|
Name : mutS (BU429) Accession : NP_240241.1 Strain : Buchnera aphidicola APS Genome accession: NC_002528 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0249 EC number : - Position : 466372 - 468780 bp Length : 2409 bp Strand : - Note : This protein performs the mismatch recognition step during the DNA repair process DNA sequence : ATGAAAAAAAAAAATATTAAGAATAGTATGAACAATCATACTCCAATGATAAAACAGTATTTATCTTTAAAATCACAGTA TCCTGATATGCTTCTTTTTTATCAAATGGGTGATTTTTATGAGTTGTTTTACGAAGATGCAGAACGTATTTCGGAACTAC TGAAAATTACTTTAACAAAAAAAGGATACTCAAATCATAAGATCATACCGATGGCTGGAGTCCCATGCCATAAATCAGAA TATTATTTATCTAAACTTGTAAAATTAGGTGAATCTATTGCGATATGTGATCAACAAAAAGAAACTGATTGTAAAAAAAA ATTAATTTCTCGTAAAGTAGTTCGCATAATCACGCCTGGAACTGTTACAGATGAAGTACTTCTTGAAGAAAATGAAGATA ATTTTATAGCTGCTATCTGGAAAGAAAATAATCAATTTGGATACTCCGTATTAGATTTATCATTAGGTTTTTTTGGTGTA TCTAAGATTTTTTCTTCTTGTGATTTGCTTTCAGAAATTGAACGAACTAATCCTAAAGAAATACTCTATCCGGAAAATTT TTCAGATGTTTTTTTAATTGAAAGTAGAAAGTGTATTAGAAAACGCTCATTATTAGAATTCGATTTAGAGACATCATATA AGTTACTTAATTTGCAATATAATACTTGTAGTTTGGATGGATTTGGTATAGAGAAAAACAATTTTGTAATACGTGCTGCT GGTTGTTTATTACAATATGTTAAATCAATGAATATGACTCTCTTACCTAATATTCGTCAGTTAAAATATAATTACATGGA AGATAGCATTTTTATGAATTTTAGTACGCGTAAAAGCTTGGAAATTACTCAAAATATTTCAGGAGAAAAAAAAAATACTT TATCTGCAATATTAAATAAAACAGTTACATCTATGGGTAGTAGAATGTTAAATAGATGGTTAAATTCTCCACTAAAAAAC TTTAAAATAGTTAGAAATCGTCATGAAAGTGTGGAAGCTTTGCAGTTTTTTTATAAAGAATTACAATTTATTTTACGTCA AGTTAATGATTTAGAAAGAATTTATTCTCGTTTAGCTTTACGTACTGCTTCGCCTCATGATTTCGTACGAATGCGTTCTA CATTAGAAATCTTACCTAATTTACATTTAATATTAAAAAAAATAAAATCAAAACATATAAAAAAAATACGTTTATCTATT GGTTATTTTGAAGAAGTTTTATGTTTATTAAAAAAAGCAATTAGTTTGAAGCCATCTAAATGTATTCGAGATGGTGGTGT AATAGCAGAATTATATAATATTGAACTTGATGAGTTACGATCTATTAAAATAAATTCCAAAGAATATATTAAAAATTTTG AACAGAAAGAAAAAAAAAAATTAATGATTGAATCATTTAAGATAAAATTTAATAAAATTATCGGGTATTATATTCAAATA AGCAAACGTCATACTCATTTAATTCCAAAATATTATGTCATAATACAAACATTAAAAAATACAGAACGTTATAGTGTTCC TTTATTAAAAGAATATGAAGAAAAAGTTTTAAATTCAGAAATGCGATCTTTATTACTAGAAAAAAAATTGTATGCAGAAA TTTTTAATATTATTGAACCTTTTTTAGAAAAATTACAAAATAGTGCATTAGCATTGTCAGAATTAGATGTGTTAGTAAAT TTATCTGAACGTGCTATATCTCTAAATTATACGCGTCCTATTATGAGCGAAAAATATGGAATTTCTTTACTAGAAAGTCG TCATCCAGTTGTTGAATGTTTTTTAAAAACACCATTTATAAAAAATTCTGTTTTTTTATCCAGAACACAAAGAATGATCA TTATAACAGGTCCTAATATGGGTGGAAAAAGTACATACATGCGTCAAATTGCACTCATTGTAATTATGGCCGGTATAGGT AGTTTTGTTCCTGCTAGATATGCTTTAATTGGTTCGATTGATAAAATTTTTACAAGAATAGGTTCTGCAGATGACTTAAG CAATGGATATTCAACATTTATGATGGAAATGATGGAAATATCTAATATTCTACACAATGCAACATCTAATAGTTTAGTTT TAATCGATGAATTAGGAAGAGGAACTTCAACTAATGAGGGTTTATCTTTAGCTTGGTCGTGTTCTAGGTATTTAATAAAC ATAAATAAATCTATGACGTTATTATCTACTCATTTTGTTGAATTAACAAAATTAGAAGAAAAAGAAAAATTTGTAAAAAA TTTTCATTTTTCTGCTATTAAAAGCGATTTACATATAGCTTTTTTATATAAAATTAAAAATGGTATATCAAAAAAAAGTT ATGGTATATCAGTAGCTTCATTGTCTGGATTGCCAGATTCTGTTCTAGAAGACGCAGAGAAAAAATTAATAGAAATAGAA AATACATAA Protein sequence : MKKKNIKNSMNNHTPMIKQYLSLKSQYPDMLLFYQMGDFYELFYEDAERISELLKITLTKKGYSNHKIIPMAGVPCHKSE YYLSKLVKLGESIAICDQQKETDCKKKLISRKVVRIITPGTVTDEVLLEENEDNFIAAIWKENNQFGYSVLDLSLGFFGV SKIFSSCDLLSEIERTNPKEILYPENFSDVFLIESRKCIRKRSLLEFDLETSYKLLNLQYNTCSLDGFGIEKNNFVIRAA GCLLQYVKSMNMTLLPNIRQLKYNYMEDSIFMNFSTRKSLEITQNISGEKKNTLSAILNKTVTSMGSRMLNRWLNSPLKN FKIVRNRHESVEALQFFYKELQFILRQVNDLERIYSRLALRTASPHDFVRMRSTLEILPNLHLILKKIKSKHIKKIRLSI GYFEEVLCLLKKAISLKPSKCIRDGGVIAELYNIELDELRSIKINSKEYIKNFEQKEKKKLMIESFKIKFNKIIGYYIQI SKRHTHLIPKYYVIIQTLKNTERYSVPLLKEYEEKVLNSEMRSLLLEKKLYAEIFNIIEPFLEKLQNSALALSELDVLVN LSERAISLNYTRPIMSEKYGISLLESRHPVVECFLKTPFIKNSVFLSRTQRMIIITGPNMGGKSTYMRQIALIVIMAGIG SFVPARYALIGSIDKIFTRIGSADDLSNGYSTFMMEMMEISNILHNATSNSLVLIDELGRGTSTNEGLSLAWSCSRYLIN INKSMTLLSTHFVELTKLEEKEKFVKNFHFSAIKSDLHIAFLYKIKNGISKKSYGISVASLSGLPDSVLEDAEKKLIEIE NT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 0.0 | 50 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | NP_240241.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 0.0 | 53 |
