAAAAATATTGATTGGTAAACCTTCAATTGTTGGTGCTTGTTCTGGTGCGGTAGTTGG TTTGGTGGCCATCACTCCAGGCGCTGGTTTTGTTTCTTTATGGTCGTCATTGATTATTGGTCTTTTGGTCAGTCCTTTGT CATACTTTATGATTTCTGTAGTAAAAAAGAAATTGGGATATGATGATGCTTTAGATGCTTTTGGTTGTCACGGTATTGGC GGGATGTTTGGCGGAATTATGACAGGAATTTTTGCAACGCCGGCTTTGGCACCAGAAAAAGGCTACGCTGGTTTAATCTA TGGCTCTGGGAAATTACTTTTGGCTAATGTGTCTGCGGTTGTCTTCACAGTTATTTTCACTGCTCTTGTGAGTTGGATCA TTATTAAAGTAATTGCCTTGTTTATGCCAATTCGTGTATCTGACCGTGCTGAAGCTATTGGACTTGACGACAGTGAGCAC GAAGAAACTGCTTATCCAACCTTCTTAGGTTTGGATTCTTAA Protein sequence : MDTGSIAFILICAALVFLMTPALAFFYGGLGRRKNVLNTMMMSLAPMALASILWIIIGFSFSFSGSNSWIGDFHHLFMNG VDMAKNSLFPANHIPDGLFSGFQMMFSIITVALITGSVVGRMRFTPILIFMTAWLILVYYPLAHMVWGGGFLAQIHAIDF AGGDVVHISSGVTGLGLALVLGKRRDYERLDYRPHNIPFVVLGAGLLWFGWFGFNAGSALAANGVAINAFMTTNTAAAAA MFSWMIVEKILIGKPSIVGACSGAVVGLVAITPGAGFVSLWSSLIIGLLVSPLSYFMISVVKKKLGYDDALDAFGCHGIG GMFGGIMTGIFATPALAPEKGYAGLIYGSGKLLLANVSAVVFTVIFTALVSWIIIKVIALFMPIRVSDRAEAIGLDDSEH EETAYPTFLGLDS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 1e-36 | 46 |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 1e-36 | 46 |
