|
Name : RP593 (RP593) Accession : NP_220962.1 Strain : Rickettsia prowazekii Madrid E Genome accession: NC_000963 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : - Position : 744454 - 746628 bp Length : 2175 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAGGCTTGTACAAAGTTAATTATTTTATTATTAATTTTCTTAGCAAAGTAATTTTAAAATATATGTTAACTACTTT AGAACAATTCTTATTTGCTCCTGTGAAAGCATTTATCAATATACGTGAAGATACAGTCTCTGCTCTTAAAAGGCTTGGTA TTAAGAATATTCGTGATTTATTATTTTATCTACCTGTTTCATATCAGAATAAAATATTATCACCTAATTTAACTAAAGTT AGAGGCGGTGAAATAATACAAACAGAAATTATAGTTAATAGTATTAATTTACAAAAAAGAGGTAATCAGCCTTTAAAGAT TACAGCTAGTAATAATACTGGGTCTCTATTATTAGTATTTTTTCATAAGCCACCACAGTTTATTTTAAATAAGCTGAAAG TTGGAACGAAGCATATTATTAGTGGAAAAGTACAATTCTTTGATTATCAATTACAAATTTTGCATCCTGAATTTATTACG AATCCTCAACTCTCAAAAGCCATAGAACCGCTTTATTCGATGACATATTCACTTAGTAACACGCAGCTATATTCATATAT AATAAAAGCAATAGAGATATTTGAAGAGAAGTGTAATGGTATAGAAGATAAAGAATTGAAGGAATATTTGGATGTTATAT TGCAGAATTTGAAGATCTTGCATGTTTTTCTTTCACCACATAACTTGATCTCATGTTCTAGAACAACGGATATCGTTGTT AATCCGAGTTATGCCATTGTAGCTGCCAAAAAACAATTAGCAATTAAAGAATTAATCGCTAATCAAATATCTCTTTTAAA TGTACGTATGCAAATAAATAGAAAACACGGTAATATTTACCCTAAAGCTGCATCTATTCAAGAAAATATATTAAGAGAGT TAGGATTTGAGTTAACCTATTATCAAAAGCAAGTTATAGAAGAAATAGAGTTTGAGCAAAGCGATAAAGTAGAAATGATG AGATTGTTACAAGGCGATGTTGGTTCTGGTAAAACTTTGGTAGCTTTGCTTACTATGGTAAATGTTGTCACCACTGGATT TCAAGCTACACTTATGGCTCCAACCGATTTACTTGCCAATCAGCATTATGATTTTTTTGTTAAAGCTCTAAAAAATACTA ATATTAGAGTTGGATTACTTACAGGTAAGATACTTGGTAAAGCTCGTAAAAATATTATTATTCAACTTGTAAACGGTAAG ATTGATATATTAATTGGTACTCATGCGTTATTTCAAGAAAAAGTAAGTTTTAAGAAACTAGGTTATATAGTTATTGATGA GCAGCATAGATTTGGAGTGCAGCAGCGGTTGAATCTAATAAATAAAGGAGTCAATCCTGATGTTTTAATTATGACTGCAA CACCAATTCCAAGAAGCTTAGCACTTACTATGTTTGGTGATATGACTGTTTCCAAGCTAATTGGGAAACCAAAAAATCGT TTATCTATTGTTACAAAGACTATGTCGGTTAATAAGATAGGATATATTATAAAAGCAATAAATAAGAGGCTTATTGCAGG TGAAAGGGTATATTGGATATGCCCGTTGATAACGCAAAGAGAGAAAGAAACACTGCAAGAGGATCTTTTATTAATGGATG TGATAAATCGTTTTAACTCTATCAAAAATATATATCAAGGTTATACTGGTATTATTCATGGTAAAATGAAGAACGATCAG AAGGAGCGCATAATGAAACAATTTAAGGAAGGTGAAATTAAGATATTAGTTGCAACAAATGTTATTGAAGTTGGAATAGA CGTATCTGAGGCCACTTTAATTGTTATTGAAAATGCTGAGCAATTTGGTTTAGCACAACTTCATCAGCTGAGAGGTAGAG TAGGACGAGGTAGATTGCAGTCATATTGTATATTATTATATAATCCAAAAAGGCTTGGCAAAGTAGCACAAAACAGGTTT AAGATAATGAAACACACTAATGATGGGTTTTATATCGCTGAGCAGGATTTAAAACTACGCGGTAGTGGTGAGATTTTAGG TATCAAACAAAGTGGTGAAATCGACTTTTTCTTTGCAGATTTAGCAGAAGATTATGCACTACTCATAAAGGCTCATAAAA TTGCAGAAAGAGAAATAAGCTTAAAAGATAATGTAAATTTTGTTAACTTTCAGATAAAACTCTTCGCAAAATCGCAAGTA AGCTATTTGATTTAA Protein sequence : MKGLYKVNYFIINFLSKVILKYMLTTLEQFLFAPVKAFINIREDTVSALKRLGIKNIRDLLFYLPVSYQNKILSPNLTKV RGGEIIQTEIIVNSINLQKRGNQPLKITASNNTGSLLLVFFHKPPQFILNKLKVGTKHIISGKVQFFDYQLQILHPEFIT NPQLSKAIEPLYSMTYSLSNTQLYSYIIKAIEIFEEKCNGIEDKELKEYLDVILQNLKILHVFLSPHNLISCSRTTDIVV NPSYAIVAAKKQLAIKELIANQISLLNVRMQINRKHGNIYPKAASIQENILRELGFELTYYQKQVIEEIEFEQSDKVEMM RLLQGDVGSGKTLVALLTMVNVVTTGFQATLMAPTDLLANQHYDFFVKALKNTNIRVGLLTGKILGKARKNIIIQLVNGK IDILIGTHALFQEKVSFKKLGYIVIDEQHRFGVQQRLNLINKGVNPDVLIMTATPIPRSLALTMFGDMTVSKLIGKPKNR LSIVTKTMSVNKIGYIIKAINKRLIAGERVYWICPLITQREKETLQEDLLLMDVINRFNSIKNIYQGYTGIIHGKMKNDQ KERIMKQFKEGEIKILVATNVIEVGIDVSEATLIVIENAEQFGLAQLHQLRGRVGRGRLQSYCILLYNPKRLGKVAQNRF KIMKHTNDGFYIAEQDLKLRGSGEILGIKQSGEIDFFFADLAEDYALLIKAHKIAEREISLKDNVNFVNFQIKLFAKSQV SYLI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-102 | 42 |
