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Name : HP0141 (HP0141) Accession : NP_206941.1 Strain : Helicobacter pylori 26695 Genome accession: NC_000915 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease (lctP) Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 152048 - 153703 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : similar to SP:P33231 GB:L13970 PID:404693 PID:466741 GB:U00096 percent identity: 55.49; identified by sequence similarity DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAATTTATGATCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTATT GTTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCGTTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTACGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACCGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCTTTGTATTCTGCCGGGTTATGT TTGATCGCTAATACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCTATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAAGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGTGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCTGGTATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCTTCGTTCACTAAGAGTAACCATCATATTTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTGATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTCTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGTTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACGCATACGGGTTTGGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCCAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC GGTGGGGTTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTGTTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATCAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAVIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-98 | 52 |
