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Name : RP405 (RP405) Accession : NP_220786.1 Strain : Rickettsia prowazekii Madrid E Genome accession: NC_000963 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 494892 - 496496 bp Length : 1605 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAACTCATTAACAAATATAGAAGACTTAAATTGTGATAATCAACATATTCCAAACGGTTTTAGGAGATGGATTTTTTC TACTAATCACAAAGATATCGGAATTATGTATATCATATTTGCTATTTTTGCTGGAGTTGTCGGAGGGTTATTTTCCCTTC TCTTTAGGTTAGAGCTTGCAATGCCAGGCGGCACTTTCTTAAATCATAATTTTCAGTTATATAACGTGCTTATCACGGTA CATGCTATTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCTGCATTATTTAGTGGATTTGGTAACTATTTTGTACCTCTATTAAT AGGAGCGCCTGATATGGCTTTTCCACGCCTTAACAATATAAGTTTTTGGCTATTAATTCCTGCTTTTCTTTTACTTATTA GTTCAACTTTTATTGACGGCGGGCCTGGAACTGGATGGACACTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTGAACGGTCATACTGGA GCAGCAGTCGATGTAGCTATTTTTAGCTTACATTTAACCGGTCTCTCATCAATACTCGGATCAATTAATTTAATCGTTAC TATATTTAATATGCGAACTCCAGGGATGGGGCTTTTCAAAATGCCATTATTCGTTTGGTCGATATTAGTAACCGCATTTC TGATAATCTTAGCTATGCCTGTGCTTAGCGGAGCTATCACTATGCTACTGACCGATCGTAACTTTGGCACCACTTTTTTT AAACCTGATGGTGGCGGCGATCCTTTATTATTTCAACATCTTTTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTATACATTGTAAT ACTCCCAGGCTTTGGCATAGTAAGTCAGGTTATTTCAACTTTTTCACGTAAACCTATATTTGGTTATCAAGGTATGGTTG GAGCTATGGTCATAATCGGTTTCGTTGGATTTATTGTATGGGCTCATCATATGTTTACTGTTGGACTTTCTTATAATGCA CTGATATATTTCACTGCTGGAACAATGATTATAGCAGTACCAACAGGCATTAAAATATTTAGCTGGATAGCAACTATGTG GGGTGGTTCTATTACATTTCCAACTCCTATGTTATTTGCAATTGGATTTATTATATTATTCACAATTGGCGGCGTAACAG GTATAATATTATCAAATTCTGCGCTTGATAGAGTCCTGCACGATACATATTATGTTGTCGCACATTTTCATTATACGATG TCTCTCGGCGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGAAAAATATCTGGAAAACAATATCCAGAAAT TCTAGGCAAAATTCATTTTTGGATTACATTTATTGGTGTTAATTTAACTTTTTTTCCGCAACATTTTTTAGGTCTTGCGG GAATGCCAAGAAGAATACCTGACTATCCTGAGGCTTTTGCAGGTTGGAATATGGTTTCATCAATAGGCGCAGGTATTTCT ATATTCGCTGCTTTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTACACGCTAAAATACGGCAAAAATTGTACAGCAAATCCTTGGGG TGATGGAGCTGATACACTCGAGTGGAAACTTAATTCACCACCACCATTCCATACTTTTGAAACACCACCACATATTGTGG AGTAA Protein sequence : MNSLTNIEDLNCDNQHIPNGFRRWIFSTNHKDIGIMYIIFAIFAGVVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHNFQLYNVLITV HAIIMVFFMIMPALFSGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLIPAFLLLISSTFIDGGPGTGWTLYPPLSNLNGHTG AAVDVAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRTPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLSGAITMLLTDRNFGTTFF KPDGGGDPLLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNA LIYFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFAIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTM SLGALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGIS IFAAFYFVFIVFYTLKYGKNCTANPWGDGADTLEWKLNSPPPFHTFETPPHIVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-92 | 48 |
