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Name : Cj0555 (Cj0555) Accession : YP_002343986.1 Strain : Campylobacter jejuni NCTC 11168 Genome accession: NC_002163 Putative virulence/resistance : Unknown Product : dicarboxylate carrier protein MatC Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0471 EC number : - Position : 517060 - 518352 bp Length : 1293 bp Strand : + Note : Original (2000) note: Cj0555, probable integral membrane protein, len: 430 aa; similar in N-terminus to an ORF within the Streptococcus pneumoniae cps3E and rpt pseudogene region TR:P72556 (EMBL:U66846) orf5 (197 aa),fasta scores; opt: 493 z-score: 726.3 DNA sequence : ATGATAATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAAT TTTTGCTATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTA TTTCTATATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCT GGACATTTGATGTATCGTTTTGCTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGC TTTAGGAGCAGGTTTTTATACAGTTTTAGCTTTTATGGCACCACTTACTTTTTTACTTTGCGATAAAATCGGTTTAAGCA AAATTGCTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATAACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTT CGAGGATTGATGGAAAATTCAGGCATTGAAGCAAATGAAGCTTTTGCAAATTCTAGTATTATTTTTGCTTTTACTATAAT CTTGCCTATTGTGGTATTATCTTTTTTTGTGTTTAATGCTTTTAAAAATAATATAAAAATTAGTGTTATTTCAAAACCTG ATCCATTTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTA AATATTATTTTTCCACATAATGAGACAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCCATGATAGCCATGATTTTTGT TGCCATTGCTTTATTTTTAAAATTGGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTT GTGGAGTAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGCTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATC AATGTGATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTTTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTAC TCCAGCGCTTTTTCCTATAGTTCCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTG TAGGGGCTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAG GAAAAATTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAG TTTTATTTTATAA Protein sequence : MIMVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLA GHLMYRFANHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFITSQSGIIF RGLMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVL NIIFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGAIKLFSDLVENEI NVIFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVPSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYK EKLFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| M5005_Spy_0169 | YP_281533.1 | malonate permease | Not tested | Not named | Protein | 4e-67 | 42 |
