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Name : lldP_2 (jhp0129) Accession : NP_222850.1 Strain : Helicobacter pylori J99 Genome accession: NC_000921 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 144989 - 146644 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : similar to H. pylori 26695 gene HP0141 DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTATGGCTTTCTTTATGGCCTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCCGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCATTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATCACAGCGGCGATTTTAGTGGGGTTGGGGTTAAGCCCTTTGTATTCTGCTGGGTTATGT TTGATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATCTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTTATTGTGTTTTTAA TGGATGGTTTTAAGGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCGACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAACGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGATCTCATTCACTAAAACTAACCATCATATCTGTAAAA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTCATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAGTTCAATAACATCAGCAACCATATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAATTTTCCTGTGGTGTTTAAACTCCTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTGAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGTTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACGCATACCGGTTTGGCTTTCACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCATCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGAGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGTGCGGC GGTGGGATTAGCCGGGAAAGAGAGTGATTTGTTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATCAGCGCGATCGCGTATTGGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKTIFRSDGKAISFTKTNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVNFPVVFKLLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYWIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-100 | 51 |
