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Name : jhp0949 (jhp0949) Accession : NP_223666.1 Strain : Helicobacter pylori J99 Genome accession: NC_000921 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG3846 EC number : - Position : 1053868 - 1055130 bp Length : 1263 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCCGCTCCACTACTTGCTCTGCCCTTTCTTTCTAACCCTTTAGTGCTTGGTGCTTTAGCTGTCATAGGAGTGGGTGC TTACTTGTATCCCAATAAGCAAGATTCTTTAGTTGTGCAAGCAGATGGGCTTTATAGTGAAATTCTTGGGTTTTTCATTT CGTTTTCTAGCAAGATCTTGAAAGGAATTGGTGAGCCTTTAGCCAATGTTATCCAACCTTTTGGTATGGTTTTAGGAATG CTTTTAATCCTTTTGTATTCCTTTAAACGCTATCAAAACAATGATTTATTTGAAATCAAAACCTTTTTAATGCTTTTTGT GTTTGTAGGATACCTTTCTTTGTACCATTATGCTTTTAAATCTGATGGTTCTAGTAGCGGTAATGGTCGCTCCAGTTTTG CCTTTCAAAATCATGTAACAGAAATTTTTGACACGCCTGCTAACTTGCTAAATGCTGGGATTTCTAATGTGGTTAAGGAA TATCAAACAAATAGTGCAAGAGAACACAAGAATATAGACACGCACCACAGTATCACTAACGCTAATATTTCATTCCATGT CAGACAAATTTTAACGAGTTTGAATAAACTATATGAAGACTTCAAAATTAATAATGGACTATCGCTAAAAACCCTTATTG CAGCTGTTTTGTTATTAGTTATTTTAGGATTAGAATTGTTTTTATTGTTCAAAGTTTTCTGTTATGTTTTTATGACTTAT TTAGAAAAAATTATTTACTTGTCTTTGGTTATTTTCATGCTACTGCTAGGGTTTTTTCAGCAGACTAGAGGTTTTTTAGT GTCTTATGTGAAAAAAATTATTTCATTGACTTTTTACATGCCTTTGTTGTTGCTATTAGTGTTATTCAACTCTTTTGCAT TACAATACGCAATCAAAGTGGGAGGGAGCAATGAAATAGTGGCTAAATTTGGCATTATTGTAGCAATAGGAATTTCACTG ACATTTATTCAAAAAGTCCCCGAAATGATTAACGCTATCTTTGGCACACAAGGTGGTCTAACGGATGCTAAAAGCTTCAT ATATCAAGGTGTGCAAATGGCTAGTGCTGGAGCTGGAGCCATAGCTGGAAGTCTTAAGAGTGTGGGTCGTTCAGCATTTG GTAGAACGCTAGAAGCTTATAAAGACGCAAAATCTACGATAAACAGCACTACGGCTAACATGAGAGACATGCCAGGACAT CCTGGTGTTAGAGTGGGTGTGGAGACGATTGAACTTCCCAAGTCTCATAGAGCTAGCAAATGA Protein sequence : MAAPLLALPFLSNPLVLGALAVIGVGAYLYPNKQDSLVVQADGLYSEILGFFISFSSKILKGIGEPLANVIQPFGMVLGM LLILLYSFKRYQNNDLFEIKTFLMLFVFVGYLSLYHYAFKSDGSSSGNGRSSFAFQNHVTEIFDTPANLLNAGISNVVKE YQTNSAREHKNIDTHHSITNANISFHVRQILTSLNKLYEDFKINNGLSLKTLIAAVLLLVILGLELFLLFKVFCYVFMTY LEKIIYLSLVIFMLLLGFFQQTRGFLVSYVKKIISLTFYMPLLLLLVLFNSFALQYAIKVGGSNEIVAKFGIIVAIGISL TFIQKVPEMINAIFGTQGGLTDAKSFIYQGVQMASAGAGAIAGSLKSVGRSAFGRTLEAYKDAKSTINSTTANMRDMPGH PGVRVGVETIELPKSHRASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virb6 | YP_002301075.1 | VirB6 type IV secretion protein | Virulence | cag PAI | Protein | 9e-143 | 95 |
