|
Name : leuS (UU371) Accession : NP_078205.1 Strain : Ureaplasma parvum ATCC 700970 Genome accession: NC_002162 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : 6.1.1.4 Position : 423256 - 425676 bp Length : 2421 bp Strand : + Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : ATGTATAATCACAATAAAATTGAAAAAAAATGACAAAAGTATTGACTAGATAATAAGACTTTTAAATTTGTTGATAATCC TAACAATCCTAAGAAATTTTATGTATTAGACATGTTTCCATATCCTAGTGGAAAAGGATTGCATGTTGGTCATCCCAAAG GTTATACAGCAACTGATGTAATTAGTCGTTTTAAACGTTTGAATGGTTATGATGTTTTACATCCAATTGGTTGAGATGCT TTCGGTTTACCAGCAGAACAGTATGCATTAGAAACAAATAATCACCCTCATACTTTTACGCAACAAAATATTAAAATTTT TCGTAAACAATTACAAATGATTGGTTTTGATTTTGACTATGATAAAGAAGTTGATACAACCGATCCTCAATTTTATCAAT GAACGCAATGGATTTTTGTGCAATTATATAAACATAATTTAGCTGAAATTCAAGATATTGATGTTAATTGATGCGAAAAT TTAGGAACTGTTTTAAGTAATGAAGAAGTTGTTTTAAATGATAAAAACGAACGGGTAAGTGAGCGAGGTGGTCATCCTGT TGTTCGTAAACCAATGAAACAATGAGTTTTAAAAATTGTAGATTATGCTGATAAATTATTAGATGGTTTAAATGAAGTTG AATTTAGTGAATCATTAAAATCGTTGCAACGTAATTGAATTGGTAAATCAATCGGTACTAGTGTGCAATTTAAGATTAAA GATTCACTTTTAACACTTGATGTGTTCACTACACGAATTGATACTATTTATGGGGTACAATACTTAGTAGTTGCACCAGA ACATCCAATTCTTAAATCTATTACTAGTGAGCAACAAATTAATGTTGTTCAATCATATATTGAACAAACAAAGAAAATAA GCGATTTAGATCGCATTGCTGATACTAATAAAACTGGTGTTTTTAGTGGTGCATATGCTATTAATCCAATCAATCAAGAA ATCATTCCAATTTGAGTAAGTGATTATGTTTTAATGAATTTTGCAACTGGAGCTGTTATGGGTGTACCAGCACATGATGA ACGTGATTATGCTTTTGCTAAAAAATATGCATTACCAATTAAAAGTGTAATTGATACAAAACAAAAATTACCATATGCAG GTGATGGTTTACATATTAACTCAGCAATGATTAATGGTTTAAATATTAAACAATCTCAAAATGTTTTAAATGATTATTTA ATTAAAAATCATCTAGGAAAAAAAGTTGCAAACTATAAATTGCGTAATTGAATTTTTAGTCGTCAACGTTATTGAGGTGA ACCATTCCCAGTTTTATTCGATGAAAATAATCAAATAAAGATTATCGAAGACTTACCTGTTTTATTACCAAATTTAAATG AATTTAAACCTTCTAAAACTGGTGAATCTCCCCTTGCAAATGCCCAAGAATGATTATATGTAGAAATTGATGGTAAAAAA TATCGTCGCGAAACAAATACAATGCCACAATGAGCAGGCTCATCATGATATTTTTTAGCTTATATTTTAAAAAATGAAGA TGGTTCATACACACCATTAAATAGTGAAGAAGCTAAAAAGCGTTTTGCTAAATGATTGCCAGTTGATGTTTATATTGGTG GACAAGAACATGCTGTTTTACATTTACTATATTCGCGTTTTTGACATCGTTTTTTGTATGATATTGGTGTAGTGCCAACA AAAGAACCATTTTATAAAGTAATTAATCAGGGAATGATTTTAGGCGAAAATAATGAAAAAATGTCTAAATCAAAAGGGAA TGTTATTAATCCTGATGATATTATTGCTTCGCATGGTGCTGATACATTAAGAATTTATGAAATGTTTATGGGACCATTAA CAGCTTCATTACCATGAAATCCGGATGGGTTAGATGCGATGCGAAAATGATTAGATCGCGTTTATCGTTTATATCATAAT TTAAGTGAACTAGAAGTTGTCGAAGATCTTAATAAACTAAATGAAGAAATAATTATTGCCTATCATACTTTAATTAAAAA TTACACAAAAGCAATTAATGAACAAGCATTTAATATTGCGATTAGTGAAATGATGGTTTTTGTTAATGTTTTATACAAAA ATAAAGTTATTAATTATGAATTATTAGATAATTTTTTAATTTTACTTTCATGCTATGCACCACATTTAGCGGAGGAATTA TATAGTTTAAACCATTCAGAATCTGTTTGTTTACAAAAAATGCCTATTTATGATGAACAAAAAATTATTGCTCAAAATAT TACAATTCCAATTCAAATTAATGGTAAATTAAAGCACACAATCAATGTTTTAAGAGATACAAATGCTGAAGAGTTAGTTA ATTTAGCATTGGCTTGTGAACAAGTTAAACAAGAAATTGGGGATCAACCAATTAAAAAACAAATCGTTGTTGTTAATAAA ATTATTAATTTTGTTATTTAA Protein sequence : MYNHNKIEKKWQKYWLDNKTFKFVDNPNNPKKFYVLDMFPYPSGKGLHVGHPKGYTATDVISRFKRLNGYDVLHPIGWDA FGLPAEQYALETNNHPHTFTQQNIKIFRKQLQMIGFDFDYDKEVDTTDPQFYQWTQWIFVQLYKHNLAEIQDIDVNWCEN LGTVLSNEEVVLNDKNERVSERGGHPVVRKPMKQWVLKIVDYADKLLDGLNEVEFSESLKSLQRNWIGKSIGTSVQFKIK DSLLTLDVFTTRIDTIYGVQYLVVAPEHPILKSITSEQQINVVQSYIEQTKKISDLDRIADTNKTGVFSGAYAINPINQE IIPIWVSDYVLMNFATGAVMGVPAHDERDYAFAKKYALPIKSVIDTKQKLPYAGDGLHINSAMINGLNIKQSQNVLNDYL IKNHLGKKVANYKLRNWIFSRQRYWGEPFPVLFDENNQIKIIEDLPVLLPNLNEFKPSKTGESPLANAQEWLYVEIDGKK YRRETNTMPQWAGSSWYFLAYILKNEDGSYTPLNSEEAKKRFAKWLPVDVYIGGQEHAVLHLLYSRFWHRFLYDIGVVPT KEPFYKVINQGMILGENNEKMSKSKGNVINPDDIIASHGADTLRIYEMFMGPLTASLPWNPDGLDAMRKWLDRVYRLYHN LSELEVVEDLNKLNEEIIIAYHTLIKNYTKAINEQAFNIAISEMMVFVNVLYKNKVINYELLDNFLILLSCYAPHLAEEL YSLNHSESVCLQKMPIYDEQKIIAQNITIPIQINGKLKHTINVLRDTNAEELVNLALACEQVKQEIGDQPIKKQIVVVNK IINFVI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 49 |
